More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1930 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  100 
 
 
128 aa  263  5e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25920  regulatory protein, ArsR family  66.1 
 
 
118 aa  156  9e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5146  ArsR family transcriptional regulator  63.56 
 
 
118 aa  155  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.426195  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2400  ArsR family transcriptional regulator  63.16 
 
 
115 aa  155  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00774399 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  59.66 
 
 
258 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3034  regulatory protein, ArsR  55.97 
 
 
145 aa  149  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2718  arsenic resistance transcriptional regulator  63.16 
 
 
115 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3077  ArsR family transcriptional regulator  62.28 
 
 
115 aa  147  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183094  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35130  arsenic resistance transcriptional regulator  62.5 
 
 
116 aa  144  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.362165  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  54.39 
 
 
133 aa  136  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1220  regulatory protein, ArsR  50.43 
 
 
115 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3738  ArsR family transcriptional regulator  53.51 
 
 
116 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1851  regulatory protein ArsR  53.1 
 
 
114 aa  128  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120336  hitchhiker  0.00320391 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  52.21 
 
 
114 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3499  ArsR family transcriptional regulator  53.1 
 
 
114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0532  ArsR family transcriptional regulator  53.1 
 
 
114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  51.75 
 
 
114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  51.75 
 
 
114 aa  124  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3820  regulatory protein, ArsR  50.43 
 
 
115 aa  125  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2335  ArsR family transcriptional regulator  50.43 
 
 
115 aa  125  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  51.75 
 
 
114 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0532  ArsR family transcriptional regulator  55.14 
 
 
114 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  51.75 
 
 
114 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  51.33 
 
 
115 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0417  ArsR family transcriptional regulator  53.7 
 
 
115 aa  122  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  54.13 
 
 
117 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0532  arsenical resistence operon repressor  50.88 
 
 
114 aa  121  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03333  predicted transcriptional regulator  52.63 
 
 
113 aa  119  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3781  ArsR family transcriptional regulator  53.77 
 
 
110 aa  116  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00283923  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  55.88 
 
 
117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0586  ArsR family transcriptional regulator  51.75 
 
 
113 aa  114  6e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.516582  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2819  transcriptional regulator, ArsR family  55.06 
 
 
109 aa  110  6e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2713  ArsR family transcriptional regulator  50.93 
 
 
114 aa  110  7.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3398  ArsR family transcriptional regulator  47.22 
 
 
114 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.88548  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0944  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  49.57 
 
 
113 aa  107  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0793455  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3281  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  49.57 
 
 
113 aa  107  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1608  transcriptional regulator, ArsR family  53.33 
 
 
124 aa  107  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.15786  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00297  transcriptional regulator  53.93 
 
 
111 aa  107  8.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3415  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  48.7 
 
 
113 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.64554  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3638  regulatory protein, ArsR  50 
 
 
134 aa  105  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002125  transcriptional regulator ArsR family  52.81 
 
 
111 aa  105  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1483  ArsR family transcriptional regulator  49.12 
 
 
135 aa  105  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3358  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
275 aa  104  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2969  ArsR family transcriptional regulator  46.96 
 
 
120 aa  103  6e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.530376 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3265  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  51.49 
 
 
140 aa  103  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4850  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  45.22 
 
 
117 aa  103  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3552  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  46.15 
 
 
305 aa  103  8e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3793  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  44.83 
 
 
117 aa  103  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.462226 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0215  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  44.83 
 
 
117 aa  102  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3703  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  44.83 
 
 
117 aa  102  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03350  DNA-binding transcriptional repressor  44.83 
 
 
117 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449816  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0213  transcriptional regulator, ArsR family  44.83 
 
 
117 aa  102  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3820  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  52.17 
 
 
117 aa  102  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4004  transcriptional regulator, ArsR family protein  43.75 
 
 
270 aa  102  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3984  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  44.83 
 
 
117 aa  102  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03303  hypothetical protein  44.83 
 
 
117 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.521109  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  53.19 
 
 
110 aa  101  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3637  transcriptional regulator of ArsR family protein  43.36 
 
 
115 aa  100  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.227676  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1112  regulatory protein, ArsR  50.93 
 
 
134 aa  98.6  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.202553  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2391  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  51.28 
 
 
106 aa  93.2  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4255  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  41.18 
 
 
106 aa  90.1  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0970362 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  50.63 
 
 
125 aa  83.6  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05104  arsenate reductase  36.94 
 
 
248 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  51.9 
 
 
119 aa  81.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  47.5 
 
 
112 aa  80.1  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.25 
 
 
113 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  47.37 
 
 
117 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  44.3 
 
 
104 aa  77.4  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  49.37 
 
 
125 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  52.11 
 
 
123 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  49.37 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1138  regulatory protein, ArsR  41.56 
 
 
89 aa  75.9  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  39.25 
 
 
126 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  52.94 
 
 
113 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2350  transcriptional regulator, ArsR family  46.25 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.917554  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  45.78 
 
 
118 aa  74.7  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1154  transcriptional regulator, ArsR family  50.77 
 
 
113 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303698  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0821  ArsR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  38.68 
 
 
349 aa  73.6  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1224  transcriptional regulator, ArsR family  43.42 
 
 
118 aa  73.6  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  37.72 
 
 
127 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  49.3 
 
 
127 aa  72  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  38.32 
 
 
317 aa  72  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
347 aa  72  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  51.43 
 
 
115 aa  71.2  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  44.93 
 
 
115 aa  70.9  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  41.57 
 
 
122 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
112 aa  70.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
132 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  47.44 
 
 
126 aa  70.9  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  45.68 
 
 
116 aa  70.5  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  55.07 
 
 
125 aa  70.5  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  42.22 
 
 
120 aa  70.1  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.17 
 
 
105 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  48.1 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  43.04 
 
 
120 aa  69.7  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  42.35 
 
 
337 aa  68.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  42.68 
 
 
115 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  49.28 
 
 
124 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  42.35 
 
 
125 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>