More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1656 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1656  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
147 aa  296  7e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0413264  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2232  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  67.94 
 
 
145 aa  186  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4719  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  64.18 
 
 
140 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315914  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0500  protein tyrosine phosphatase  64.62 
 
 
137 aa  161  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0570993  hitchhiker  0.00934247 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20630  protein-tyrosine-phosphatase  58.27 
 
 
142 aa  161  3e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31160  protein-tyrosine-phosphatase  58.52 
 
 
151 aa  156  7e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0216  protein tyrosine phosphatase  59.23 
 
 
148 aa  155  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11640  protein-tyrosine-phosphatase  57.69 
 
 
138 aa  148  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215318  normal  0.181279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3220  protein tyrosine phosphatase  55.07 
 
 
142 aa  148  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1444  protein tyrosine phosphatase  53.49 
 
 
138 aa  144  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.544319 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  48.18 
 
 
453 aa  131  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5379  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  47.45 
 
 
215 aa  129  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4498  arsenate reductase (ArsC)  44.93 
 
 
135 aa  124  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.898204  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0566  protein tyrosine phosphatase  46.72 
 
 
136 aa  122  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282685  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0790  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  49.26 
 
 
136 aa  120  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0366  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.03 
 
 
138 aa  120  7e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2681  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50 
 
 
136 aa  118  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00909873  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2325  protein tyrosine phosphatase  44.93 
 
 
148 aa  118  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.752369  normal  0.361606 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0106  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.8 
 
 
135 aa  118  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2256  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  52.1 
 
 
128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.829785 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2663  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.04 
 
 
143 aa  117  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.541261 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3426  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  43.48 
 
 
136 aa  116  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328132  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3468  protein tyrosine phosphatase  44.27 
 
 
157 aa  115  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2811  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  44.2 
 
 
136 aa  115  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.956828  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14650  protein-tyrosine-phosphatase  44.29 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4720  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.34 
 
 
139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.673228  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3221  protein tyrosine phosphatase  42.42 
 
 
223 aa  113  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.779486  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12661  arsenic-transport integral membrane protein arsC  43.38 
 
 
498 aa  113  7.999999999999999e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000400645  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1443  protein tyrosine phosphatase  42.75 
 
 
222 aa  113  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0791  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.54 
 
 
141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0213  protein tyrosine phosphatase  41.91 
 
 
140 aa  112  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3654  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.51 
 
 
150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1447  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  40 
 
 
408 aa  110  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.562915  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0387  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.86 
 
 
150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2682  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.91 
 
 
141 aa  110  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0214543  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4708  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.38 
 
 
136 aa  110  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112268  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0224  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.3 
 
 
135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3425  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.28 
 
 
136 aa  108  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4499  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.91 
 
 
139 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4521  protein tyrosine phosphatase  43.85 
 
 
217 aa  107  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4608  protein tyrosine phosphatase  43.85 
 
 
217 aa  107  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4904  protein tyrosine phosphatase  43.85 
 
 
217 aa  107  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5424  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.98 
 
 
137 aa  107  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.570672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8606  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.69 
 
 
139 aa  103  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0643215  normal  0.381318 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1794  protein tyrosine phosphatase  42.64 
 
 
144 aa  103  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.676279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5094  protein tyrosine phosphatase  40.44 
 
 
225 aa  101  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1659  protein tyrosine phosphatase  38.93 
 
 
225 aa  100  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1554  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  43.7 
 
 
138 aa  100  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26450  protein-tyrosine-phosphatase  41.22 
 
 
294 aa  100  7e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.288581 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  39.72 
 
 
347 aa  98.2  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  40.46 
 
 
337 aa  98.2  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1932  protein tyrosine phosphatase  40.15 
 
 
137 aa  93.6  8e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1009  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
174 aa  92.8  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14670  protein tyrosine phosphatase  39.13 
 
 
135 aa  93.2  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000136299  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2683  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.64 
 
 
227 aa  88.2  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0641412  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  41.96 
 
 
336 aa  87.4  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  38.35 
 
 
337 aa  87.4  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0792  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.69 
 
 
227 aa  86.7  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  39.13 
 
 
150 aa  86.7  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3324  arsenate reductase  39.13 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  38.41 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0588  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.33 
 
 
130 aa  82.4  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.176284 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  39.86 
 
 
349 aa  82.4  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.48 
 
 
140 aa  82  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4721  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.72 
 
 
219 aa  82  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1221  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.76 
 
 
151 aa  80.9  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000129127 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0575  protein tyrosine phosphatase  31.34 
 
 
133 aa  80.9  0.000000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238985  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.5 
 
 
143 aa  80.5  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2431  arsenate reductase  36.22 
 
 
131 aa  80.5  0.000000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3671  protein tyrosine phosphatase  36.62 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.724528  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0820  protein tyrosine phosphatase  37.06 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.580395  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  35.51 
 
 
151 aa  79  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  36.3 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0488  protein tyrosine phosphatase  32.58 
 
 
132 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  34.06 
 
 
141 aa  79.3  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  41.32 
 
 
132 aa  77.8  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_151  arsenate reductase-like protein  34.56 
 
 
138 aa  77.4  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  35.34 
 
 
143 aa  77  0.00000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  32.19 
 
 
145 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1210  arsenate reductase (thioredoxin)  35.61 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  40.48 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3745  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  34.04 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149548  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  33.09 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2769  protein tyrosine phosphatase  34.85 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1110  protein tyrosine phosphatase  32.33 
 
 
133 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2105  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  38.39 
 
 
588 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00514129  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  34.33 
 
 
164 aa  74.7  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2022  protein tyrosine phosphatase  38.3 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.571189  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2919  arsenate reductase  33.09 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0465  protein tyrosine phosphatase  36.69 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000366362  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8607  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.83 
 
 
229 aa  73.6  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0957507  normal  0.40475 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.45 
 
 
138 aa  72.8  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.56 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6302  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.5 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.819229 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3221  arsenate reductase  34.56 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3207  arsenate reductase  34.56 
 
 
134 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468162  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3201  arsenate reductase  34.56 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21340  protein-tyrosine-phosphatase  35.11 
 
 
255 aa  71.6  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2971  arsenate reductase  34.56 
 
 
134 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000815636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>