More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3358 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3358  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 275 aa  577  1e-164  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4004  transcriptional regulator, ArsR family protein  65.93 
 
 		 270 aa  376  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3552  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  55.83 
 
 		 305 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05104  arsenate reductase  40.23 
 
 		 248 aa  195  9e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3821  protein tyrosine phosphatase  51.91 
 
 		 138 aa  149  7e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2336  protein tyrosine phosphatase  51.91 
 
 		 138 aa  149  7e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0739912 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1219  protein tyrosine phosphatase  51.91 
 
 		 138 aa  148  8e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  55.86 
 
 		 114 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0417  ArsR family transcriptional regulator  54.05 
 
 		 115 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0532  ArsR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 114 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 114 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1484  protein tyrosine phosphatase  46.62 
 
 		 138 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  50.88 
 
 		 114 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3499  ArsR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 114 aa  129  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  50.88 
 
 		 114 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0532  arsenical resistence operon repressor  51.75 
 
 		 114 aa  127  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 114 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  53.15 
 
 		 115 aa  127  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13220  protein-tyrosine-phosphatase  45.86 
 
 		 142 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.211639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0532  ArsR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 114 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1220  regulatory protein, ArsR  49.11 
 
 		 115 aa  124  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3820  regulatory protein, ArsR  49.11 
 
 		 115 aa  123  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1851  regulatory protein ArsR  50 
 
 		 114 aa  123  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120336  hitchhiker  0.00320391 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2335  ArsR family transcriptional regulator  49.11 
 
 		 115 aa  123  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50.45 
 
 		 143 aa  122  7e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3738  ArsR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 116 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  48.65 
 
 		 139 aa  118  9e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3781  ArsR family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 110 aa  113  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00283923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  48.21 
 
 		 150 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35130  arsenic resistance transcriptional regulator  46.43 
 
 		 116 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.362165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3638  regulatory protein, ArsR  49.07 
 
 		 134 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.45 
 
 		 140 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5146  ArsR family transcriptional regulator  44.92 
 
 		 118 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.426195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.55 
 
 		 139 aa  110  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25920  regulatory protein, ArsR family  42.11 
 
 		 118 aa  110  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2400  ArsR family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 115 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00774399 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3398  ArsR family transcriptional regulator  49.5 
 
 		 114 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.88548  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  40.35 
 
 		 133 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  48.15 
 
 		 117 aa  106  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2770  protein tyrosine phosphatase  40.15 
 
 		 143 aa  105  6e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  40.15 
 
 		 164 aa  105  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.64 
 
 		 146 aa  104  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03333  predicted transcriptional regulator  45.54 
 
 		 113 aa  105  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  42.86 
 
 		 128 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3034  regulatory protein, ArsR  42.98 
 
 		 145 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2718  arsenic resistance transcriptional regulator  43.75 
 
 		 115 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  43.75 
 
 		 143 aa  102  8e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3077  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 115 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3601  protein tyrosine phosphatase  42.61 
 
 		 148 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.458199 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3637  transcriptional regulator of ArsR family protein  45.87 
 
 		 115 aa  99.8  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.227676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  40.37 
 
 		 138 aa  99.4  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2969  ArsR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 120 aa  99.4  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.530376 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  35.86 
 
 		 154 aa  99.4  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.86 
 
 		 144 aa  99  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1608  transcriptional regulator, ArsR family  42.45 
 
 		 124 aa  98.6  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.15786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0848  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.91 
 
 		 137 aa  97.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0909  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.91 
 
 		 137 aa  97.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.101664 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 270 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.67 
 
 		 137 aa  97.4  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3703  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  40.18 
 
 		 117 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0215  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  40.18 
 
 		 117 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.807623 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03350  DNA-binding transcriptional repressor  39.29 
 
 		 117 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449816  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0213  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 		 117 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03303  hypothetical protein  39.29 
 
 		 117 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.521109  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3984  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  39.29 
 
 		 117 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  44.04 
 
 		 258 aa  96.3  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0586  ArsR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 113 aa  95.9  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.516582  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  42.45 
 
 		 148 aa  95.5  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508591  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2953  arsenate reductase  42.34 
 
 		 140 aa  95.1  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0944  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  39.32 
 
 		 113 aa  95.1  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0793455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  38.81 
 
 		 140 aa  94.7  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2713  ArsR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 114 aa  94.7  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3793  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  38.39 
 
 		 117 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.462226 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3281  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  39.32 
 
 		 113 aa  95.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2803  ArsR family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 269 aa  94.4  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3330  ArsR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 257 aa  93.6  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3820  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  39.64 
 
 		 117 aa  94  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4850  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  38.39 
 
 		 117 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3415  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  38.46 
 
 		 113 aa  93.2  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.64554  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 258 aa  93.2  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  40.3 
 
 		 270 aa  92.8  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  38.57 
 
 		 151 aa  92.8  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.18 
 
 		 152 aa  92.8  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.82 
 
 		 117 aa  92.4  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4255  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  37.25 
 
 		 106 aa  92.4  8e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0970362 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  41.96 
 
 		 142 aa  92.4  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40 
 
 		 141 aa  91.3  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164667  normal  0.499641 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  36.19 
 
 		 110 aa  91.7  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  39.57 
 
 		 145 aa  91.3  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2820  protein tyrosine phosphatase  40.38 
 
 		 143 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.12 
 
 		 138 aa  91.7  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35100  arsenate reductase  39.26 
 
 		 156 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  38.85 
 
 		 144 aa  91.3  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  37.32 
 
 		 148 aa  91.3  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  40.35 
 
 		 142 aa  90.9  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2391  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  40.91 
 
 		 106 aa  90.1  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1644  protein tyrosine phosphatase  40.95 
 
 		 144 aa  89.7  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.644428 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  40.91 
 
 		 138 aa  89.7  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2962  arsenate reductase  39.26 
 
 		 156 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>