More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2350 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2350  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 112 aa  229  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.917554  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  96.43 
 
 		 112 aa  217  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  61.95 
 
 		 113 aa  140  6e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2952  ArsR family transcriptional regulator  57.52 
 
 		 113 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0522  ArsR family transcriptional regulator  56.64 
 
 		 113 aa  114  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1154  transcriptional regulator, ArsR family  47.37 
 
 		 113 aa  105  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303698  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 127 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  46.23 
 
 		 115 aa  93.6  8e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1845  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 138 aa  92.8  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  38.39 
 
 		 117 aa  91.3  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  46.9 
 
 		 112 aa  90.9  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  48.45 
 
 		 117 aa  89  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1301  transcriptional regulator, ArsR family  44.74 
 
 		 112 aa  86.7  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3820  regulatory protein, ArsR  44.9 
 
 		 115 aa  85.1  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2335  ArsR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 115 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1220  regulatory protein, ArsR  51.32 
 
 		 115 aa  84.7  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  55.41 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2391  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  56.58 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2563  transcriptional regulator, ArsR family  60.94 
 
 		 112 aa  80.5  0.000000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000881945  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1138  regulatory protein, ArsR  48.68 
 
 		 89 aa  78.2  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0532  ArsR family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 115 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  51.43 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_876  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3781  ArsR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00283923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0944  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  50 
 
 		 113 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0793455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  51.43 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3281  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  50 
 
 		 113 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  51.43 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3415  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  50 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.64554  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0532  arsenical resistence operon repressor  52.05 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3265  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  43.24 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4255  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  52.63 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0970362 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2876  ArsR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.557946  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3499  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0532  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  41.41 
 
 		 307 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  46.25 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0821  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0892  ArsR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3738  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 116 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1851  regulatory protein ArsR  46.48 
 
 		 114 aa  74.3  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120336  hitchhiker  0.00320391 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03350  DNA-binding transcriptional repressor  51.39 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449816  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0213  transcriptional regulator, ArsR family  51.39 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03303  hypothetical protein  51.39 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.521109  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3703  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  51.39 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3820  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  51.39 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3793  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  51.39 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.462226 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0215  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  51.39 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3984  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  51.39 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4850  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  51.39 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25920  regulatory protein, ArsR family  45.88 
 
 		 118 aa  73.6  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00297  transcriptional regulator  35.4 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03333  predicted transcriptional regulator  44.59 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2713  ArsR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35130  arsenic resistance transcriptional regulator  44.74 
 
 		 116 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.362165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  49.28 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002125  transcriptional regulator ArsR family  42.53 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  46.67 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 317 aa  70.5  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5146  ArsR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 118 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.426195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  47.22 
 
 		 98 aa  70.1  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0417  ArsR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 115 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  44.87 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2969  ArsR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.530376 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2718  arsenic resistance transcriptional regulator  43.42 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  40.21 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2400  ArsR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00774399 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  45.78 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3638  regulatory protein, ArsR  44.44 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3077  ArsR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  43.01 
 
 		 307 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 348 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1872  ArsR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3034  regulatory protein, ArsR  43.42 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3398  ArsR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.88548  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0936  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00366082  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0567  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.702064 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0586  ArsR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 113 aa  67  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.516582  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 127 aa  67  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2819  transcriptional regulator, ArsR family  45.07 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1821  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 121 aa  67  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.321191  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  44.29 
 
 		 93 aa  66.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  40.91 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  40.91 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3418  regulatory protein ArsR  43.42 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.799155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  42.65 
 
 		 95 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>