More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3820 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E3820  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  100 
 
 		 117 aa  238  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3703  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  98.29 
 
 		 117 aa  232  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0215  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  98.29 
 
 		 117 aa  232  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.807623 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03350  DNA-binding transcriptional repressor  97.44 
 
 		 117 aa  232  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449816  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0213  transcriptional regulator, ArsR family  97.44 
 
 		 117 aa  232  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3984  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  97.44 
 
 		 117 aa  232  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03303  hypothetical protein  97.44 
 
 		 117 aa  232  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.521109  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3793  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  95.73 
 
 		 117 aa  229  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.462226 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4850  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  93.16 
 
 		 117 aa  224  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3265  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  74.34 
 
 		 140 aa  179  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4255  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  60.38 
 
 		 106 aa  147  6e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0970362 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  61.68 
 
 		 110 aa  147  6e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3281  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  62.83 
 
 		 113 aa  146  9e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0944  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  62.83 
 
 		 113 aa  146  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0793455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2391  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  59.43 
 
 		 106 aa  146  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3415  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  61.06 
 
 		 113 aa  142  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.64554  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25920  regulatory protein, ArsR family  60 
 
 		 118 aa  111  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3781  ArsR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 110 aa  111  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00283923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3077  ArsR family transcriptional regulator  59.04 
 
 		 115 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2400  ArsR family transcriptional regulator  60.71 
 
 		 115 aa  108  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00774399 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35130  arsenic resistance transcriptional regulator  55.91 
 
 		 116 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.362165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3034  regulatory protein, ArsR  57.83 
 
 		 145 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  52.53 
 
 		 115 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2718  arsenic resistance transcriptional regulator  56.63 
 
 		 115 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03333  predicted transcriptional regulator  49.06 
 
 		 113 aa  106  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  54.26 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3738  ArsR family transcriptional regulator  53 
 
 		 116 aa  104  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  47.17 
 
 		 114 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00297  transcriptional regulator  49.09 
 
 		 111 aa  104  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  47.17 
 
 		 114 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 114 aa  103  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  57.32 
 
 		 133 aa  103  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  48.15 
 
 		 114 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0417  ArsR family transcriptional regulator  54.76 
 
 		 115 aa  103  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3638  regulatory protein, ArsR  54.88 
 
 		 134 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  52.17 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1220  regulatory protein, ArsR  48 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002125  transcriptional regulator ArsR family  45.45 
 
 		 111 aa  101  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5146  ArsR family transcriptional regulator  54.88 
 
 		 118 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.426195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3499  ArsR family transcriptional regulator  51.81 
 
 		 114 aa  100  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0532  ArsR family transcriptional regulator  51.81 
 
 		 114 aa  100  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2819  transcriptional regulator, ArsR family  53.01 
 
 		 109 aa  100  8e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3820  regulatory protein, ArsR  48 
 
 		 115 aa  100  9e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2335  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 		 115 aa  100  9e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.25 
 
 		 117 aa  99  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0532  ArsR family transcriptional regulator  52.44 
 
 		 114 aa  99.4  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2713  ArsR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 114 aa  99  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1851  regulatory protein ArsR  53.75 
 
 		 114 aa  99  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120336  hitchhiker  0.00320391 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  49 
 
 		 258 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0532  arsenical resistence operon repressor  48.04 
 
 		 114 aa  97.4  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3398  ArsR family transcriptional regulator  51.19 
 
 		 114 aa  96.3  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.88548  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0586  ArsR family transcriptional regulator  53.66 
 
 		 113 aa  96.3  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.516582  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3358  ArsR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 275 aa  94  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4004  transcriptional regulator, ArsR family protein  50 
 
 		 270 aa  94  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3552  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  43.56 
 
 		 305 aa  92.4  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  56.58 
 
 		 117 aa  91.7  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05104  arsenate reductase  48.75 
 
 		 248 aa  90.5  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1608  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 		 124 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.15786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3637  transcriptional regulator of ArsR family protein  56.41 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.227676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1112  regulatory protein, ArsR  54.12 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.202553  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2969  ArsR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 120 aa  87.8  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.530376 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1483  ArsR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  52.78 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1407  regulatory protein, ArsR  36.78 
 
 		 92 aa  77  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1154  transcriptional regulator, ArsR family  48.05 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303698  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  49.37 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1075  ArsR family transcriptional regulator  38 
 
 		 107 aa  74.7  0.0000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000458748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3941  regulatory protein ArsR  42.5 
 
 		 99 aa  74.3  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2350  transcriptional regulator, ArsR family  51.39 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.917554  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3418  regulatory protein ArsR  42.5 
 
 		 99 aa  73.9  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.799155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1138  regulatory protein, ArsR  44.3 
 
 		 89 aa  73.9  0.0000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  47.22 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  47.89 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  41.44 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1386  ArsR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.705753 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  49.35 
 
 		 115 aa  71.6  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 125 aa  70.1  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4201  ArsR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 94 aa  70.1  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314782  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2563  transcriptional regulator, ArsR family  54.69 
 
 		 112 aa  70.1  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000881945  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  46.88 
 
 		 95 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3414  ArsR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.91457 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  50.75 
 
 		 113 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  48.53 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  46.97 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  46.97 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2033  regulatory protein ArsR  42.39 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.0000000453707  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0208  transcriptional regulator, ArsR family  45.95 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  37.5 
 
 		 336 aa  68.6  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  45.71 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1936  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1644  ArsR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  49.32 
 
 		 349 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>