More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4210 on replicon NC_007490
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 270 aa  548  1e-155  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  90.74 
 
 		 270 aa  502  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  57.45 
 
 		 287 aa  317  2e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0526  ArsR family transcriptional regulator  51.81 
 
 		 276 aa  270  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.107472 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 291 aa  232  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  42.96 
 
 		 298 aa  226  3e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3958  protein tyrosine phosphatase  45.62 
 
 		 295 aa  226  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.387678 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1641  protein tyrosine phosphatase  41.24 
 
 		 309 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1787  protein tyrosine phosphatase  55.49 
 
 		 179 aa  192  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00981569 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4199  protein tyrosine phosphatase  56.88 
 
 		 169 aa  191  8e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.56112  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4073  protein tyrosine phosphatase  57.41 
 
 		 175 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00713797  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0875  protein tyrosine phosphatase  57.96 
 
 		 189 aa  188  9e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0325  protein tyrosine phosphatase  55.56 
 
 		 175 aa  187  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 284 aa  186  4e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 317 aa  185  6e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3200  protein tyrosine phosphatase  50.86 
 
 		 182 aa  185  8e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5577  protein tyrosine phosphatase  56.88 
 
 		 175 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.163475 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0331  protein tyrosine phosphatase  53.42 
 
 		 170 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.481618 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2139  protein tyrosine phosphatase  55.35 
 
 		 179 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5056  protein tyrosine phosphatase  55.06 
 
 		 175 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3419  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  54.32 
 
 		 175 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0618  protein tyrosine phosphatase  54.66 
 
 		 175 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1443  protein tyrosine phosphatase  55.41 
 
 		 171 aa  181  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.907401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2540  protein tyrosine phosphatase  54.66 
 
 		 179 aa  180  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.232269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4054  protein tyrosine phosphatase  54.43 
 
 		 175 aa  179  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2415  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  52.5 
 
 		 176 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.214614 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5707  protein tyrosine phosphatase  52.17 
 
 		 164 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0207  protein tyrosine phosphatase  52.17 
 
 		 173 aa  178  7e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.538928 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1387  arsenate reductase, putative  53.75 
 
 		 165 aa  178  8e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782064  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5345  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  52.8 
 
 		 164 aa  178  9e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807351  normal  0.94085 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  52.17 
 
 		 164 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0216  protein tyrosine phosphatase  55.28 
 
 		 178 aa  177  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3124  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  52.47 
 
 		 180 aa  177  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.641523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3341  arsenate reductase  50.93 
 
 		 317 aa  176  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5377  protein tyrosine phosphatase  51.55 
 
 		 173 aa  176  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1909  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  53.8 
 
 		 175 aa  176  5e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1047  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  53.8 
 
 		 175 aa  175  6e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0489  protein tyrosine phosphatase  50.31 
 
 		 165 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3054  protein tyrosine phosphatase  52.5 
 
 		 165 aa  172  5e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0652  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.78 
 
 		 165 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0644228 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2345  arsenate reductase, putative  51.9 
 
 		 165 aa  171  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5674  protein tyrosine phosphatase  49.69 
 
 		 164 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30690  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  50.93 
 
 		 164 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00628  arsenate reductase  49.39 
 
 		 176 aa  169  5e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.102158  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1583  arsenate reductase  48.75 
 
 		 164 aa  168  9e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2828  hypothetical protein  47.83 
 
 		 165 aa  167  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6165  protein tyrosine phosphatase  52.17 
 
 		 164 aa  167  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.237527 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2317  protein tyrosine phosphatase  50.32 
 
 		 162 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1281  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 		 164 aa  165  5.9999999999999996e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2588  protein tyrosine phosphatase  52.26 
 
 		 167 aa  165  9e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.570758  normal  0.260615 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1984  protein tyrosine phosphatase  46.88 
 
 		 177 aa  160  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565539  normal  0.702205 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2966  protein tyrosine phosphatase  44.17 
 
 		 165 aa  159  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.770903 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2216  protein tyrosine phosphatase  48.78 
 
 		 166 aa  159  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.415752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1344  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.08 
 
 		 165 aa  158  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.230877  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0699  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  50.99 
 
 		 164 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4381  protein tyrosine phosphatase  51.25 
 
 		 171 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2516  protein tyrosine phosphatase  47.44 
 
 		 165 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.69896  hitchhiker  0.0073525 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5682  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  47.83 
 
 		 175 aa  155  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.99461  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5722  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  47.83 
 
 		 175 aa  155  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3826  protein tyrosine phosphatase  45.45 
 
 		 167 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.248837 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.45 
 
 		 167 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.117198 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1579  protein tyrosine phosphatase  45.1 
 
 		 159 aa  150  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1532  transcriptional regulator, ArsR family  32.55 
 
 		 306 aa  148  9e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2640  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  45.57 
 
 		 168 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.261916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3466  protein tyrosine phosphatase  43.75 
 
 		 168 aa  146  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3255  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.43 
 
 		 172 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5673  protein tyrosine phosphatase  45 
 
 		 164 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5600  protein tyrosine phosphatase  44.38 
 
 		 164 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5346  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.12 
 
 		 164 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.524005 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6329  protein tyrosine phosphatase  45.81 
 
 		 164 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720558  normal  0.0816451 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1128  putative arsenate reductase (arsenical PUMP modifier) protein  43.75 
 
 		 164 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0959  arsenate reductase  43.12 
 
 		 164 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3579  protein tyrosine phosphatase  42.86 
 
 		 164 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.747703 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5708  protein tyrosine phosphatase  42.5 
 
 		 164 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6164  protein tyrosine phosphatase  43.12 
 
 		 164 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.398136 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4215  protein tyrosine phosphatase  43.12 
 
 		 164 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4965  protein tyrosine phosphatase  44.52 
 
 		 172 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219963  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3195  protein tyrosine phosphatase  44.52 
 
 		 172 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2141  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.91 
 
 		 159 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0558  arsenate reductase  45.16 
 
 		 164 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0569825  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0913  arsenate reductase  45.16 
 
 		 164 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.910789  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1942  arsenate reductase ArsC  45.16 
 
 		 164 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2037  arsenate reductase ArsC  45.16 
 
 		 164 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0456  arsenate reductase  45.16 
 
 		 164 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6562  protein tyrosine phosphatase  41.25 
 
 		 168 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2123  arsenate reductase  44.1 
 
 		 158 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020679  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1882  arsenate reductase  45.16 
 
 		 164 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1820  protein tyrosine phosphatase  41.25 
 
 		 164 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.102898 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2189  arsenate reductase  44.1 
 
 		 158 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0653  protein tyrosine phosphatase  43.95 
 
 		 168 aa  129  7.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.448039  normal  0.447799 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4774  protein tyrosine phosphatase  38.36 
 
 		 167 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1980  protein tyrosine phosphatase  43.4 
 
 		 163 aa  125  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221335  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4667  protein tyrosine phosphatase  38.36 
 
 		 167 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5765  protein tyrosine phosphatase  42.24 
 
 		 164 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25910  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  39.49 
 
 		 156 aa  122  9e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0585  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  44.44 
 
 		 177 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5147  protein tyrosine phosphatase  40.13 
 
 		 156 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35100  arsenate reductase  41.4 
 
 		 156 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2962  arsenate reductase  41.94 
 
 		 156 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3119  protein tyrosine phosphatase  39.39 
 
 		 168 aa  116  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>