242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0952 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0952  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 124 aa  257  4e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1466  ArsR family transcriptional regulator  80.8 
 
 		 129 aa  204  3e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2244  ArsR family transcriptional regulator  63.3 
 
 		 110 aa  142  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.908668  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0619  ArsR family transcriptional regulator  60.18 
 
 		 113 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4198  ArsR family transcriptional regulator  56.64 
 
 		 124 aa  137  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5578  ArsR family transcriptional regulator  58.72 
 
 		 111 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.151543 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2140  ArsR family transcriptional regulator  52.99 
 
 		 117 aa  133  8e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5057  regulatory protein ArsR  62.39 
 
 		 116 aa  133  9e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0101  regulatory protein ArsR  58.88 
 
 		 114 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  51.22 
 
 		 291 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2533  transcriptional regulator, ArsR family  54.63 
 
 		 120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4074  transcriptional regulator, ArsR family  52.29 
 
 		 118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00570943  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2246  ArsR family transcriptional regulator  59.57 
 
 		 115 aa  123  8.000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.362013  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4425  ArsR family transcriptional regulator  54.63 
 
 		 155 aa  122  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0326  ArsR family transcriptional regulator  56.88 
 
 		 123 aa  122  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1970  ArsR family transcriptional regulator ArsR1  55.14 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3420  regulatory protein, ArsR  54.7 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1641  protein tyrosine phosphatase  48.6 
 
 		 309 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2403  ArsR family transcriptional regulator  49.54 
 
 		 109 aa  110  9e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0656384  normal  0.0239718 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3855  regulatory protein, ArsR  47.17 
 
 		 110 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3125  ArsR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 110 aa  104  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2541  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 117 aa  103  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5721  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 		 119 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2392  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 117 aa  97.4  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1788  ArsR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 123 aa  96.3  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0212653 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3123  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 120 aa  94.4  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.550975  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1129  putative arsenical resistance operon repressor transcription regulator protein  48.96 
 
 		 107 aa  93.2  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.997144 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2159  transcriptional regulator, ArsR family  46.32 
 
 		 131 aa  92  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679753  normal  0.522465 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0217  regulatory protein, ArsR  44.35 
 
 		 120 aa  92.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2414  transcriptional regulator, ArsR family  43 
 
 		 118 aa  92  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.203968 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3254  putative transcriptional regulator, ArsR family  49 
 
 		 106 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1046  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.37 
 
 		 119 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0697  transcriptional regulator, ArsR family  43.12 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.729608 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2339  ArsR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 114 aa  91.3  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.479129  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0166  regulatory protein, ArsR  44.44 
 
 		 113 aa  91.3  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.698937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6064  transcriptional regulator ArsR family  39.42 
 
 		 123 aa  90.9  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1908  regulatory protein ArsR  40.68 
 
 		 120 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3136  regulatory protein, ArsR  43.36 
 
 		 119 aa  90.1  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.651925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2099  ArsR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.321507  normal  0.577048 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3577  transcriptional regulator, ArsR family  47.96 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.919618 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  41.35 
 
 		 287 aa  87.8  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  42 
 
 		 298 aa  87.4  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1406  regulatory protein, ArsR  44 
 
 		 110 aa  87.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3958  protein tyrosine phosphatase  54.32 
 
 		 295 aa  86.3  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.387678 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2730  ArsR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 108 aa  86.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.636967  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5343  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.92 
 
 		 107 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3201  regulatory protein ArsR  41.59 
 
 		 119 aa  86.3  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3342  regulatory protein, ArsR  42.59 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1584  ArsR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1388  regulatory protein, ArsR  42.16 
 
 		 108 aa  86.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.434154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4893  regulatory protein ArsR  44.12 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4055  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.21 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.77885 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.43 
 
 		 118 aa  84.3  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4382  ArsR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 107 aa  84  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0654  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.68 
 
 		 109 aa  84  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.153505 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1962  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 105 aa  84  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.166956  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0522  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 119 aa  84  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226567 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3055  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 106 aa  84  7e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.572382  normal  0.538726 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2347  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 109 aa  84  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3941  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.88 
 
 		 107 aa  83.6  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.164761 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3667  ArsR family transcriptional regulator  45 
 
 		 109 aa  83.6  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1580  regulatory protein, ArsR  42.16 
 
 		 109 aa  83.6  9e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05830  transcriptional regulator, ArsR family  41.86 
 
 		 92 aa  82.8  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.16233  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1346  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.62 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.123906  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1138  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6561  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 111 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4966  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602085  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3194  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2514  ArsR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0122169 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5675  ArsR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.69545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5601  ArsR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 111 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19891  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1388  ArsR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 113 aa  81.3  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6330  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0761907 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0487  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 115 aa  80.9  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30700  Regulatory protein, ArsR family  43.33 
 
 		 113 aa  80.9  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263428  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5705  ArsR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 113 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0927566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2830  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4216  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 115 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2035  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5376  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.563741 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6167  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 111 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.235116 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0560  arsenical resistance transcriptional regulator  41.05 
 
 		 111 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0253311  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5681  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 		 119 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.825179  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0911  arsenical resistance transcriptional regulator  41.05 
 
 		 123 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3468  ArsR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 114 aa  80.1  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0454  arsenical resistance transcriptional regulator  38.89 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17354  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0961  arsenical resistance transcriptional regulator  40 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1378  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0219707 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2289  ArsR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00371607 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1940  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.714922  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2124  arsenic resistance transcriptional regulator  40 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00138716  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2190  arsenic resistance transcriptional regulator  40 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1079  ArsR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0278523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2587  regulatory protein, ArsR  46.34 
 
 		 117 aa  78.2  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.344462  normal  0.176164 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2859  transcriptional regulator, ArsR  40.43 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.156895  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0205  transcriptional regulator, ArsR family  40.43 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.397651 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2480  transcriptional regulator, ArsR family  40.43 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1280  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0874  regulatory protein ArsR  45.37 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1486  ArsR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 108 aa  77.4  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>