More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1121 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 340 aa  669    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  76.04 
 
 		 335 aa  429  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  58.18 
 
 		 339 aa  332  5e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  53.59 
 
 		 327 aa  327  3e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  58.52 
 
 		 349 aa  327  3e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  53.89 
 
 		 328 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  53.35 
 
 		 341 aa  324  2e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  56.15 
 
 		 342 aa  323  2e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  54.98 
 
 		 349 aa  324  2e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  53.04 
 
 		 341 aa  323  3e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  56.15 
 
 		 354 aa  323  3e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  52.4 
 
 		 341 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  48.6 
 
 		 337 aa  311  1e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  51.1 
 
 		 341 aa  292  6e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  50.64 
 
 		 341 aa  285  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  49.68 
 
 		 341 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2116  methyltransferase type 11  49.54 
 
 		 340 aa  279  4e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126777 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  53.4 
 
 		 330 aa  277  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  46.73 
 
 		 317 aa  276  3e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  51.13 
 
 		 337 aa  275  7e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3410  ArsR family transcriptional regulator  47.2 
 
 		 329 aa  248  9e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0187563  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0808  transcriptional regulator, ArsR family  49.2 
 
 		 324 aa  248  1e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.203378 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2402  ArsR family transcriptional regulator  47.85 
 
 		 323 aa  210  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 341 aa  207  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 312 aa  169  5e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  37.41 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  36.45 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 348 aa  158  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  36.52 
 
 		 305 aa  155  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  35.99 
 
 		 307 aa  153  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 309 aa  152  8e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  35.69 
 
 		 310 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  34.98 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  35.11 
 
 		 305 aa  145  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  34.75 
 
 		 307 aa  144  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  37.01 
 
 		 331 aa  135  7.000000000000001e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2305  transcriptional regulator, ArsR family  36.43 
 
 		 311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  35.35 
 
 		 309 aa  132  6e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1067  transcriptional regulator, ArsR family  29.03 
 
 		 305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.420275 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0356  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 304 aa  122  7e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.208931  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1265  transcriptional regulator  32.78 
 
 		 309 aa  119  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1232  ArsR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 309 aa  119  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05540  ArsR family regulatory protein  35.29 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0173  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 326 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0160  methyltransferase type 11  37.1 
 
 		 322 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0747842 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0650  putative transcriptional regulator  31.7 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0162  transcriptional regulator, ArsR family  35.08 
 
 		 326 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0155  ArsR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 326 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07110  ArsR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5015  ArsR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1667 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4966  ArsR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 330 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 334 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4839  ArsR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 330 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0471  ArsR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 335 aa  95.5  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.421006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  33.14 
 
 		 206 aa  94.7  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.43 
 
 		 420 aa  93.2  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0500  ArsR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 330 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3041  methyltransferase type 11  26.64 
 
 		 333 aa  92  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4793  regulatory protein, ArsR  31.08 
 
 		 331 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0384  transcriptional regulator, ArsR family  30.41 
 
 		 331 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.92 
 
 		 207 aa  87.8  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.92 
 
 		 207 aa  86.7  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  32.56 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5268  ArsR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0798  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.16 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 212 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  28.06 
 
 		 355 aa  72  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  33.74 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  31.43 
 
 		 117 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  36 
 
 		 250 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  31.55 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  38 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  33.05 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  30.54 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1029  methyltransferase type 11  32.34 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2906  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  28.32 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.96 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2723  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 200 aa  65.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.47 
 
 		 250 aa  65.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.35 
 
 		 201 aa  65.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.96 
 
 		 277 aa  65.5  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.96 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  27.95 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  30.35 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0549  Methyltransferase type 11  28.65 
 
 		 201 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  39.8 
 
 		 117 aa  64.7  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  36.19 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0251  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.06 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  27.95 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2290  Methyltransferase type 11  29.31 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2339  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  23.6 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260847 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2811  Methyltransferase type 11  31.06 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.481855  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  28.18 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  34 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.3 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  35.51 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0204  Methyltransferase type 12  24.56 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>