More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1641 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1641  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 309 aa  634    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  42.49 
 
 		 291 aa  240  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  44 
 
 		 287 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  43.51 
 
 		 298 aa  229  4e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3958  protein tyrosine phosphatase  43.84 
 
 		 295 aa  221  9e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.387678 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0526  ArsR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 276 aa  211  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.107472 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 270 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  40.88 
 
 		 270 aa  202  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 317 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 284 aa  181  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1387  arsenate reductase, putative  51.57 
 
 		 165 aa  171  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782064  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4199  protein tyrosine phosphatase  49.04 
 
 		 169 aa  169  8e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.56112  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0331  protein tyrosine phosphatase  49.37 
 
 		 170 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.481618 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2828  hypothetical protein  51.59 
 
 		 165 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2540  protein tyrosine phosphatase  48.72 
 
 		 179 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.232269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1787  protein tyrosine phosphatase  44.85 
 
 		 179 aa  162  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00981569 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0207  protein tyrosine phosphatase  46.84 
 
 		 173 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.538928 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3341  arsenate reductase  49.04 
 
 		 317 aa  159  5e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5377  protein tyrosine phosphatase  45.57 
 
 		 173 aa  158  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3200  protein tyrosine phosphatase  42.94 
 
 		 182 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1909  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  47.5 
 
 		 175 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1443  protein tyrosine phosphatase  46.5 
 
 		 171 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.907401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0875  protein tyrosine phosphatase  46.5 
 
 		 189 aa  157  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30690  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  45.86 
 
 		 164 aa  155  8e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1047  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.88 
 
 		 175 aa  155  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2415  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.4 
 
 		 176 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.214614 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4054  protein tyrosine phosphatase  46.25 
 
 		 175 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2588  protein tyrosine phosphatase  47.71 
 
 		 167 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.570758  normal  0.260615 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5056  protein tyrosine phosphatase  46.5 
 
 		 175 aa  152  7e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1281  protein tyrosine phosphatase  45.22 
 
 		 164 aa  151  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0489  protein tyrosine phosphatase  43.31 
 
 		 165 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3124  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  44.38 
 
 		 180 aa  151  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.641523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2139  protein tyrosine phosphatase  44.87 
 
 		 179 aa  151  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2345  arsenate reductase, putative  45.86 
 
 		 165 aa  150  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2317  protein tyrosine phosphatase  45.86 
 
 		 162 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0618  protein tyrosine phosphatase  44.38 
 
 		 175 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0325  protein tyrosine phosphatase  43.95 
 
 		 175 aa  149  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0216  protein tyrosine phosphatase  45 
 
 		 178 aa  149  8e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3419  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  44.03 
 
 		 175 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5674  protein tyrosine phosphatase  41.4 
 
 		 164 aa  146  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5722  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.2 
 
 		 175 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1579  protein tyrosine phosphatase  42 
 
 		 159 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5682  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.2 
 
 		 175 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.99461  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00628  arsenate reductase  43.95 
 
 		 176 aa  145  7.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.102158  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0652  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.04 
 
 		 165 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0644228 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3054  protein tyrosine phosphatase  44.87 
 
 		 165 aa  145  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1344  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.21 
 
 		 165 aa  143  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.230877  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5577  protein tyrosine phosphatase  44.59 
 
 		 175 aa  143  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.163475 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1583  arsenate reductase  41.4 
 
 		 164 aa  142  6e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4073  protein tyrosine phosphatase  43.12 
 
 		 175 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00713797  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2966  protein tyrosine phosphatase  42.04 
 
 		 165 aa  142  9e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.770903 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2516  protein tyrosine phosphatase  42.59 
 
 		 165 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.69896  hitchhiker  0.0073525 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5345  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.68 
 
 		 164 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807351  normal  0.94085 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  42.68 
 
 		 164 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5707  protein tyrosine phosphatase  39.49 
 
 		 164 aa  139  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2216  protein tyrosine phosphatase  42.86 
 
 		 166 aa  139  7.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.415752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4381  protein tyrosine phosphatase  49.04 
 
 		 171 aa  139  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1984  protein tyrosine phosphatase  44.03 
 
 		 177 aa  137  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565539  normal  0.702205 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3466  protein tyrosine phosphatase  42.04 
 
 		 168 aa  134  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6165  protein tyrosine phosphatase  42.04 
 
 		 164 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.237527 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2640  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.14 
 
 		 168 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.261916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1532  transcriptional regulator, ArsR family  31.49 
 
 		 306 aa  130  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0653  protein tyrosine phosphatase  42.95 
 
 		 168 aa  130  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.448039  normal  0.447799 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0699  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.61 
 
 		 164 aa  123  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4774  protein tyrosine phosphatase  39.87 
 
 		 167 aa  122  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4667  protein tyrosine phosphatase  39.87 
 
 		 167 aa  122  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1594  protein tyrosine phosphatase  39.38 
 
 		 167 aa  122  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2337  protein tyrosine phosphatase  41.36 
 
 		 167 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.441606 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2141  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.88 
 
 		 159 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1980  protein tyrosine phosphatase  42.14 
 
 		 163 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221335  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0585  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.3 
 
 		 177 aa  115  7.999999999999999e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.61 
 
 		 167 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.117198 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3826  protein tyrosine phosphatase  38.61 
 
 		 167 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.248837 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5147  protein tyrosine phosphatase  41.03 
 
 		 156 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2244  ArsR family transcriptional regulator  52.43 
 
 		 110 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.908668  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0952  ArsR family transcriptional regulator  48.6 
 
 		 124 aa  110  3e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1502  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.42 
 
 		 156 aa  109  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.240975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1466  ArsR family transcriptional regulator  49.5 
 
 		 129 aa  107  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0101  regulatory protein ArsR  53.27 
 
 		 114 aa  106  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2123  arsenate reductase  36.88 
 
 		 158 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020679  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2398  protein tyrosine phosphatase  39.61 
 
 		 156 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798695 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4198  ArsR family transcriptional regulator  55.32 
 
 		 124 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4425  ArsR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 155 aa  104  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5673  protein tyrosine phosphatase  38.36 
 
 		 164 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25910  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.94 
 
 		 156 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3079  protein tyrosine phosphatase  38.71 
 
 		 156 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0583142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5578  ArsR family transcriptional regulator  48.04 
 
 		 111 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.151543 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4074  transcriptional regulator, ArsR family  48.11 
 
 		 118 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00570943  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2533  transcriptional regulator, ArsR family  52.04 
 
 		 120 aa  103  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0619  ArsR family transcriptional regulator  48.6 
 
 		 113 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3579  protein tyrosine phosphatase  36.25 
 
 		 164 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.747703 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5702  protein tyrosine phosphatase  38.89 
 
 		 173 aa  102  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947024  normal  0.758266 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6329  protein tyrosine phosphatase  36.48 
 
 		 164 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720558  normal  0.0816451 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2189  arsenate reductase  36.25 
 
 		 158 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1820  protein tyrosine phosphatase  36.08 
 
 		 164 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.102898 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1017  protein tyrosine phosphatase  40.28 
 
 		 174 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.246391  normal  0.0984563 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4215  protein tyrosine phosphatase  37.11 
 
 		 164 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0326  ArsR family transcriptional regulator  53.27 
 
 		 123 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5600  protein tyrosine phosphatase  35.85 
 
 		 164 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5346  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.08 
 
 		 164 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.524005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>