More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3119 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3119  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 168 aa  345  1e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3826  protein tyrosine phosphatase  76.65 
 
 		 167 aa  261  4e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.248837 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  76.65 
 
 		 167 aa  261  4e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.117198 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6164  protein tyrosine phosphatase  76.19 
 
 		 164 aa  259  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.398136 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3255  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  76.65 
 
 		 172 aa  258  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5346  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  76.05 
 
 		 164 aa  258  3e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.524005 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4215  protein tyrosine phosphatase  76.05 
 
 		 164 aa  257  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3579  protein tyrosine phosphatase  75.6 
 
 		 164 aa  256  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.747703 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6562  protein tyrosine phosphatase  73.81 
 
 		 168 aa  255  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4965  protein tyrosine phosphatase  74.4 
 
 		 172 aa  255  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219963  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3195  protein tyrosine phosphatase  74.4 
 
 		 172 aa  255  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5708  protein tyrosine phosphatase  75 
 
 		 164 aa  255  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5600  protein tyrosine phosphatase  73.81 
 
 		 164 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1820  protein tyrosine phosphatase  74.25 
 
 		 164 aa  252  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.102898 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5673  protein tyrosine phosphatase  73.21 
 
 		 164 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0558  arsenate reductase  72.62 
 
 		 164 aa  248  3e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0569825  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0913  arsenate reductase  72.62 
 
 		 164 aa  248  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.910789  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1882  arsenate reductase  72.62 
 
 		 164 aa  248  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0959  arsenate reductase  72.02 
 
 		 164 aa  248  4e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6329  protein tyrosine phosphatase  72.02 
 
 		 164 aa  247  5e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720558  normal  0.0816451 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0456  arsenate reductase  72.02 
 
 		 164 aa  246  9e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1942  arsenate reductase ArsC  72.02 
 
 		 164 aa  246  9e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2037  arsenate reductase ArsC  72.02 
 
 		 164 aa  246  9e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1128  putative arsenate reductase (arsenical PUMP modifier) protein  72.62 
 
 		 164 aa  245  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5765  protein tyrosine phosphatase  76.79 
 
 		 164 aa  240  7e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5345  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  51.5 
 
 		 164 aa  161  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807351  normal  0.94085 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  49.4 
 
 		 164 aa  159  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3054  protein tyrosine phosphatase  48.47 
 
 		 165 aa  156  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5707  protein tyrosine phosphatase  46.95 
 
 		 164 aa  149  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1583  arsenate reductase  46.63 
 
 		 164 aa  149  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1387  arsenate reductase, putative  46.71 
 
 		 165 aa  149  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782064  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4381  protein tyrosine phosphatase  48.24 
 
 		 171 aa  149  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5674  protein tyrosine phosphatase  46.34 
 
 		 164 aa  148  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2828  hypothetical protein  45.03 
 
 		 165 aa  147  9e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3466  protein tyrosine phosphatase  47.85 
 
 		 168 aa  145  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0331  protein tyrosine phosphatase  46.11 
 
 		 170 aa  145  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.481618 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5377  protein tyrosine phosphatase  45.4 
 
 		 173 aa  144  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6165  protein tyrosine phosphatase  49.4 
 
 		 164 aa  143  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.237527 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0489  protein tyrosine phosphatase  45.78 
 
 		 165 aa  142  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1443  protein tyrosine phosphatase  43.98 
 
 		 171 aa  142  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.907401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2345  arsenate reductase, putative  45.51 
 
 		 165 aa  141  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2317  protein tyrosine phosphatase  45.88 
 
 		 162 aa  141  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0652  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.91 
 
 		 165 aa  140  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0644228 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2588  protein tyrosine phosphatase  47.47 
 
 		 167 aa  140  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.570758  normal  0.260615 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  45.73 
 
 		 298 aa  140  7e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2640  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  46.06 
 
 		 168 aa  140  8e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.261916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3124  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  46.39 
 
 		 180 aa  140  9e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.641523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1047  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.58 
 
 		 175 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2516  protein tyrosine phosphatase  44.97 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.69896  hitchhiker  0.0073525 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5056  protein tyrosine phosphatase  45.18 
 
 		 175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2415  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.17 
 
 		 176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.214614 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2216  protein tyrosine phosphatase  48.1 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.415752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0207  protein tyrosine phosphatase  44.31 
 
 		 173 aa  137  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.538928 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1281  protein tyrosine phosphatase  43.37 
 
 		 164 aa  136  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1344  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.38 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.230877  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1787  protein tyrosine phosphatase  45.24 
 
 		 179 aa  136  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00981569 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30690  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  43.71 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4054  protein tyrosine phosphatase  43.29 
 
 		 175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4199  protein tyrosine phosphatase  43.9 
 
 		 169 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.56112  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1909  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  44.51 
 
 		 175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0699  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  46.84 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3200  protein tyrosine phosphatase  42.42 
 
 		 182 aa  133  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3397  protein tyrosine phosphatase  44.58 
 
 		 174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0875  protein tyrosine phosphatase  44.51 
 
 		 189 aa  132  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 317 aa  132  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2540  protein tyrosine phosphatase  42.68 
 
 		 179 aa  132  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.232269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1980  protein tyrosine phosphatase  47.62 
 
 		 163 aa  132  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221335  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  44.51 
 
 		 291 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1928  arsenate reductase  43.83 
 
 		 162 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.245596  unclonable  0.00000025949 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0325  protein tyrosine phosphatase  44.24 
 
 		 175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4073  protein tyrosine phosphatase  43.64 
 
 		 175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00713797  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1579  protein tyrosine phosphatase  43.31 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  45.12 
 
 		 287 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00628  arsenate reductase  45.24 
 
 		 176 aa  128  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.102158  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3780  protein tyrosine phosphatase  46.58 
 
 		 167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0223758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1984  protein tyrosine phosphatase  41.57 
 
 		 177 aa  127  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565539  normal  0.702205 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5682  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.29 
 
 		 175 aa  127  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.99461  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5722  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.29 
 
 		 175 aa  127  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5147  protein tyrosine phosphatase  45.68 
 
 		 156 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3341  arsenate reductase  43.03 
 
 		 317 aa  127  8.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2962  arsenate reductase  45.68 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2139  protein tyrosine phosphatase  43.83 
 
 		 179 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0618  protein tyrosine phosphatase  43.98 
 
 		 175 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0653  protein tyrosine phosphatase  47.8 
 
 		 168 aa  125  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.448039  normal  0.447799 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35100  arsenate reductase  45.68 
 
 		 156 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3419  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  43.03 
 
 		 175 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0585  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  40.49 
 
 		 177 aa  122  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5577  protein tyrosine phosphatase  42.33 
 
 		 175 aa  122  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.163475 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3079  protein tyrosine phosphatase  42.59 
 
 		 156 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0583142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0216  protein tyrosine phosphatase  42.42 
 
 		 178 aa  121  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1502  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  45.06 
 
 		 156 aa  121  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.240975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3036  protein tyrosine phosphatase  45.06 
 
 		 156 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294827  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2716  arsenate reductase  45.06 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  40.61 
 
 		 270 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0526  ArsR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 276 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.107472 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3958  protein tyrosine phosphatase  37.8 
 
 		 295 aa  117  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.387678 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2398  protein tyrosine phosphatase  43.83 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798695 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03334  arsenate reductase  46.62 
 
 		 128 aa  117  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 270 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2966  protein tyrosine phosphatase  35.37 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.770903 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>