More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2579 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
312 aa  624  1e-178  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  75.64 
 
 
307 aa  477  1e-133  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  68.59 
 
 
348 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  63.23 
 
 
307 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  48.5 
 
 
309 aa  278  9e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2305  transcriptional regulator, ArsR family  47.88 
 
 
311 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0356  ArsR family transcriptional regulator  44.48 
 
 
304 aa  219  7e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.208931  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  44.29 
 
 
305 aa  217  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  41.52 
 
 
310 aa  207  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  40.27 
 
 
306 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  40.83 
 
 
307 aa  195  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
309 aa  193  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  40.14 
 
 
305 aa  191  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
317 aa  157  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  38.6 
 
 
340 aa  154  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  37.27 
 
 
330 aa  149  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  35.74 
 
 
328 aa  149  9e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1067  transcriptional regulator, ArsR family  34.14 
 
 
305 aa  145  8.000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.420275 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  35.15 
 
 
339 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  35.69 
 
 
312 aa  143  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  36.92 
 
 
335 aa  142  5e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  36.9 
 
 
349 aa  142  8e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  34.83 
 
 
354 aa  140  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  32.75 
 
 
337 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  34.83 
 
 
349 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
327 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  34.36 
 
 
342 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2402  ArsR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
323 aa  135  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3410  ArsR family transcriptional regulator  35.07 
 
 
329 aa  135  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0187563  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0808  transcriptional regulator, ArsR family  34.01 
 
 
324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.203378 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  35.02 
 
 
341 aa  132  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05540  ArsR family regulatory protein  33.22 
 
 
336 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  33.89 
 
 
341 aa  130  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
328 aa  127  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  29.72 
 
 
341 aa  124  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  32.75 
 
 
334 aa  123  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  30.95 
 
 
341 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  31.12 
 
 
341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
341 aa  120  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0160  methyltransferase type 11  35.46 
 
 
322 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0747842 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  30.82 
 
 
341 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0471  ArsR family transcriptional regulator  28.82 
 
 
335 aa  119  7.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.421006  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0650  putative transcriptional regulator  31.8 
 
 
329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  39.46 
 
 
212 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3041  methyltransferase type 11  30.31 
 
 
333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2116  methyltransferase type 11  32.2 
 
 
340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.126777 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0384  transcriptional regulator, ArsR family  32.5 
 
 
331 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07110  ArsR family transcriptional regulator  31.8 
 
 
333 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4966  ArsR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
330 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4839  ArsR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
330 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5015  ArsR family transcriptional regulator  31.23 
 
 
330 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.1667 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0155  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
326 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0500  ArsR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
330 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0162  transcriptional regulator, ArsR family  36.46 
 
 
326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0173  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4793  regulatory protein, ArsR  31.16 
 
 
331 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5268  ArsR family transcriptional regulator  29.33 
 
 
331 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149036  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  31.18 
 
 
206 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  29.57 
 
 
206 aa  93.6  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.95 
 
 
207 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  29.37 
 
 
309 aa  90.1  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.95 
 
 
207 aa  90.1  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  33.9 
 
 
210 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  29.07 
 
 
331 aa  82  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.57 
 
 
420 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1232  ArsR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1265  transcriptional regulator  27.27 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  29.64 
 
 
355 aa  77  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1238  methyltransferase type 11  29.52 
 
 
219 aa  76.6  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2029  Methyltransferase type 12  32.63 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  40.35 
 
 
227 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  46.81 
 
 
299 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3111  Methyltransferase type 11  42.55 
 
 
241 aa  74.7  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  38.84 
 
 
273 aa  73.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  30.92 
 
 
213 aa  72  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  30.41 
 
 
218 aa  71.6  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  51.43 
 
 
117 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  40.59 
 
 
236 aa  70.9  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1392  putative S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  27.49 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0586874  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00196  biotin synthesis protein  38.84 
 
 
232 aa  70.1  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.505545  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0532  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
114 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  55.22 
 
 
115 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3499  ArsR family transcriptional regulator  40.22 
 
 
114 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2043  methyltransferase type 11  39.42 
 
 
249 aa  69.7  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  55.22 
 
 
114 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  39.78 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
209 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  28.98 
 
 
209 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0680  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.33 
 
 
239 aa  68.2  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  39.6 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  27.93 
 
 
219 aa  67  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0673  methyltransferase type 11  37.01 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
114 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  29.89 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  35.21 
 
 
219 aa  67.4  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
114 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  36.42 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  50 
 
 
114 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  50 
 
 
114 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>