More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0521 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
140 aa  291  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2953  arsenate reductase  75 
 
 
140 aa  221  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  63.04 
 
 
138 aa  189  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  56.62 
 
 
139 aa  152  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  53.97 
 
 
152 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.91 
 
 
143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1210  arsenate reductase (thioredoxin)  51.59 
 
 
144 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2571  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  53.97 
 
 
137 aa  137  7e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  52.71 
 
 
148 aa  135  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508591  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  52.99 
 
 
150 aa  135  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3324  arsenate reductase  50.38 
 
 
139 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  50.4 
 
 
138 aa  132  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2881  protein tyrosine phosphatase  51.16 
 
 
145 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1440  protein tyrosine phosphatase  51.16 
 
 
147 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  49.62 
 
 
164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  52.42 
 
 
138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50.76 
 
 
138 aa  131  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.8 
 
 
139 aa  129  9e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2820  protein tyrosine phosphatase  48.57 
 
 
143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1911  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  51.59 
 
 
139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000024584  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  47.58 
 
 
137 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0874  protein tyrosine phosphatase  47.06 
 
 
143 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0764045  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3671  protein tyrosine phosphatase  49.64 
 
 
144 aa  125  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.724528  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1644  protein tyrosine phosphatase  48.84 
 
 
144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.644428 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0397  protein tyrosine phosphatase  48.59 
 
 
142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1414  protein tyrosine phosphatase  45.74 
 
 
145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.06 
 
 
140 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1473  protein tyrosine phosphatase  49.23 
 
 
142 aa  123  8.000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2431  arsenate reductase  44.27 
 
 
131 aa  123  9e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1780  protein tyrosine phosphatase  49.23 
 
 
154 aa  122  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0180876  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1703  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 
145 aa  122  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0091  protein tyrosine phosphatase  49.59 
 
 
143 aa  122  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1707  arsenate reductase  47.24 
 
 
134 aa  120  5e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0993958  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0848  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.4 
 
 
137 aa  120  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0465  protein tyrosine phosphatase  51.56 
 
 
142 aa  120  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000366362  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0909  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.4 
 
 
137 aa  120  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.101664 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2033  arsenate reductase (thioredoxin)  55.17 
 
 
132 aa  119  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00780291  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  46.51 
 
 
142 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2793  protein tyrosine phosphatase  44.88 
 
 
144 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2712  protein tyrosine phosphatase  48.41 
 
 
140 aa  119  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3601  protein tyrosine phosphatase  47.29 
 
 
148 aa  119  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.458199 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  45.52 
 
 
151 aa  118  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2022  protein tyrosine phosphatase  51.56 
 
 
142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.571189  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2602  arsenate reductase  45.33 
 
 
188 aa  118  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000913813  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0054  protein tyrosine phosphatase  45.59 
 
 
146 aa  118  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1118  protein tyrosine phosphatase  46.38 
 
 
144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.88 
 
 
146 aa  117  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  45.45 
 
 
141 aa  116  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  47.69 
 
 
132 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1112  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  47.52 
 
 
153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.988044  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0209  arsenate reductase  44.19 
 
 
132 aa  114  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.77 
 
 
141 aa  115  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164667  normal  0.499641 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  41.54 
 
 
150 aa  115  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1734  protein tyrosine phosphatase  50.83 
 
 
127 aa  114  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A11  protein-tyrosine-phosphatase  45.38 
 
 
138 aa  114  5e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.195973  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  54.29 
 
 
258 aa  113  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2919  arsenate reductase  44.19 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.88 
 
 
299 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3201  arsenate reductase  44.19 
 
 
134 aa  110  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  53.33 
 
 
258 aa  110  8.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2963  arsenate reductase  44.19 
 
 
134 aa  110  9e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.341383  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3221  arsenate reductase  44.19 
 
 
134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  40.91 
 
 
142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3207  arsenate reductase  43.41 
 
 
134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468162  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0158  arsenate reductase  41.91 
 
 
134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  46.88 
 
 
299 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  44.44 
 
 
143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2062  arsenate reductase  44.19 
 
 
134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0304  arsenate reductase  41.91 
 
 
134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  44.14 
 
 
148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2971  arsenate reductase  44.19 
 
 
134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000815636  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2898  arsenate reductase  43.41 
 
 
134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.871154  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3196  arsenate reductase  44.19 
 
 
134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.9959  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0826  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  47.24 
 
 
154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0918  protein tyrosine phosphatase  44.2 
 
 
144 aa  108  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1604  arsenate reductase  44 
 
 
134 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40 
 
 
144 aa  107  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2768  protein tyrosine phosphatase  45.26 
 
 
153 aa  106  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  39.37 
 
 
154 aa  104  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2835  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.53 
 
 
287 aa  103  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
284 aa  103  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  42.96 
 
 
145 aa  102  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2770  protein tyrosine phosphatase  39.1 
 
 
143 aa  102  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1228  protein tyrosine phosphatase  43.08 
 
 
254 aa  103  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.699958 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1452  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.44 
 
 
157 aa  102  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00327918  normal  0.121343 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  43.28 
 
 
151 aa  100  8e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  42.52 
 
 
255 aa  100  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0756  protein tyrosine phosphatase  45.11 
 
 
153 aa  99.8  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.686448  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6302  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.62 
 
 
142 aa  99.8  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.819229 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2722  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  40.91 
 
 
130 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2189  arsenate reductase  42.86 
 
 
158 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2141  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.35 
 
 
159 aa  98.2  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3381  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  39.85 
 
 
130 aa  97.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0833218  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2123  arsenate reductase  42.96 
 
 
158 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020679  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4381  protein tyrosine phosphatase  43.48 
 
 
171 aa  97.1  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3397  protein tyrosine phosphatase  39.55 
 
 
174 aa  97.1  8e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3358  ArsR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
275 aa  94.7  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3821  protein tyrosine phosphatase  41.59 
 
 
138 aa  95.1  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2336  protein tyrosine phosphatase  41.59 
 
 
138 aa  95.1  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0739912 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2548  protein tyrosine phosphatase  41.61 
 
 
153 aa  94.7  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.413885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>