More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0207 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0207  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
173 aa  364  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.538928 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0331  protein tyrosine phosphatase  79.41 
 
 
170 aa  298  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.481618 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5377  protein tyrosine phosphatase  68.21 
 
 
173 aa  261  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1443  protein tyrosine phosphatase  62.5 
 
 
171 aa  213  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.907401  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4199  protein tyrosine phosphatase  56.29 
 
 
169 aa  211  3.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.56112  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0618  protein tyrosine phosphatase  59.51 
 
 
175 aa  209  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  57.67 
 
 
291 aa  209  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0652  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  57.67 
 
 
165 aa  207  8e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0644228 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0489  protein tyrosine phosphatase  55.83 
 
 
165 aa  206  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1387  arsenate reductase, putative  59.26 
 
 
165 aa  206  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782064  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30690  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  57.32 
 
 
164 aa  204  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0325  protein tyrosine phosphatase  56.44 
 
 
175 aa  204  6e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5674  protein tyrosine phosphatase  57.32 
 
 
164 aa  203  9e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0875  protein tyrosine phosphatase  57.86 
 
 
189 aa  202  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1047  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  58.28 
 
 
175 aa  202  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5345  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  57.93 
 
 
164 aa  202  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807351  normal  0.94085 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2345  arsenate reductase, putative  55.83 
 
 
165 aa  202  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4073  protein tyrosine phosphatase  56.44 
 
 
175 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00713797  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2139  protein tyrosine phosphatase  57.14 
 
 
179 aa  202  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3054  protein tyrosine phosphatase  57.32 
 
 
165 aa  201  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3200  protein tyrosine phosphatase  54.32 
 
 
182 aa  201  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  55.21 
 
 
317 aa  200  7e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1909  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  57.06 
 
 
175 aa  200  9e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5577  protein tyrosine phosphatase  55.29 
 
 
175 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.163475 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5707  protein tyrosine phosphatase  56.71 
 
 
164 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.598358  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2317  protein tyrosine phosphatase  56.25 
 
 
162 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29117  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2828  hypothetical protein  54.6 
 
 
165 aa  198  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1281  protein tyrosine phosphatase  54.27 
 
 
164 aa  197  9e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395414  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3124  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  55.9 
 
 
180 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.641523  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4054  protein tyrosine phosphatase  55.83 
 
 
175 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  53.01 
 
 
298 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00628  arsenate reductase  55 
 
 
176 aa  196  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.102158  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  55.49 
 
 
164 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2540  protein tyrosine phosphatase  53.29 
 
 
179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.232269  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2415  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  54.37 
 
 
176 aa  195  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.214614 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5056  protein tyrosine phosphatase  53.37 
 
 
175 aa  194  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3419  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  55.56 
 
 
175 aa  194  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1787  protein tyrosine phosphatase  54.82 
 
 
179 aa  192  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00981569 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1583  arsenate reductase  54.27 
 
 
164 aa  193  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3958  protein tyrosine phosphatase  52.47 
 
 
295 aa  191  6e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.387678 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1984  protein tyrosine phosphatase  52.83 
 
 
177 aa  188  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565539  normal  0.702205 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6165  protein tyrosine phosphatase  56.1 
 
 
164 aa  186  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.237527 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3341  arsenate reductase  50.6 
 
 
317 aa  183  9e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1579  protein tyrosine phosphatase  56.46 
 
 
159 aa  179  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0216  protein tyrosine phosphatase  53.12 
 
 
178 aa  180  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  52.17 
 
 
270 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0699  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  55.06 
 
 
164 aa  178  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4381  protein tyrosine phosphatase  54.22 
 
 
171 aa  176  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2640  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  49.42 
 
 
168 aa  175  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.261916  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  50.91 
 
 
287 aa  174  8e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5682  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50 
 
 
175 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.99461  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5722  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50 
 
 
175 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2588  protein tyrosine phosphatase  50.31 
 
 
167 aa  171  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.570758  normal  0.260615 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  50.31 
 
 
270 aa  170  9e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2216  protein tyrosine phosphatase  50.91 
 
 
166 aa  170  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.415752  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3826  protein tyrosine phosphatase  50.9 
 
 
167 aa  168  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.248837 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50.9 
 
 
167 aa  168  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.117198 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1344  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  49.69 
 
 
165 aa  165  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.230877  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2516  protein tyrosine phosphatase  49.07 
 
 
165 aa  163  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.69896  hitchhiker  0.0073525 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1532  transcriptional regulator, ArsR family  47.85 
 
 
306 aa  160  7e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1641  protein tyrosine phosphatase  46.84 
 
 
309 aa  160  9e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5346  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  49.69 
 
 
164 aa  159  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.524005 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3255  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.81 
 
 
172 aa  157  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5673  protein tyrosine phosphatase  47.53 
 
 
164 aa  157  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1820  protein tyrosine phosphatase  47.85 
 
 
164 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.102898 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3579  protein tyrosine phosphatase  49.09 
 
 
164 aa  155  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.747703 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0653  protein tyrosine phosphatase  48.75 
 
 
168 aa  155  3e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.448039  normal  0.447799 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3466  protein tyrosine phosphatase  44.17 
 
 
168 aa  154  6e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6164  protein tyrosine phosphatase  46.63 
 
 
164 aa  154  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.398136 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1128  putative arsenate reductase (arsenical PUMP modifier) protein  51.68 
 
 
164 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4215  protein tyrosine phosphatase  46.63 
 
 
164 aa  151  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0585  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  53.68 
 
 
177 aa  150  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0959  arsenate reductase  46.63 
 
 
164 aa  149  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0526  ArsR family transcriptional regulator  43.83 
 
 
276 aa  148  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.107472 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6562  protein tyrosine phosphatase  46.01 
 
 
168 aa  148  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5600  protein tyrosine phosphatase  44.79 
 
 
164 aa  147  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123028  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1594  protein tyrosine phosphatase  50.74 
 
 
167 aa  147  7e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2966  protein tyrosine phosphatase  39.75 
 
 
165 aa  147  7e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.770903 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6329  protein tyrosine phosphatase  45.62 
 
 
164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720558  normal  0.0816451 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5708  protein tyrosine phosphatase  46.01 
 
 
164 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4965  protein tyrosine phosphatase  48.63 
 
 
172 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219963  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3195  protein tyrosine phosphatase  48.63 
 
 
172 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4667  protein tyrosine phosphatase  42.33 
 
 
167 aa  144  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4774  protein tyrosine phosphatase  42.33 
 
 
167 aa  144  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2337  protein tyrosine phosphatase  47.47 
 
 
167 aa  144  6e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.441606 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5765  protein tyrosine phosphatase  48.77 
 
 
164 aa  143  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0456  arsenate reductase  50 
 
 
164 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1942  arsenate reductase ArsC  50 
 
 
164 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2037  arsenate reductase ArsC  50 
 
 
164 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0558  arsenate reductase  50 
 
 
164 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0569825  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0913  arsenate reductase  50 
 
 
164 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.910789  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1882  arsenate reductase  50 
 
 
164 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3119  protein tyrosine phosphatase  44.31 
 
 
168 aa  137  6e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  47.8 
 
 
284 aa  137  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2123  arsenate reductase  47.17 
 
 
158 aa  137  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020679  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2141  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.73 
 
 
159 aa  137  7e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3666  protein tyrosine phosphatase  48.68 
 
 
160 aa  136  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1980  protein tyrosine phosphatase  48.23 
 
 
163 aa  136  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221335  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2189  arsenate reductase  46.54 
 
 
158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3397  protein tyrosine phosphatase  41.25 
 
 
174 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>