More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2345 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2345  arsenate reductase, putative  100 
 
 
165 aa  343  7e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0652  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  89.09 
 
 
165 aa  311  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0644228 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0489  protein tyrosine phosphatase  87.27 
 
 
165 aa  307  4e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2317  protein tyrosine phosphatase  88.82 
 
 
162 aa  305  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29117  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30690  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  86.42 
 
 
164 aa  298  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1281  protein tyrosine phosphatase  84.66 
 
 
164 aa  296  1e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395414  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2828  hypothetical protein  74.55 
 
 
165 aa  267  5e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5707  protein tyrosine phosphatase  69.33 
 
 
164 aa  250  6e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.598358  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5345  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  67.9 
 
 
164 aa  241  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807351  normal  0.94085 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5674  protein tyrosine phosphatase  65.64 
 
 
164 aa  241  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3054  protein tyrosine phosphatase  66.26 
 
 
165 aa  240  5e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6165  protein tyrosine phosphatase  69.94 
 
 
164 aa  235  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.237527 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  66.05 
 
 
164 aa  234  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1583  arsenate reductase  61.35 
 
 
164 aa  230  7.000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1047  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  63.98 
 
 
175 aa  222  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  61.59 
 
 
317 aa  221  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2540  protein tyrosine phosphatase  61.82 
 
 
179 aa  219  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.232269  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1387  arsenate reductase, putative  62.96 
 
 
165 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782064  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2415  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  63.8 
 
 
176 aa  217  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.214614 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3200  protein tyrosine phosphatase  61.11 
 
 
182 aa  216  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0618  protein tyrosine phosphatase  62.73 
 
 
175 aa  214  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1909  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  62.11 
 
 
175 aa  214  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0875  protein tyrosine phosphatase  60.49 
 
 
189 aa  214  5.9999999999999996e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  59.26 
 
 
291 aa  213  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4199  protein tyrosine phosphatase  58.9 
 
 
169 aa  213  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.56112  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4054  protein tyrosine phosphatase  61.49 
 
 
175 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1443  protein tyrosine phosphatase  59.75 
 
 
171 aa  209  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.907401  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3124  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  60.13 
 
 
180 aa  208  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.641523  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2139  protein tyrosine phosphatase  60 
 
 
179 aa  207  4e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5056  protein tyrosine phosphatase  58.39 
 
 
175 aa  206  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3419  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  58.39 
 
 
175 aa  205  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0325  protein tyrosine phosphatase  58.39 
 
 
175 aa  205  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4073  protein tyrosine phosphatase  58.02 
 
 
175 aa  203  8e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00713797  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5577  protein tyrosine phosphatase  59.26 
 
 
175 aa  203  9e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.163475 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0207  protein tyrosine phosphatase  55.83 
 
 
173 aa  202  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.538928 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0331  protein tyrosine phosphatase  53.99 
 
 
170 aa  202  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.481618 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3341  arsenate reductase  57.86 
 
 
317 aa  202  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0216  protein tyrosine phosphatase  56.96 
 
 
178 aa  198  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1984  protein tyrosine phosphatase  57.86 
 
 
177 aa  196  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565539  normal  0.702205 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00628  arsenate reductase  53.05 
 
 
176 aa  194  6e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.102158  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  54.94 
 
 
298 aa  192  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1787  protein tyrosine phosphatase  55.28 
 
 
179 aa  189  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00981569 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2640  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  59.09 
 
 
168 aa  189  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.261916  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5377  protein tyrosine phosphatase  50.92 
 
 
173 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0699  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  57.32 
 
 
164 aa  185  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5682  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  53.7 
 
 
175 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.99461  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5722  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  53.7 
 
 
175 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2588  protein tyrosine phosphatase  56.41 
 
 
167 aa  182  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.570758  normal  0.260615 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4381  protein tyrosine phosphatase  51.18 
 
 
171 aa  178  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2216  protein tyrosine phosphatase  52.17 
 
 
166 aa  178  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.415752  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1344  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  51.9 
 
 
165 aa  177  5.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.230877  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3958  protein tyrosine phosphatase  49.38 
 
 
295 aa  175  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.387678 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2516  protein tyrosine phosphatase  51.27 
 
 
165 aa  175  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.69896  hitchhiker  0.0073525 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2966  protein tyrosine phosphatase  46.34 
 
 
165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.770903 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0526  ArsR family transcriptional regulator  51.55 
 
 
276 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.107472 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  51.9 
 
 
270 aa  171  5e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1579  protein tyrosine phosphatase  52 
 
 
159 aa  170  6.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0653  protein tyrosine phosphatase  53.16 
 
 
168 aa  168  4e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.448039  normal  0.447799 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  48.78 
 
 
270 aa  166  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  48.15 
 
 
287 aa  164  4e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3826  protein tyrosine phosphatase  49.7 
 
 
167 aa  164  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.248837 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  49.7 
 
 
167 aa  164  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.117198 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5346  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  49.38 
 
 
164 aa  156  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.524005 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3255  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.5 
 
 
172 aa  156  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3579  protein tyrosine phosphatase  49.69 
 
 
164 aa  155  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.747703 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1820  protein tyrosine phosphatase  47.53 
 
 
164 aa  154  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.102898 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5673  protein tyrosine phosphatase  48.47 
 
 
164 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1594  protein tyrosine phosphatase  54.07 
 
 
167 aa  154  5.0000000000000005e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5600  protein tyrosine phosphatase  48.47 
 
 
164 aa  154  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123028  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3466  protein tyrosine phosphatase  47.53 
 
 
168 aa  154  8e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6329  protein tyrosine phosphatase  48.47 
 
 
164 aa  152  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720558  normal  0.0816451 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2123  arsenate reductase  52.83 
 
 
158 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020679  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6164  protein tyrosine phosphatase  47.56 
 
 
164 aa  151  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.398136 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0959  arsenate reductase  48.17 
 
 
164 aa  151  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4965  protein tyrosine phosphatase  48.78 
 
 
172 aa  151  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219963  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3195  protein tyrosine phosphatase  48.78 
 
 
172 aa  151  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1641  protein tyrosine phosphatase  45.86 
 
 
309 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2189  arsenate reductase  52.2 
 
 
158 aa  150  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1128  putative arsenate reductase (arsenical PUMP modifier) protein  48.78 
 
 
164 aa  150  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6562  protein tyrosine phosphatase  46.15 
 
 
168 aa  149  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1532  transcriptional regulator, ArsR family  43.56 
 
 
306 aa  149  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4215  protein tyrosine phosphatase  47.24 
 
 
164 aa  148  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  50.62 
 
 
284 aa  147  9e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5708  protein tyrosine phosphatase  46.95 
 
 
164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5765  protein tyrosine phosphatase  49.08 
 
 
164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2037  arsenate reductase ArsC  46.34 
 
 
164 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0558  arsenate reductase  46.34 
 
 
164 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0569825  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0456  arsenate reductase  46.34 
 
 
164 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0585  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  48.59 
 
 
177 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1942  arsenate reductase ArsC  46.34 
 
 
164 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1882  arsenate reductase  46.34 
 
 
164 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0913  arsenate reductase  46.34 
 
 
164 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.910789  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3397  protein tyrosine phosphatase  44.38 
 
 
174 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2141  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  51.27 
 
 
159 aa  143  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5147  protein tyrosine phosphatase  48.7 
 
 
156 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1980  protein tyrosine phosphatase  52.48 
 
 
163 aa  142  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221335  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3119  protein tyrosine phosphatase  45.51 
 
 
168 aa  141  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4774  protein tyrosine phosphatase  42.41 
 
 
167 aa  141  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4667  protein tyrosine phosphatase  42.41 
 
 
167 aa  141  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3780  protein tyrosine phosphatase  46.79 
 
 
167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0223758  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>