More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_14650 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_14650  protein-tyrosine-phosphatase  100 
 
 
147 aa  298  2e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0366  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  81.2 
 
 
138 aa  224  4e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3654  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  79.55 
 
 
150 aa  221  3e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0106  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  79.69 
 
 
135 aa  220  6e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0387  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  73.72 
 
 
150 aa  216  7e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0566  protein tyrosine phosphatase  79.69 
 
 
136 aa  215  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282685  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0213  protein tyrosine phosphatase  72.11 
 
 
140 aa  214  5e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2663  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  76.26 
 
 
143 aa  213  5e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.541261 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0791  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  76.74 
 
 
141 aa  211  2.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2682  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  75.19 
 
 
141 aa  209  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0214543  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2325  protein tyrosine phosphatase  73.88 
 
 
148 aa  207  4e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.752369  normal  0.361606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4498  arsenate reductase (ArsC)  74.07 
 
 
135 aa  201  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.898204  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4720  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  71.43 
 
 
139 aa  199  8e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.673228  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0224  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  71.88 
 
 
135 aa  199  8e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4708  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  73.85 
 
 
136 aa  197  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112268  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5424  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  69.7 
 
 
137 aa  195  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.570672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  69.53 
 
 
453 aa  194  4.0000000000000005e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8606  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  67.19 
 
 
139 aa  189  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0643215  normal  0.381318 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5379  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  67.97 
 
 
215 aa  189  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4499  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  66.67 
 
 
139 aa  187  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4904  protein tyrosine phosphatase  65.65 
 
 
217 aa  184  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4521  protein tyrosine phosphatase  65.65 
 
 
217 aa  184  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4608  protein tyrosine phosphatase  65.65 
 
 
217 aa  184  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2811  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  66.92 
 
 
136 aa  184  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.956828  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3426  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  65.41 
 
 
136 aa  184  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328132  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26450  protein-tyrosine-phosphatase  63.91 
 
 
294 aa  182  9e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.288581 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5094  protein tyrosine phosphatase  63.85 
 
 
225 aa  181  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1554  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  71.19 
 
 
138 aa  179  8.000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3425  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  66.93 
 
 
136 aa  179  9.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3221  protein tyrosine phosphatase  64.62 
 
 
223 aa  179  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.779486  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12661  arsenic-transport integral membrane protein arsC  66.41 
 
 
498 aa  177  4.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000400645  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1443  protein tyrosine phosphatase  63.08 
 
 
222 aa  177  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1659  protein tyrosine phosphatase  60.77 
 
 
225 aa  172  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3468  protein tyrosine phosphatase  60.15 
 
 
157 aa  168  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2683  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  64.57 
 
 
227 aa  158  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0641412  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0792  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  62.2 
 
 
227 aa  156  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1447  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  53.91 
 
 
408 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.562915  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  52.94 
 
 
337 aa  144  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  57.48 
 
 
347 aa  140  8e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0588  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  52.38 
 
 
130 aa  139  9e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.176284 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4721  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  57.6 
 
 
219 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1794  protein tyrosine phosphatase  49.21 
 
 
144 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.676279 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1009  protein tyrosine phosphatase  54.26 
 
 
174 aa  137  4.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  53.62 
 
 
349 aa  130  5e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  48.91 
 
 
337 aa  130  5e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1932  protein tyrosine phosphatase  50.78 
 
 
137 aa  130  6e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1221  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.45 
 
 
151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000129127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8607  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50.43 
 
 
229 aa  121  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0957507  normal  0.40475 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14670  protein tyrosine phosphatase  49.22 
 
 
135 aa  120  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000136299  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  50 
 
 
336 aa  119  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0216  protein tyrosine phosphatase  47.69 
 
 
148 aa  118  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3745  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.76 
 
 
147 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149548  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1656  protein tyrosine phosphatase  44.29 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0413264  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0488  protein tyrosine phosphatase  44.53 
 
 
132 aa  113  6.9999999999999995e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4719  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.19 
 
 
140 aa  110  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315914  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1110  protein tyrosine phosphatase  42.97 
 
 
133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0834  arsenate reductase ArsC  43.31 
 
 
132 aa  106  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0765762  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0827  arsenate reductase ArsC  43.31 
 
 
132 aa  106  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.848042  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3712  protein tyrosine phosphatase  47.2 
 
 
131 aa  105  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3332  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  43.85 
 
 
131 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2232  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.58 
 
 
145 aa  104  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2722  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  44.19 
 
 
130 aa  103  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3381  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  44.19 
 
 
130 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0833218  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2364  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.65 
 
 
143 aa  102  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398521  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1811  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.74 
 
 
140 aa  100  7e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.178186  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21340  protein-tyrosine-phosphatase  40.29 
 
 
255 aa  100  8e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0143  arsenate reductase  42.11 
 
 
146 aa  99.8  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.596044  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0759  protein tyrosine phosphatase  38.71 
 
 
134 aa  99.8  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0227  protein tyrosine phosphatase  42.31 
 
 
137 aa  99  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_151  arsenate reductase-like protein  41.67 
 
 
138 aa  99.4  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1151  protein tyrosine phosphatase  37.5 
 
 
135 aa  97.8  5e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.734806  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1477  protein tyrosine phosphatase  37.04 
 
 
135 aa  95.9  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.334169  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1444  protein tyrosine phosphatase  38.35 
 
 
138 aa  95.9  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.544319 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0500  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
137 aa  95.5  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0570993  hitchhiker  0.00934247 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1685  protein tyrosine phosphatase  37.1 
 
 
135 aa  95.9  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11640  protein-tyrosine-phosphatase  40 
 
 
138 aa  95.5  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215318  normal  0.181279 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0666  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  44.19 
 
 
133 aa  94.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  43.85 
 
 
132 aa  95.1  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0575  protein tyrosine phosphatase  40.46 
 
 
133 aa  95.1  3e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238985  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3558  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.07 
 
 
127 aa  94.4  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31160  protein-tyrosine-phosphatase  38.97 
 
 
151 aa  94  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0819  radical SAM family protein  40.32 
 
 
125 aa  93.2  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20630  protein-tyrosine-phosphatase  38.35 
 
 
142 aa  92.4  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  40.3 
 
 
139 aa  92  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  43.94 
 
 
151 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  35.97 
 
 
141 aa  91.7  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.88 
 
 
144 aa  91.3  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3649  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.15 
 
 
140 aa  91.3  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0209  arsenate reductase  40 
 
 
132 aa  90.5  7e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  41.59 
 
 
258 aa  90.5  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1304  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.6 
 
 
133 aa  89.7  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  40.74 
 
 
148 aa  89  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1203  protein tyrosine phosphatase  34.13 
 
 
135 aa  88.2  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3446  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.12 
 
 
150 aa  87.8  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2155  protein tyrosine phosphatase  39.53 
 
 
136 aa  87.8  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.41 
 
 
152 aa  88.2  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2431  arsenate reductase  38.4 
 
 
131 aa  87.8  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  42.25 
 
 
142 aa  87.4  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.81 
 
 
299 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1734  protein tyrosine phosphatase  45.37 
 
 
127 aa  87  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>