More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4708 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4708  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  100 
 
 		 136 aa  269  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112268  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4720  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  85.38 
 
 		 139 aa  234  4e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.673228  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0387  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  78.63 
 
 		 150 aa  210  5.999999999999999e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0366  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  77.69 
 
 		 138 aa  209  7e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0106  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  77.34 
 
 		 135 aa  207  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4499  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  78.12 
 
 		 139 aa  206  6e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3654  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  76.15 
 
 		 150 aa  206  9e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2663  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  77.52 
 
 		 143 aa  202  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.541261 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  75.78 
 
 		 453 aa  200  4e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14650  protein-tyrosine-phosphatase  73.85 
 
 		 147 aa  197  3e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0791  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  75.97 
 
 		 141 aa  196  7.999999999999999e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0213  protein tyrosine phosphatase  72.66 
 
 		 140 aa  196  9e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0224  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  72.66 
 
 		 135 aa  194  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2325  protein tyrosine phosphatase  73.44 
 
 		 148 aa  194  3e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.752369  normal  0.361606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5424  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  71.32 
 
 		 137 aa  194  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.570672 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2682  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  74.42 
 
 		 141 aa  194  4.0000000000000005e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0214543  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0566  protein tyrosine phosphatase  71.09 
 
 		 136 aa  192  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8606  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  67.69 
 
 		 139 aa  192  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0643215  normal  0.381318 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4498  arsenate reductase (ArsC)  70.31 
 
 		 135 aa  190  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.898204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5379  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  68.7 
 
 		 215 aa  187  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5094  protein tyrosine phosphatase  67.16 
 
 		 225 aa  184  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2811  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  65.91 
 
 		 136 aa  181  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.956828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3425  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  73.23 
 
 		 136 aa  182  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1659  protein tyrosine phosphatase  65.67 
 
 		 225 aa  181  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26450  protein-tyrosine-phosphatase  70.31 
 
 		 294 aa  181  4.0000000000000006e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.288581 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3426  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  66.41 
 
 		 136 aa  180  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328132  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4521  protein tyrosine phosphatase  66.67 
 
 		 217 aa  177  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4904  protein tyrosine phosphatase  66.67 
 
 		 217 aa  177  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4608  protein tyrosine phosphatase  66.67 
 
 		 217 aa  177  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3221  protein tyrosine phosphatase  65.91 
 
 		 223 aa  177  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.779486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1443  protein tyrosine phosphatase  62.88 
 
 		 222 aa  176  8e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1554  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  72.03 
 
 		 138 aa  174  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3468  protein tyrosine phosphatase  65.91 
 
 		 157 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12661  arsenic-transport integral membrane protein arsC  64.84 
 
 		 498 aa  166  7e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000400645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2683  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  62.99 
 
 		 227 aa  154  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0641412  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0792  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  61.42 
 
 		 227 aa  153  7e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1794  protein tyrosine phosphatase  56.69 
 
 		 144 aa  150  4e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.676279 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1447  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  58.59 
 
 		 408 aa  149  8.999999999999999e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.562915  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4721  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  64.8 
 
 		 219 aa  149  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  59.38 
 
 		 337 aa  144  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  57.48 
 
 		 347 aa  135  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1009  protein tyrosine phosphatase  53.03 
 
 		 174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0588  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50.39 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.176284 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  53.49 
 
 		 337 aa  130  5e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  59.06 
 
 		 349 aa  123  9e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14670  protein tyrosine phosphatase  48.06 
 
 		 135 aa  122  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000136299  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1932  protein tyrosine phosphatase  47.01 
 
 		 137 aa  122  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8607  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  52.17 
 
 		 229 aa  120  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0957507  normal  0.40475 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0488  protein tyrosine phosphatase  45.74 
 
 		 132 aa  120  8e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  50.41 
 
 		 336 aa  116  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1110  protein tyrosine phosphatase  44 
 
 		 133 aa  114  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1221  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.45 
 
 		 151 aa  113  6.9999999999999995e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000129127 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0216  protein tyrosine phosphatase  46.15 
 
 		 148 aa  113  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  48.85 
 
 		 139 aa  111  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1656  protein tyrosine phosphatase  45.38 
 
 		 147 aa  110  9e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0413264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  45.32 
 
 		 164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3745  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  40.6 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149548  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4719  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.19 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315914  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1444  protein tyrosine phosphatase  42.11 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.544319 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0834  arsenate reductase ArsC  40.94 
 
 		 132 aa  105  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0765762  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0827  arsenate reductase ArsC  40.94 
 
 		 132 aa  105  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.848042  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.52 
 
 		 143 aa  104  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11640  protein-tyrosine-phosphatase  43.09 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215318  normal  0.181279 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0759  protein tyrosine phosphatase  36.72 
 
 		 134 aa  102  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0575  protein tyrosine phosphatase  39.39 
 
 		 133 aa  103  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238985  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3712  protein tyrosine phosphatase  44.62 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2232  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.75 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  47.5 
 
 		 132 aa  101  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  45.77 
 
 		 142 aa  100  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2364  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.85 
 
 		 143 aa  100  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398521  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0819  radical SAM family protein  42.62 
 
 		 125 aa  100  5e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1811  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.91 
 
 		 140 aa  100  6e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.178186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0500  protein tyrosine phosphatase  41.91 
 
 		 137 aa  100  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0570993  hitchhiker  0.00934247 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2433  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.74 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1477  protein tyrosine phosphatase  36.72 
 
 		 135 aa  98.6  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.334169  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31160  protein-tyrosine-phosphatase  42.86 
 
 		 151 aa  99  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1685  protein tyrosine phosphatase  34.38 
 
 		 135 aa  97.4  5e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.57 
 
 		 152 aa  97.1  7e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2835  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.48 
 
 		 287 aa  96.7  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2431  arsenate reductase  36.92 
 
 		 131 aa  96.7  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0158  arsenate reductase  39.37 
 
 		 134 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3381  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  42.64 
 
 		 130 aa  95.9  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0833218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6302  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.28 
 
 		 142 aa  96.7  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.819229 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0304  arsenate reductase  39.37 
 
 		 134 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0209  arsenate reductase  39.23 
 
 		 132 aa  95.5  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0227  protein tyrosine phosphatase  41.67 
 
 		 137 aa  95.5  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1604  arsenate reductase  39.53 
 
 		 134 aa  95.5  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1151  protein tyrosine phosphatase  34.88 
 
 		 135 aa  95.9  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.734806  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0355  protein tyrosine phosphatase  37.4 
 
 		 137 aa  95.5  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2033  arsenate reductase (thioredoxin)  45.6 
 
 		 132 aa  95.1  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00780291  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20630  protein-tyrosine-phosphatase  40.74 
 
 		 142 aa  94.7  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2722  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  41.86 
 
 		 130 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3324  arsenate reductase  40.3 
 
 		 139 aa  94.4  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  41.98 
 
 		 142 aa  93.6  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3649  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.97 
 
 		 140 aa  93.2  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.58 
 
 		 144 aa  92.8  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3558  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.53 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0091  protein tyrosine phosphatase  43.88 
 
 		 143 aa  92  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0958  protein tyrosine phosphatase  39.06 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>