More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5600 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_5600  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 164 aa  337  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6329  protein tyrosine phosphatase  96.34 
 
 		 164 aa  327  4e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720558  normal  0.0816451 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6164  protein tyrosine phosphatase  90.85 
 
 		 164 aa  316  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.398136 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6562  protein tyrosine phosphatase  86.59 
 
 		 168 aa  305  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5708  protein tyrosine phosphatase  88.41 
 
 		 164 aa  305  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0959  arsenate reductase  87.2 
 
 		 164 aa  305  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4215  protein tyrosine phosphatase  88.34 
 
 		 164 aa  305  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4965  protein tyrosine phosphatase  87.8 
 
 		 172 aa  304  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219963  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3195  protein tyrosine phosphatase  87.8 
 
 		 172 aa  304  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5673  protein tyrosine phosphatase  85.37 
 
 		 164 aa  298  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3579  protein tyrosine phosphatase  85.89 
 
 		 164 aa  298  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.747703 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3255  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  85.8 
 
 		 172 aa  297  5e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0558  arsenate reductase  85.37 
 
 		 164 aa  297  5e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0569825  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1882  arsenate reductase  85.37 
 
 		 164 aa  297  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0913  arsenate reductase  85.37 
 
 		 164 aa  297  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.910789  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5346  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  83.54 
 
 		 164 aa  295  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.524005 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0456  arsenate reductase  84.76 
 
 		 164 aa  295  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1942  arsenate reductase ArsC  84.76 
 
 		 164 aa  295  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2037  arsenate reductase ArsC  84.76 
 
 		 164 aa  295  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1820  protein tyrosine phosphatase  82.32 
 
 		 164 aa  291  3e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.102898 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1128  putative arsenate reductase (arsenical PUMP modifier) protein  81.71 
 
 		 164 aa  285  2.9999999999999996e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3826  protein tyrosine phosphatase  80.98 
 
 		 167 aa  284  5e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.248837 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  80.98 
 
 		 167 aa  284  5e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.117198 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5765  protein tyrosine phosphatase  82.93 
 
 		 164 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3119  protein tyrosine phosphatase  73.81 
 
 		 168 aa  253  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  51.53 
 
 		 164 aa  171  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5345  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50.31 
 
 		 164 aa  169  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807351  normal  0.94085 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4381  protein tyrosine phosphatase  52.69 
 
 		 171 aa  164  6.9999999999999995e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2588  protein tyrosine phosphatase  54.55 
 
 		 167 aa  162  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.570758  normal  0.260615 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2216  protein tyrosine phosphatase  54.55 
 
 		 166 aa  157  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.415752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0652  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  49.39 
 
 		 165 aa  157  7e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0644228 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1583  arsenate reductase  48.73 
 
 		 164 aa  156  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2828  hypothetical protein  47.02 
 
 		 165 aa  155  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5707  protein tyrosine phosphatase  48.45 
 
 		 164 aa  155  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5377  protein tyrosine phosphatase  46.58 
 
 		 173 aa  155  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0489  protein tyrosine phosphatase  49.38 
 
 		 165 aa  155  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2640  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  49.69 
 
 		 168 aa  154  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.261916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1344  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.8 
 
 		 165 aa  154  6e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.230877  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5056  protein tyrosine phosphatase  48.77 
 
 		 175 aa  154  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2345  arsenate reductase, putative  48.47 
 
 		 165 aa  154  7e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1047  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.77 
 
 		 175 aa  153  8e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0331  protein tyrosine phosphatase  46.95 
 
 		 170 aa  152  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.481618 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0699  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  50.93 
 
 		 164 aa  152  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5674  protein tyrosine phosphatase  47.83 
 
 		 164 aa  152  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2516  protein tyrosine phosphatase  48.19 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.69896  hitchhiker  0.0073525 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3054  protein tyrosine phosphatase  46.2 
 
 		 165 aa  150  5e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3466  protein tyrosine phosphatase  48.75 
 
 		 168 aa  150  8.999999999999999e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1387  arsenate reductase, putative  46.95 
 
 		 165 aa  149  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782064  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1909  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  49.38 
 
 		 175 aa  148  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1984  protein tyrosine phosphatase  48.45 
 
 		 177 aa  149  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565539  normal  0.702205 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30690  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  46.95 
 
 		 164 aa  148  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6165  protein tyrosine phosphatase  50.93 
 
 		 164 aa  148  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.237527 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2317  protein tyrosine phosphatase  47.85 
 
 		 162 aa  147  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0207  protein tyrosine phosphatase  44.79 
 
 		 173 aa  147  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.538928 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3124  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  48.15 
 
 		 180 aa  147  6e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.641523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2415  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.73 
 
 		 176 aa  147  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.214614 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1787  protein tyrosine phosphatase  47.56 
 
 		 179 aa  146  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00981569 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1443  protein tyrosine phosphatase  45.06 
 
 		 171 aa  145  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.907401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0618  protein tyrosine phosphatase  48.15 
 
 		 175 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00628  arsenate reductase  49.39 
 
 		 176 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.102158  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3200  protein tyrosine phosphatase  46.58 
 
 		 182 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4054  protein tyrosine phosphatase  46.25 
 
 		 175 aa  142  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2540  protein tyrosine phosphatase  45.68 
 
 		 179 aa  142  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.232269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2139  protein tyrosine phosphatase  46.2 
 
 		 179 aa  142  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0325  protein tyrosine phosphatase  47.83 
 
 		 175 aa  141  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1281  protein tyrosine phosphatase  46.01 
 
 		 164 aa  141  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  45.62 
 
 		 270 aa  141  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0875  protein tyrosine phosphatase  46.88 
 
 		 189 aa  140  8e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  46.88 
 
 		 298 aa  140  9e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5722  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.34 
 
 		 175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5682  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.34 
 
 		 175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.99461  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3341  arsenate reductase  44.72 
 
 		 317 aa  139  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4199  protein tyrosine phosphatase  45 
 
 		 169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.56112  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4073  protein tyrosine phosphatase  45.62 
 
 		 175 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00713797  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 291 aa  138  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  44.38 
 
 		 270 aa  137  6e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0526  ArsR family transcriptional regulator  44.72 
 
 		 276 aa  137  7e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.107472 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1980  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221335  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0653  protein tyrosine phosphatase  51.43 
 
 		 168 aa  136  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.448039  normal  0.447799 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0216  protein tyrosine phosphatase  45.34 
 
 		 178 aa  136  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1579  protein tyrosine phosphatase  44.59 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  44.38 
 
 		 317 aa  133  9e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3419  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  44.72 
 
 		 175 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5577  protein tyrosine phosphatase  46.2 
 
 		 175 aa  133  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.163475 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  45.34 
 
 		 287 aa  130  6.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3397  protein tyrosine phosphatase  42.24 
 
 		 174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3780  protein tyrosine phosphatase  44.1 
 
 		 167 aa  128  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0223758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5147  protein tyrosine phosphatase  44.94 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2337  protein tyrosine phosphatase  51.25 
 
 		 167 aa  129  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.441606 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25910  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  46.84 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1928  arsenate reductase  43.04 
 
 		 162 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.245596  unclonable  0.00000025949 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3958  protein tyrosine phosphatase  41.88 
 
 		 295 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.387678 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2123  arsenate reductase  46.01 
 
 		 158 aa  124  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020679  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2966  protein tyrosine phosphatase  37.27 
 
 		 165 aa  124  8.000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.770903 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2189  arsenate reductase  45.4 
 
 		 158 aa  120  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35100  arsenate reductase  43.67 
 
 		 156 aa  117  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2962  arsenate reductase  43.67 
 
 		 156 aa  117  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 284 aa  117  9e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1594  protein tyrosine phosphatase  41.82 
 
 		 167 aa  117  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0585  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.73 
 
 		 177 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>