More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2022 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2022  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 142 aa  294  3e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.571189  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0465  protein tyrosine phosphatase  82.98 
 
 		 142 aa  244  4e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000366362  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1473  protein tyrosine phosphatase  74.47 
 
 		 142 aa  227  5e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0397  protein tyrosine phosphatase  72.34 
 
 		 142 aa  226  1e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1118  protein tyrosine phosphatase  71.64 
 
 		 144 aa  197  3e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1703  protein tyrosine phosphatase  70.9 
 
 		 145 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3671  protein tyrosine phosphatase  54.81 
 
 		 144 aa  137  6e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.724528  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  57.94 
 
 		 138 aa  136  7.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  52.34 
 
 		 152 aa  132  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  50.35 
 
 		 144 aa  130  7.999999999999999e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  48.91 
 
 		 151 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  53.91 
 
 		 138 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  48.92 
 
 		 150 aa  127  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.18 
 
 		 139 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2881  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 		 145 aa  126  9.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  53.68 
 
 		 138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3324  arsenate reductase  52.99 
 
 		 139 aa  124  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2571  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  49.61 
 
 		 137 aa  123  7e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  49.64 
 
 		 148 aa  123  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508591  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  44.78 
 
 		 138 aa  120  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0918  protein tyrosine phosphatase  52.67 
 
 		 144 aa  119  9e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0874  protein tyrosine phosphatase  51.97 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0764045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  49.61 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  49.61 
 
 		 140 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  51.56 
 
 		 140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2820  protein tyrosine phosphatase  51.15 
 
 		 143 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.59 
 
 		 141 aa  118  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164667  normal  0.499641 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  45.93 
 
 		 145 aa  117  7e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.86 
 
 		 137 aa  116  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  48.87 
 
 		 139 aa  116  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2953  arsenate reductase  48.44 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  42.76 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  46.46 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1210  arsenate reductase (thioredoxin)  47.76 
 
 		 144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  48.18 
 
 		 164 aa  114  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1644  protein tyrosine phosphatase  47.69 
 
 		 144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.644428 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0848  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.12 
 
 		 137 aa  113  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0909  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.12 
 
 		 137 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.101664 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2793  protein tyrosine phosphatase  45.8 
 
 		 144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.31 
 
 		 143 aa  110  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1911  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50.39 
 
 		 139 aa  110  9e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000024584  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  46.21 
 
 		 258 aa  108  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1440  protein tyrosine phosphatase  45.39 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0575  protein tyrosine phosphatase  39.01 
 
 		 133 aa  107  8.000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238985  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2033  arsenate reductase (thioredoxin)  48.09 
 
 		 132 aa  106  9.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00780291  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  37.32 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2770  protein tyrosine phosphatase  44.96 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1734  protein tyrosine phosphatase  45.08 
 
 		 127 aa  104  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  49.15 
 
 		 258 aa  103  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3601  protein tyrosine phosphatase  44.27 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.458199 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2539  transcriptional regulator, ArsR family  45.74 
 
 		 254 aa  101  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A11  protein-tyrosine-phosphatase  42.52 
 
 		 138 aa  102  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.195973  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  46.09 
 
 		 151 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.85 
 
 		 146 aa  100  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0091  protein tyrosine phosphatase  45.52 
 
 		 143 aa  100  7e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1425  protein tyrosine phosphatase  42.64 
 
 		 141 aa  100  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0826  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  42.96 
 
 		 154 aa  98.2  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2712  protein tyrosine phosphatase  46.62 
 
 		 140 aa  98.6  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  39.01 
 
 		 154 aa  97.4  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2919  arsenate reductase  42.54 
 
 		 148 aa  97.4  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  42.86 
 
 		 142 aa  96.7  9e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1414  protein tyrosine phosphatase  37.41 
 
 		 145 aa  96.3  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2062  arsenate reductase  44.03 
 
 		 134 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3201  arsenate reductase  44.03 
 
 		 134 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3221  arsenate reductase  44.03 
 
 		 134 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3207  arsenate reductase  43.28 
 
 		 134 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468162  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2141  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.04 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0054  protein tyrosine phosphatase  41.09 
 
 		 146 aa  95.1  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0158  arsenate reductase  43.28 
 
 		 134 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0314  arsenate reductase  38.17 
 
 		 132 aa  94.4  4e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0304  arsenate reductase  43.28 
 
 		 134 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2898  arsenate reductase  43.28 
 
 		 134 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.871154  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1452  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.3 
 
 		 157 aa  94  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00327918  normal  0.121343 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  41.61 
 
 		 142 aa  94  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1604  arsenate reductase  44.78 
 
 		 134 aa  94  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0820  protein tyrosine phosphatase  38.73 
 
 		 150 aa  94  6e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.580395  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2105  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  44.63 
 
 		 588 aa  93.6  8e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00514129  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2431  arsenate reductase  40.3 
 
 		 131 aa  92.8  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2971  arsenate reductase  43.28 
 
 		 134 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000815636  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1112  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.55 
 
 		 153 aa  93.2  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.988044  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3196  arsenate reductase  43.28 
 
 		 134 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.9959  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  42.97 
 
 		 299 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.97 
 
 		 299 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1707  arsenate reductase  38.06 
 
 		 134 aa  93.2  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0993958  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.86 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2963  arsenate reductase  43.28 
 
 		 134 aa  92  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.341383  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 284 aa  92  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2189  arsenate reductase  43.28 
 
 		 158 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0207  protein tyrosine phosphatase  41.3 
 
 		 173 aa  92  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.538928 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1780  protein tyrosine phosphatase  39.42 
 
 		 154 aa  92  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0180876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2123  arsenate reductase  43.28 
 
 		 158 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020679  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0526  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 276 aa  91.7  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.107472 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5673  protein tyrosine phosphatase  38.03 
 
 		 164 aa  91.3  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5377  protein tyrosine phosphatase  42.34 
 
 		 173 aa  90.9  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3054  protein tyrosine phosphatase  43.9 
 
 		 165 aa  90.5  7e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2828  hypothetical protein  44.27 
 
 		 165 aa  90.1  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3119  protein tyrosine phosphatase  37.93 
 
 		 168 aa  89.4  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5147  protein tyrosine phosphatase  37.12 
 
 		 156 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 255 aa  89.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3330  ArsR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 257 aa  89.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>