More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_13220 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_13220  protein-tyrosine-phosphatase  100 
 
 
142 aa  291  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.211639  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  48.91 
 
 
258 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1219  protein tyrosine phosphatase  41.35 
 
 
138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3821  protein tyrosine phosphatase  40.6 
 
 
138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2336  protein tyrosine phosphatase  40.6 
 
 
138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0739912 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3358  ArsR family transcriptional regulator  45.86 
 
 
275 aa  125  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4004  transcriptional regulator, ArsR family protein  42.96 
 
 
270 aa  114  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1484  protein tyrosine phosphatase  43.97 
 
 
138 aa  107  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05104  arsenate reductase  42.06 
 
 
248 aa  100  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2770  protein tyrosine phosphatase  35.92 
 
 
143 aa  98.6  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  36.84 
 
 
139 aa  97.1  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.52 
 
 
146 aa  95.9  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3552  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  40 
 
 
305 aa  94.4  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3330  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
257 aa  91.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5682  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.36 
 
 
175 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.99461  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5722  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.36 
 
 
175 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.57 
 
 
140 aa  89  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35100  arsenate reductase  40.44 
 
 
156 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772564  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2962  arsenate reductase  40.44 
 
 
156 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
270 aa  88.2  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5345  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.81 
 
 
164 aa  87.8  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807351  normal  0.94085 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  36.23 
 
 
154 aa  87.4  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2216  protein tyrosine phosphatase  40.29 
 
 
166 aa  87.4  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.415752  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.53 
 
 
143 aa  86.7  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4073  protein tyrosine phosphatase  37.5 
 
 
175 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00713797  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0216  protein tyrosine phosphatase  39.46 
 
 
178 aa  86.7  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3341  arsenate reductase  37.41 
 
 
317 aa  85.9  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  31.91 
 
 
152 aa  85.1  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2139  protein tyrosine phosphatase  36.81 
 
 
179 aa  84.3  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1928  arsenate reductase  36.03 
 
 
162 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.245596  unclonable  0.00000025949 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  35.42 
 
 
164 aa  83.6  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4054  protein tyrosine phosphatase  37.68 
 
 
175 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1984  protein tyrosine phosphatase  37.86 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565539  normal  0.702205 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  37.14 
 
 
270 aa  82  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3200  protein tyrosine phosphatase  34.97 
 
 
182 aa  82.4  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  38.4 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2588  protein tyrosine phosphatase  37.67 
 
 
167 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.570758  normal  0.260615 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  31.3 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25910  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  38.24 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  32.09 
 
 
150 aa  80.9  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
291 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  37.39 
 
 
142 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3036  protein tyrosine phosphatase  38.97 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294827  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0618  protein tyrosine phosphatase  36.11 
 
 
175 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2398  protein tyrosine phosphatase  38.97 
 
 
156 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798695 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2716  arsenate reductase  38.24 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3054  protein tyrosine phosphatase  36.81 
 
 
165 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  39.42 
 
 
298 aa  79  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
258 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3419  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.42 
 
 
175 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0325  protein tyrosine phosphatase  35.42 
 
 
175 aa  79.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1583  arsenate reductase  34.72 
 
 
164 aa  79  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1047  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.5 
 
 
175 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5577  protein tyrosine phosphatase  35.17 
 
 
175 aa  79.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.163475 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  34.31 
 
 
287 aa  78.6  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  37.8 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1387  arsenate reductase, putative  35.57 
 
 
165 aa  78.2  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782064  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1787  protein tyrosine phosphatase  32.39 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00981569 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2415  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.17 
 
 
176 aa  77.8  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.214614 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  32.31 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5147  protein tyrosine phosphatase  34.56 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1344  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.36 
 
 
165 aa  78.2  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.230877  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3079  protein tyrosine phosphatase  36.76 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0583142  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0909  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  31.06 
 
 
137 aa  77.4  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.101664 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1440  protein tyrosine phosphatase  32.86 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2516  protein tyrosine phosphatase  36.36 
 
 
165 aa  77.8  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.69896  hitchhiker  0.0073525 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1443  protein tyrosine phosphatase  34.78 
 
 
171 aa  77.4  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.907401  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0848  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  31.06 
 
 
137 aa  77.4  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5674  protein tyrosine phosphatase  36.81 
 
 
164 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2539  transcriptional regulator, ArsR family  30.07 
 
 
254 aa  76.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0875  protein tyrosine phosphatase  34.53 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3124  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  34.53 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.641523  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.61 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  33.08 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  30.53 
 
 
137 aa  75.9  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00628  arsenate reductase  33.09 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.102158  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1228  protein tyrosine phosphatase  38.89 
 
 
254 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.699958 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1909  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.77 
 
 
175 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5056  protein tyrosine phosphatase  32.37 
 
 
175 aa  74.3  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  33.03 
 
 
138 aa  73.9  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2345  arsenate reductase, putative  34.56 
 
 
165 aa  73.9  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2540  protein tyrosine phosphatase  37.5 
 
 
179 aa  73.9  0.0000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.232269  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0652  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.58 
 
 
165 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0644228 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  33.58 
 
 
317 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3601  protein tyrosine phosphatase  31.91 
 
 
148 aa  73.6  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.458199 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2828  hypothetical protein  33.56 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  43.21 
 
 
132 aa  73.2  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0526  ArsR family transcriptional regulator  33.1 
 
 
276 aa  72  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.107472 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4199  protein tyrosine phosphatase  34.01 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.56112  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1281  protein tyrosine phosphatase  34.72 
 
 
164 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395414  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30690  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  33.58 
 
 
164 aa  72  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  29.79 
 
 
258 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4381  protein tyrosine phosphatase  37.39 
 
 
171 aa  72  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3397  protein tyrosine phosphatase  33.82 
 
 
174 aa  71.6  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6165  protein tyrosine phosphatase  35.59 
 
 
164 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.237527 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2571  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.86 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0533  arsenate reductase, putative  36.69 
 
 
171 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0489  protein tyrosine phosphatase  33.09 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  35.45 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  31.82 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>