More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5346 on replicon NC_012849
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012849  Rpic12D_5346  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  100 
 
 
164 aa  342  1e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.524005 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1820  protein tyrosine phosphatase  93.29 
 
 
164 aa  325  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.102898 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3255  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  93.83 
 
 
172 aa  323  9e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3579  protein tyrosine phosphatase  93.25 
 
 
164 aa  320  4e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.747703 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1128  putative arsenate reductase (arsenical PUMP modifier) protein  89.02 
 
 
164 aa  310  3.9999999999999997e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6164  protein tyrosine phosphatase  89.02 
 
 
164 aa  308  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.398136 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  88.27 
 
 
167 aa  304  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.117198 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3826  protein tyrosine phosphatase  88.27 
 
 
167 aa  304  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.248837 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5708  protein tyrosine phosphatase  87.8 
 
 
164 aa  300  6.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6562  protein tyrosine phosphatase  85.98 
 
 
168 aa  300  8.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4965  protein tyrosine phosphatase  84.76 
 
 
172 aa  299  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219963  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3195  protein tyrosine phosphatase  84.76 
 
 
172 aa  299  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4215  protein tyrosine phosphatase  86.5 
 
 
164 aa  298  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5600  protein tyrosine phosphatase  83.54 
 
 
164 aa  295  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123028  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5673  protein tyrosine phosphatase  84.15 
 
 
164 aa  293  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2037  arsenate reductase ArsC  82.32 
 
 
164 aa  291  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0456  arsenate reductase  82.32 
 
 
164 aa  291  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1942  arsenate reductase ArsC  82.32 
 
 
164 aa  291  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0558  arsenate reductase  82.32 
 
 
164 aa  290  6e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0569825  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6329  protein tyrosine phosphatase  81.71 
 
 
164 aa  290  6e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720558  normal  0.0816451 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1882  arsenate reductase  82.32 
 
 
164 aa  290  6e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0913  arsenate reductase  82.32 
 
 
164 aa  290  6e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.910789  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0959  arsenate reductase  82.32 
 
 
164 aa  289  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5765  protein tyrosine phosphatase  85.28 
 
 
164 aa  280  6.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3119  protein tyrosine phosphatase  76.05 
 
 
168 aa  258  3e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5345  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50.62 
 
 
164 aa  168  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807351  normal  0.94085 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 
164 aa  168  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4381  protein tyrosine phosphatase  52.69 
 
 
171 aa  166  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0652  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50.92 
 
 
165 aa  161  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0644228 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2216  protein tyrosine phosphatase  55.19 
 
 
166 aa  161  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.415752  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0331  protein tyrosine phosphatase  49.69 
 
 
170 aa  161  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.481618 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5377  protein tyrosine phosphatase  47.53 
 
 
173 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2588  protein tyrosine phosphatase  53.25 
 
 
167 aa  160  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.570758  normal  0.260615 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2640  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  49.69 
 
 
168 aa  160  9e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.261916  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3054  protein tyrosine phosphatase  48.73 
 
 
165 aa  159  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0207  protein tyrosine phosphatase  49.69 
 
 
173 aa  159  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.538928 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5707  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 
164 aa  158  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.598358  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1344  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  52.2 
 
 
165 aa  157  6e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.230877  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1583  arsenate reductase  48.1 
 
 
164 aa  157  9e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2345  arsenate reductase, putative  49.38 
 
 
165 aa  156  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2828  hypothetical protein  48.5 
 
 
165 aa  156  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2516  protein tyrosine phosphatase  51.57 
 
 
165 aa  155  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.69896  hitchhiker  0.0073525 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1047  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  47.53 
 
 
175 aa  155  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0489  protein tyrosine phosphatase  48.75 
 
 
165 aa  155  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5056  protein tyrosine phosphatase  47.53 
 
 
175 aa  152  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5674  protein tyrosine phosphatase  48.12 
 
 
164 aa  151  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1387  arsenate reductase, putative  48.47 
 
 
165 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782064  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  47.5 
 
 
298 aa  150  8.999999999999999e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30690  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  47.24 
 
 
164 aa  149  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0699  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  49.02 
 
 
164 aa  150  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1984  protein tyrosine phosphatase  47.2 
 
 
177 aa  149  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565539  normal  0.702205 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1443  protein tyrosine phosphatase  47.77 
 
 
171 aa  149  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.907401  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6165  protein tyrosine phosphatase  51.88 
 
 
164 aa  148  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.237527 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2415  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.2 
 
 
176 aa  148  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.214614 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1909  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  46.88 
 
 
175 aa  147  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00628  arsenate reductase  50 
 
 
176 aa  148  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.102158  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2317  protein tyrosine phosphatase  47.56 
 
 
162 aa  147  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29117  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4054  protein tyrosine phosphatase  45.62 
 
 
175 aa  147  9e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1579  protein tyrosine phosphatase  48.68 
 
 
159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3124  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  46.25 
 
 
180 aa  145  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.641523  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1281  protein tyrosine phosphatase  45.68 
 
 
164 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395414  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0618  protein tyrosine phosphatase  47.83 
 
 
175 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5682  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.62 
 
 
175 aa  142  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.99461  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5722  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.62 
 
 
175 aa  142  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4199  protein tyrosine phosphatase  45 
 
 
169 aa  142  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.56112  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4073  protein tyrosine phosphatase  45.62 
 
 
175 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00713797  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0653  protein tyrosine phosphatase  53.57 
 
 
168 aa  142  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.448039  normal  0.447799 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0875  protein tyrosine phosphatase  45.62 
 
 
189 aa  140  8e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0325  protein tyrosine phosphatase  45.96 
 
 
175 aa  140  9e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3200  protein tyrosine phosphatase  43.75 
 
 
182 aa  139  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0216  protein tyrosine phosphatase  46.88 
 
 
178 aa  139  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3466  protein tyrosine phosphatase  44.38 
 
 
168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3780  protein tyrosine phosphatase  48.75 
 
 
167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0223758  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  45 
 
 
291 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2139  protein tyrosine phosphatase  45.57 
 
 
179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3341  arsenate reductase  45 
 
 
317 aa  139  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  43.75 
 
 
270 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3397  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 
174 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1787  protein tyrosine phosphatase  43.9 
 
 
179 aa  137  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00981569 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  43.12 
 
 
270 aa  136  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  47.53 
 
 
317 aa  135  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1928  arsenate reductase  45.57 
 
 
162 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.245596  unclonable  0.00000025949 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2540  protein tyrosine phosphatase  42.24 
 
 
179 aa  134  6.0000000000000005e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.232269  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1980  protein tyrosine phosphatase  47.56 
 
 
163 aa  134  7.000000000000001e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221335  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5577  protein tyrosine phosphatase  44.3 
 
 
175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.163475 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3419  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  43.75 
 
 
175 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2337  protein tyrosine phosphatase  47.5 
 
 
167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.441606 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2123  arsenate reductase  46.01 
 
 
158 aa  128  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020679  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35100  arsenate reductase  46.84 
 
 
156 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772564  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5147  protein tyrosine phosphatase  46.2 
 
 
156 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25910  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  45.57 
 
 
156 aa  126  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2962  arsenate reductase  46.2 
 
 
156 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  43.12 
 
 
287 aa  125  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2189  arsenate reductase  45.4 
 
 
158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3958  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
295 aa  124  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.387678 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0526  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 
276 aa  122  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.107472 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1594  protein tyrosine phosphatase  41.98 
 
 
167 aa  120  6e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1502  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.41 
 
 
156 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.240975  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2966  protein tyrosine phosphatase  37.27 
 
 
165 aa  119  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.770903 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
284 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.477239 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>