More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01234 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  100 
 
 		 331 aa  660    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  91.91 
 
 		 309 aa  546  1e-154  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1232  ArsR family transcriptional regulator  88.35 
 
 		 309 aa  525  1e-148  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1265  transcriptional regulator  88.35 
 
 		 309 aa  525  1e-148  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 312 aa  181  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1067  transcriptional regulator, ArsR family  34.32 
 
 		 305 aa  170  4e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.420275 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 337 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  36.65 
 
 		 328 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 339 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  36.01 
 
 		 349 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 342 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  36.01 
 
 		 354 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  36.11 
 
 		 341 aa  132  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 341 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  32.79 
 
 		 349 aa  130  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  36.3 
 
 		 335 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 340 aa  129  9.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  33.97 
 
 		 306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  32.69 
 
 		 309 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 337 aa  125  9e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  34.65 
 
 		 310 aa  124  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0160  methyltransferase type 11  38.35 
 
 		 322 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0747842 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  34.08 
 
 		 330 aa  120  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 317 aa  118  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  33.92 
 
 		 341 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  35.27 
 
 		 305 aa  116  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2305  transcriptional regulator, ArsR family  33.81 
 
 		 311 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  33.68 
 
 		 341 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  32.49 
 
 		 341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  31.1 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  31.77 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0173  transcriptional regulator, ArsR family  36.69 
 
 		 326 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 		 341 aa  105  9e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0162  transcriptional regulator, ArsR family  33.94 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  28.83 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0808  transcriptional regulator, ArsR family  31.62 
 
 		 324 aa  103  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.203378 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0155  ArsR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 326 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2402  ArsR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 323 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 348 aa  100  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3410  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 329 aa  97.8  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0187563  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 309 aa  97.4  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  27.96 
 
 		 307 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0471  ArsR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 335 aa  95.9  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.421006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2116  methyltransferase type 11  32.23 
 
 		 340 aa  95.5  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126777 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  29.07 
 
 		 312 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 328 aa  90.9  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 334 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0650  putative transcriptional regulator  30.74 
 
 		 329 aa  87  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07110  ArsR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 333 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0356  ArsR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.208931  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0384  transcriptional regulator, ArsR family  31.85 
 
 		 331 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05540  ArsR family regulatory protein  31.16 
 
 		 336 aa  84.3  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5268  ArsR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4793  regulatory protein, ArsR  31.97 
 
 		 331 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  36.42 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3041  methyltransferase type 11  26.37 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  33.52 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.52 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  27.21 
 
 		 355 aa  73.6  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5015  ArsR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 330 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1667 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  30.07 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4966  ArsR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  42.48 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4839  ArsR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  30.95 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3259  methyltransferase type 11  36.42 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.95 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0500  ArsR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2522  Methyltransferase type 11  33.78 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0795071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  45.71 
 
 		 265 aa  68.9  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  37.42 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  39.39 
 
 		 275 aa  68.6  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.41 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0972  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.15 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 196 aa  68.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  36.92 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.72 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  31.08 
 
 		 243 aa  67  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0454  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.48 
 
 		 256 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0799871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5061  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.73 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0387  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.9 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.74 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.24 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  37.61 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  37.61 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5011  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.48 
 
 		 256 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  29.08 
 
 		 206 aa  65.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 117 aa  65.1  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  38.6 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4885  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.48 
 
 		 256 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  38.6 
 
 		 256 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6211  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  33.73 
 
 		 225 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  39.05 
 
 		 114 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  38.6 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  37.74 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1318  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  38.4 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000587821  hitchhiker  0.0091617 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>