More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5702 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5702  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 173 aa  351  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947024  normal  0.758266 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1017  protein tyrosine phosphatase  82.76 
 
 		 174 aa  285  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.246391  normal  0.0984563 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3987  protein tyrosine phosphatase  55.56 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000154412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0207  protein tyrosine phosphatase  38.71 
 
 		 173 aa  112  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.538928 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1344  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.86 
 
 		 165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.230877  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0331  protein tyrosine phosphatase  38.96 
 
 		 170 aa  111  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.481618 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2516  protein tyrosine phosphatase  42.86 
 
 		 165 aa  111  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.69896  hitchhiker  0.0073525 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 287 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 270 aa  107  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 		 298 aa  107  9.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1443  protein tyrosine phosphatase  42.14 
 
 		 171 aa  106  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.907401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1047  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.43 
 
 		 175 aa  107  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5377  protein tyrosine phosphatase  39.35 
 
 		 173 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  39.16 
 
 		 164 aa  104  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1909  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.43 
 
 		 175 aa  105  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4054  protein tyrosine phosphatase  40.71 
 
 		 175 aa  104  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2139  protein tyrosine phosphatase  40.14 
 
 		 179 aa  103  8e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1387  arsenate reductase, putative  41.13 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782064  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5577  protein tyrosine phosphatase  41.13 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.163475 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4073  protein tyrosine phosphatase  39.44 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00713797  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2588  protein tyrosine phosphatase  39.31 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.570758  normal  0.260615 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3054  protein tyrosine phosphatase  41.13 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1641  protein tyrosine phosphatase  38.89 
 
 		 309 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3419  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  38.03 
 
 		 175 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5345  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.16 
 
 		 164 aa  101  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807351  normal  0.94085 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1594  protein tyrosine phosphatase  41.86 
 
 		 167 aa  99.4  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00628  arsenate reductase  36.11 
 
 		 176 aa  99.8  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.102158  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  39.31 
 
 		 270 aa  99.8  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4199  protein tyrosine phosphatase  37.14 
 
 		 169 aa  99  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.56112  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0526  ArsR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 276 aa  98.2  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.107472 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2828  hypothetical protein  38.73 
 
 		 165 aa  97.8  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0489  protein tyrosine phosphatase  36.81 
 
 		 165 aa  97.4  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4381  protein tyrosine phosphatase  38.26 
 
 		 171 aa  96.7  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2216  protein tyrosine phosphatase  39.44 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.415752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2966  protein tyrosine phosphatase  36.36 
 
 		 165 aa  97.1  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.770903 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2540  protein tyrosine phosphatase  38.03 
 
 		 179 aa  96.3  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.232269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3958  protein tyrosine phosphatase  37.32 
 
 		 295 aa  95.5  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.387678 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3200  protein tyrosine phosphatase  36.62 
 
 		 182 aa  95.5  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2345  arsenate reductase, putative  38.3 
 
 		 165 aa  95.5  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0216  protein tyrosine phosphatase  40.85 
 
 		 178 aa  95.5  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2415  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.46 
 
 		 176 aa  95.1  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.214614 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2317  protein tyrosine phosphatase  38.3 
 
 		 162 aa  94.7  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 291 aa  94.4  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0699  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  38.46 
 
 		 164 aa  94.4  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0652  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.06 
 
 		 165 aa  94  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0644228 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30690  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  38.3 
 
 		 164 aa  93.6  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3341  arsenate reductase  38.73 
 
 		 317 aa  94  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0325  protein tyrosine phosphatase  34.81 
 
 		 175 aa  92.8  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5056  protein tyrosine phosphatase  35.71 
 
 		 175 aa  93.2  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1583  arsenate reductase  38.36 
 
 		 164 aa  92  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2640  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.86 
 
 		 168 aa  91.3  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.261916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1984  protein tyrosine phosphatase  36.88 
 
 		 177 aa  91.3  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565539  normal  0.702205 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1980  protein tyrosine phosphatase  39.86 
 
 		 163 aa  91.3  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221335  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1281  protein tyrosine phosphatase  36.17 
 
 		 164 aa  90.1  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3124  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  34.97 
 
 		 180 aa  89  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.641523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 317 aa  89  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5674  protein tyrosine phosphatase  33.1 
 
 		 164 aa  88.6  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0875  protein tyrosine phosphatase  35 
 
 		 189 aa  88.2  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4215  protein tyrosine phosphatase  34.51 
 
 		 164 aa  88.2  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1579  protein tyrosine phosphatase  33.57 
 
 		 159 aa  88.2  6e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  41.96 
 
 		 150 aa  87.8  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3255  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.62 
 
 		 172 aa  87.4  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0618  protein tyrosine phosphatase  36.62 
 
 		 175 aa  87.4  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1787  protein tyrosine phosphatase  33.79 
 
 		 179 aa  87.4  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00981569 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0558  arsenate reductase  34.51 
 
 		 164 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0569825  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0585  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  32.2 
 
 		 177 aa  85.9  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1882  arsenate reductase  34.51 
 
 		 164 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0913  arsenate reductase  34.51 
 
 		 164 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.910789  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0456  arsenate reductase  34.51 
 
 		 164 aa  85.5  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2037  arsenate reductase ArsC  34.51 
 
 		 164 aa  85.5  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1942  arsenate reductase ArsC  34.51 
 
 		 164 aa  85.5  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  38.62 
 
 		 148 aa  85.1  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5600  protein tyrosine phosphatase  33.8 
 
 		 164 aa  84.7  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3466  protein tyrosine phosphatase  36.36 
 
 		 168 aa  84.7  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5707  protein tyrosine phosphatase  32.87 
 
 		 164 aa  84.7  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6329  protein tyrosine phosphatase  33.8 
 
 		 164 aa  84.3  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720558  normal  0.0816451 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5673  protein tyrosine phosphatase  36.11 
 
 		 164 aa  84.3  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6562  protein tyrosine phosphatase  32.69 
 
 		 168 aa  84.3  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6164  protein tyrosine phosphatase  34.97 
 
 		 164 aa  84.3  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.398136 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5722  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.06 
 
 		 175 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.1 
 
 		 167 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.117198 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0959  arsenate reductase  35.66 
 
 		 164 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5682  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.06 
 
 		 175 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.99461  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3826  protein tyrosine phosphatase  33.1 
 
 		 167 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.248837 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4774  protein tyrosine phosphatase  33.57 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1820  protein tyrosine phosphatase  33.1 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.102898 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5346  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.1 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.524005 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4667  protein tyrosine phosphatase  33.57 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5765  protein tyrosine phosphatase  35.2 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3579  protein tyrosine phosphatase  34.97 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.747703 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5708  protein tyrosine phosphatase  32.05 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1128  putative arsenate reductase (arsenical PUMP modifier) protein  32.7 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6165  protein tyrosine phosphatase  32.85 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.237527 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4965  protein tyrosine phosphatase  34.75 
 
 		 172 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219963  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3195  protein tyrosine phosphatase  34.75 
 
 		 172 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35100  arsenate reductase  36.43 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2337  protein tyrosine phosphatase  38.53 
 
 		 167 aa  77.4  0.00000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.441606 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1532  transcriptional regulator, ArsR family  33.11 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5147  protein tyrosine phosphatase  38.03 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3397  protein tyrosine phosphatase  32.37 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>