More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5578 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5578  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 111 aa  222  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.151543 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0619  ArsR family transcriptional regulator  69.23 
 
 		 113 aa  155  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2140  ArsR family transcriptional regulator  67.62 
 
 		 117 aa  153  7e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2244  ArsR family transcriptional regulator  66.34 
 
 		 110 aa  147  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.908668  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4198  ArsR family transcriptional regulator  61.9 
 
 		 124 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  66.36 
 
 		 291 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4074  transcriptional regulator, ArsR family  62.5 
 
 		 118 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00570943  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3420  regulatory protein, ArsR  69.23 
 
 		 131 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2533  transcriptional regulator, ArsR family  64.71 
 
 		 120 aa  140  6e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1466  ArsR family transcriptional regulator  60.95 
 
 		 129 aa  135  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0952  ArsR family transcriptional regulator  58.72 
 
 		 124 aa  134  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0326  ArsR family transcriptional regulator  64.08 
 
 		 123 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5057  regulatory protein ArsR  63.16 
 
 		 116 aa  134  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1970  ArsR family transcriptional regulator ArsR1  62.26 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0101  regulatory protein ArsR  63.27 
 
 		 114 aa  131  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2246  ArsR family transcriptional regulator  63.74 
 
 		 115 aa  127  7.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.362013  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4425  ArsR family transcriptional regulator  56.04 
 
 		 155 aa  115  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2403  ArsR family transcriptional regulator  52 
 
 		 109 aa  108  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0656384  normal  0.0239718 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2414  transcriptional regulator, ArsR family  47.22 
 
 		 118 aa  103  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.203968 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1641  protein tyrosine phosphatase  48.04 
 
 		 309 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3855  regulatory protein, ArsR  48.51 
 
 		 110 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3125  ArsR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 110 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1788  ArsR family transcriptional regulator  51.55 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0212653 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5721  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.12 
 
 		 119 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3123  ArsR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 120 aa  101  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.550975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0522  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 119 aa  100  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226567 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0697  transcriptional regulator, ArsR family  46.85 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.729608 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2541  ArsR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 117 aa  98.2  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2099  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 110 aa  97.1  7e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.321507  normal  0.577048 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6064  transcriptional regulator ArsR family  46.23 
 
 		 123 aa  97.1  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1378  ArsR family transcriptional regulator  47.96 
 
 		 118 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0219707 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2339  ArsR family transcriptional regulator  51.09 
 
 		 114 aa  92.4  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.479129  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3342  regulatory protein, ArsR  44.86 
 
 		 120 aa  91.7  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3468  ArsR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 114 aa  90.9  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1046  putative transcriptional regulator, ArsR family  45 
 
 		 119 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4216  ArsR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 115 aa  90.5  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3136  regulatory protein, ArsR  45.19 
 
 		 119 aa  90.1  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.651925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0217  regulatory protein, ArsR  42.99 
 
 		 120 aa  90.1  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1406  regulatory protein, ArsR  50 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0333  ArsR family transcriptional regulator  50.59 
 
 		 109 aa  88.2  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4966  ArsR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 111 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602085  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3194  ArsR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 111 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2730  ArsR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 108 aa  88.2  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.636967  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0961  arsenical resistance transcriptional regulator  44.04 
 
 		 111 aa  87.8  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1388  regulatory protein, ArsR  47.92 
 
 		 108 aa  88.2  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.434154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3201  regulatory protein ArsR  40.57 
 
 		 119 aa  88.2  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05830  transcriptional regulator, ArsR family  44.19 
 
 		 92 aa  87.8  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.16233  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6561  ArsR family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 111 aa  87.4  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5681  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.12 
 
 		 119 aa  87  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.825179  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1908  regulatory protein ArsR  46.94 
 
 		 120 aa  87  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6167  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 111 aa  86.3  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.235116 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0560  arsenical resistance transcriptional regulator  47.83 
 
 		 111 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0253311  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0911  arsenical resistance transcriptional regulator  47.83 
 
 		 123 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  45.36 
 
 		 287 aa  86.3  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2159  transcriptional regulator, ArsR family  47.19 
 
 		 131 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679753  normal  0.522465 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0454  arsenical resistance transcriptional regulator  47.31 
 
 		 244 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17354  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1940  ArsR family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 227 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.714922  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0166  regulatory protein, ArsR  44.44 
 
 		 113 aa  85.5  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.698937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2035  ArsR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 123 aa  84.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5601  ArsR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  46.07 
 
 		 298 aa  82.4  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0526  ArsR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 276 aa  82.4  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.107472 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1388  ArsR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6330  ArsR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0761907 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1527  ArsR family transcriptional regulator  47.19 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.546926  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1962  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.51 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.166956  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5705  ArsR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 113 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0927566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3667  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5675  ArsR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 113 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.69545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1584  ArsR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1486  ArsR family transcriptional regulator  45.56 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586403  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1079  ArsR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0278523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1424  ArsR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.414948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1138  ArsR family transcriptional regulator  45 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3864  regulatory protein ArsR  45.63 
 
 		 119 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.325648 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2392  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 		 117 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4055  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.77885 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4893  regulatory protein ArsR  45.26 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4173  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.63 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00372298  normal  0.543364 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1580  regulatory protein, ArsR  42.86 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3958  protein tyrosine phosphatase  46.74 
 
 		 295 aa  77  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.387678 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2841  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 110 aa  76.6  0.00000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.268381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2859  transcriptional regulator, ArsR  43.43 
 
 		 118 aa  76.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.156895  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2480  transcriptional regulator, ArsR family  43.43 
 
 		 118 aa  76.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2811  regulatory protein, ArsR  43.42 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0874  regulatory protein ArsR  44.23 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3055  ArsR family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.572382  normal  0.538726 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4382  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  46.07 
 
 		 270 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0205  transcriptional regulator, ArsR family  43.53 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.397651 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5676  ArsR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.225709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0487  ArsR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 115 aa  73.6  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2830  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.53 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5343  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.57 
 
 		 107 aa  72  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5763  transcriptional regulator, ArsR family  48 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.834152 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  44.94 
 
 		 270 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5376  ArsR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 113 aa  72  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.563741 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2347  ArsR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 109 aa  72  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1348  ArsR family transcriptional regulator  48.81 
 
 		 114 aa  72  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.208543  normal  0.0554096 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>