225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3987 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3987  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 166 aa  337  4e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000154412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5702  protein tyrosine phosphatase  55.56 
 
 		 173 aa  140  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947024  normal  0.758266 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1017  protein tyrosine phosphatase  55.56 
 
 		 174 aa  138  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.246391  normal  0.0984563 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  38.57 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5345  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.57 
 
 		 164 aa  87.8  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807351  normal  0.94085 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00628  arsenate reductase  39.1 
 
 		 176 aa  87  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.102158  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4054  protein tyrosine phosphatase  39.1 
 
 		 175 aa  84.7  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1583  arsenate reductase  39.86 
 
 		 164 aa  84.3  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3419  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  40.15 
 
 		 175 aa  84.3  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4073  protein tyrosine phosphatase  40.6 
 
 		 175 aa  84  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00713797  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  39.71 
 
 		 287 aa  83.6  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1047  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.1 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5577  protein tyrosine phosphatase  39.57 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.163475 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2415  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.68 
 
 		 176 aa  80.9  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.214614 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0618  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 		 175 aa  80.9  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3341  arsenate reductase  38.24 
 
 		 317 aa  80.9  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2139  protein tyrosine phosphatase  37.96 
 
 		 179 aa  80.9  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1387  arsenate reductase, putative  40 
 
 		 165 aa  80.5  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782064  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1909  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  38.35 
 
 		 175 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1443  protein tyrosine phosphatase  38.52 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.907401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0216  protein tyrosine phosphatase  37.88 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3054  protein tyrosine phosphatase  40.71 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1344  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.24 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.230877  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2516  protein tyrosine phosphatase  38.24 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.69896  hitchhiker  0.0073525 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4381  protein tyrosine phosphatase  36.88 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5056  protein tyrosine phosphatase  37.31 
 
 		 175 aa  77.8  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2640  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  34.07 
 
 		 168 aa  77.4  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.261916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 270 aa  77.4  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2588  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 		 167 aa  77.4  0.00000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.570758  normal  0.260615 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0489  protein tyrosine phosphatase  34.04 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1787  protein tyrosine phosphatase  35.66 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00981569 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0331  protein tyrosine phosphatase  37.32 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.481618 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0699  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.03 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5674  protein tyrosine phosphatase  39.25 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4199  protein tyrosine phosphatase  35.56 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.56112  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5707  protein tyrosine phosphatase  38.32 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3124  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.57 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.641523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0585  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  34.27 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 291 aa  75.1  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0207  protein tyrosine phosphatase  36.36 
 
 		 173 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.538928 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1984  protein tyrosine phosphatase  36.36 
 
 		 177 aa  74.3  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565539  normal  0.702205 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 258 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1594  protein tyrosine phosphatase  37.21 
 
 		 167 aa  74.7  0.0000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0526  ArsR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 276 aa  74.3  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.107472 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  37.21 
 
 		 298 aa  74.3  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0325  protein tyrosine phosphatase  35.51 
 
 		 175 aa  73.6  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3200  protein tyrosine phosphatase  35.04 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0875  protein tyrosine phosphatase  36.5 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0652  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.29 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0644228 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2966  protein tyrosine phosphatase  36.45 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.770903 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0533  arsenate reductase, putative  35.29 
 
 		 171 aa  72  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5377  protein tyrosine phosphatase  34.29 
 
 		 173 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2828  hypothetical protein  38.32 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2337  protein tyrosine phosphatase  38.53 
 
 		 167 aa  70.5  0.000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.441606 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2345  arsenate reductase, putative  34.81 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  36.3 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2216  protein tyrosine phosphatase  39.23 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.415752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2317  protein tyrosine phosphatase  36.3 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3958  protein tyrosine phosphatase  36.96 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.387678 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6165  protein tyrosine phosphatase  36.45 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.237527 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2540  protein tyrosine phosphatase  38.32 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.232269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5147  protein tyrosine phosphatase  37.68 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1641  protein tyrosine phosphatase  32.39 
 
 		 309 aa  68.2  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30690  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.21 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1281  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13220  protein-tyrosine-phosphatase  32.62 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.211639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4215  protein tyrosine phosphatase  36.19 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1980  protein tyrosine phosphatase  41.82 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221335  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3466  protein tyrosine phosphatase  33.58 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6562  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5673  protein tyrosine phosphatase  38.68 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5765  protein tyrosine phosphatase  34.96 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1128  putative arsenate reductase (arsenical PUMP modifier) protein  34.68 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1579  protein tyrosine phosphatase  33.58 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5682  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.04 
 
 		 175 aa  64.3  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.99461  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5722  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.04 
 
 		 175 aa  64.3  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6329  protein tyrosine phosphatase  36.19 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720558  normal  0.0816451 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5600  protein tyrosine phosphatase  36.19 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4774  protein tyrosine phosphatase  34.31 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4667  protein tyrosine phosphatase  34.31 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35100  arsenate reductase  36.92 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3255  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.38 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2141  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.13 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  29.93 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3826  protein tyrosine phosphatase  34.4 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.248837 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.4 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.117198 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1219  protein tyrosine phosphatase  31.88 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6164  protein tyrosine phosphatase  35.24 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.398136 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1820  protein tyrosine phosphatase  35.85 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.102898 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5346  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.87 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.524005 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3579  protein tyrosine phosphatase  34.4 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.747703 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 284 aa  62  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2336  protein tyrosine phosphatase  31.16 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0739912 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3821  protein tyrosine phosphatase  31.16 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  38.71 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0465  protein tyrosine phosphatase  34.53 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000366362  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3119  protein tyrosine phosphatase  34.65 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4965  protein tyrosine phosphatase  36.54 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219963  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3195  protein tyrosine phosphatase  36.54 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>