More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5056 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5056  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 175 aa  363  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0618  protein tyrosine phosphatase  66.29 
 
 		 175 aa  257  7e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3200  protein tyrosine phosphatase  67.65 
 
 		 182 aa  255  3e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0875  protein tyrosine phosphatase  66.08 
 
 		 189 aa  254  5e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4073  protein tyrosine phosphatase  65.71 
 
 		 175 aa  252  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00713797  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3419  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  65.14 
 
 		 175 aa  250  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3124  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  66.47 
 
 		 180 aa  249  9.000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.641523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0325  protein tyrosine phosphatase  63.43 
 
 		 175 aa  249  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1047  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  62.86 
 
 		 175 aa  245  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5577  protein tyrosine phosphatase  65.14 
 
 		 175 aa  245  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.163475 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2139  protein tyrosine phosphatase  68.94 
 
 		 179 aa  244  4e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  63.1 
 
 		 291 aa  244  4e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3341  arsenate reductase  67.07 
 
 		 317 aa  244  4.9999999999999997e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0216  protein tyrosine phosphatase  65.52 
 
 		 178 aa  243  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00628  arsenate reductase  67.06 
 
 		 176 aa  242  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.102158  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4054  protein tyrosine phosphatase  60.57 
 
 		 175 aa  238  5e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1909  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  60.57 
 
 		 175 aa  236  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 317 aa  236  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2415  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  63.25 
 
 		 176 aa  235  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.214614 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4199  protein tyrosine phosphatase  61.96 
 
 		 169 aa  220  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.56112  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0489  protein tyrosine phosphatase  62.66 
 
 		 165 aa  218  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1387  arsenate reductase, putative  62.58 
 
 		 165 aa  216  1e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782064  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1787  protein tyrosine phosphatase  63.35 
 
 		 179 aa  215  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00981569 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2828  hypothetical protein  62.66 
 
 		 165 aa  213  8e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0652  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  58.39 
 
 		 165 aa  209  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0644228 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1443  protein tyrosine phosphatase  60 
 
 		 171 aa  209  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.907401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5707  protein tyrosine phosphatase  57.06 
 
 		 164 aa  207  7e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1281  protein tyrosine phosphatase  58.28 
 
 		 164 aa  206  9e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30690  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  58.28 
 
 		 164 aa  206  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2345  arsenate reductase, putative  58.39 
 
 		 165 aa  206  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0331  protein tyrosine phosphatase  54.71 
 
 		 170 aa  205  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.481618 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  58.9 
 
 		 164 aa  205  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5345  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  58.9 
 
 		 164 aa  205  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807351  normal  0.94085 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2317  protein tyrosine phosphatase  58.75 
 
 		 162 aa  204  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2540  protein tyrosine phosphatase  58.54 
 
 		 179 aa  204  6e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.232269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1583  arsenate reductase  58.02 
 
 		 164 aa  204  8e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5674  protein tyrosine phosphatase  56.44 
 
 		 164 aa  202  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6165  protein tyrosine phosphatase  59.51 
 
 		 164 aa  201  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.237527 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3054  protein tyrosine phosphatase  58.02 
 
 		 165 aa  197  7e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5682  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  52.57 
 
 		 175 aa  197  9e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.99461  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5722  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  52.57 
 
 		 175 aa  197  9e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0207  protein tyrosine phosphatase  53.37 
 
 		 173 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.538928 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  53.05 
 
 		 298 aa  193  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5377  protein tyrosine phosphatase  53.01 
 
 		 173 aa  192  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2640  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  55.83 
 
 		 168 aa  189  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.261916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3958  protein tyrosine phosphatase  53.05 
 
 		 295 aa  187  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.387678 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0699  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  61.38 
 
 		 164 aa  185  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  55.06 
 
 		 270 aa  183  9e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  55.7 
 
 		 287 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  53.16 
 
 		 270 aa  176  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1984  protein tyrosine phosphatase  50.94 
 
 		 177 aa  176  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565539  normal  0.702205 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3466  protein tyrosine phosphatase  50.9 
 
 		 168 aa  175  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2588  protein tyrosine phosphatase  52.8 
 
 		 167 aa  174  8e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.570758  normal  0.260615 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0526  ArsR family transcriptional regulator  49.08 
 
 		 276 aa  173  9e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.107472 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2216  protein tyrosine phosphatase  53.21 
 
 		 166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.415752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1579  protein tyrosine phosphatase  53.69 
 
 		 159 aa  172  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1344  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50 
 
 		 165 aa  167  7e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.230877  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2966  protein tyrosine phosphatase  45.62 
 
 		 165 aa  166  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.770903 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2516  protein tyrosine phosphatase  49.38 
 
 		 165 aa  165  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.69896  hitchhiker  0.0073525 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4381  protein tyrosine phosphatase  50.61 
 
 		 171 aa  162  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.99 
 
 		 167 aa  158  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.117198 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3826  protein tyrosine phosphatase  46.99 
 
 		 167 aa  158  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.248837 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1820  protein tyrosine phosphatase  46.91 
 
 		 164 aa  156  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.102898 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1980  protein tyrosine phosphatase  53.42 
 
 		 163 aa  155  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221335  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0653  protein tyrosine phosphatase  53.96 
 
 		 168 aa  155  3e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.448039  normal  0.447799 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5673  protein tyrosine phosphatase  48.77 
 
 		 164 aa  155  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2337  protein tyrosine phosphatase  50.62 
 
 		 167 aa  154  7e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.441606 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5600  protein tyrosine phosphatase  48.77 
 
 		 164 aa  154  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5346  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  47.53 
 
 		 164 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.524005 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6164  protein tyrosine phosphatase  48.77 
 
 		 164 aa  152  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.398136 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1641  protein tyrosine phosphatase  46.5 
 
 		 309 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3255  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.67 
 
 		 172 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4215  protein tyrosine phosphatase  49.38 
 
 		 164 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6562  protein tyrosine phosphatase  47.53 
 
 		 168 aa  150  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1594  protein tyrosine phosphatase  46.5 
 
 		 167 aa  150  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5708  protein tyrosine phosphatase  48.15 
 
 		 164 aa  149  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3579  protein tyrosine phosphatase  46.25 
 
 		 164 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.747703 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1128  putative arsenate reductase (arsenical PUMP modifier) protein  47.24 
 
 		 164 aa  148  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6329  protein tyrosine phosphatase  46.99 
 
 		 164 aa  147  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720558  normal  0.0816451 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0959  arsenate reductase  46.91 
 
 		 164 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1532  transcriptional regulator, ArsR family  43.64 
 
 		 306 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1882  arsenate reductase  47.53 
 
 		 164 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0558  arsenate reductase  47.53 
 
 		 164 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0569825  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0456  arsenate reductase  46.91 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1942  arsenate reductase ArsC  46.91 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2037  arsenate reductase ArsC  46.91 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0913  arsenate reductase  47.53 
 
 		 164 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.910789  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5765  protein tyrosine phosphatase  48.15 
 
 		 164 aa  144  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4965  protein tyrosine phosphatase  46.3 
 
 		 172 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219963  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3195  protein tyrosine phosphatase  46.3 
 
 		 172 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4774  protein tyrosine phosphatase  41.72 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4667  protein tyrosine phosphatase  41.72 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 284 aa  142  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2123  arsenate reductase  47.83 
 
 		 158 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020679  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2141  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.45 
 
 		 159 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3119  protein tyrosine phosphatase  45.18 
 
 		 168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2189  arsenate reductase  47.2 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5147  protein tyrosine phosphatase  48.43 
 
 		 156 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0585  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  48.18 
 
 		 177 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3397  protein tyrosine phosphatase  41.61 
 
 		 174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>