More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3410 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3410  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 329 aa  646    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0187563  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  47.6 
 
 		 337 aa  289  4e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  52.73 
 
 		 328 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  50.78 
 
 		 327 aa  281  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  52.75 
 
 		 317 aa  281  1e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 341 aa  277  2e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  51.95 
 
 		 339 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  45.06 
 
 		 341 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  45.26 
 
 		 341 aa  271  9e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  44.14 
 
 		 341 aa  270  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  44.65 
 
 		 341 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  49.53 
 
 		 342 aa  267  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  52.09 
 
 		 330 aa  266  2.9999999999999995e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  50 
 
 		 349 aa  263  3e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 354 aa  263  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  49.07 
 
 		 349 aa  253  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2116  methyltransferase type 11  46.65 
 
 		 340 aa  249  6e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126777 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  45.86 
 
 		 341 aa  248  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0808  transcriptional regulator, ArsR family  49.69 
 
 		 324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.203378 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  47.2 
 
 		 340 aa  233  3e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  50.16 
 
 		 335 aa  229  4e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  45.34 
 
 		 337 aa  224  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2402  ArsR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 323 aa  211  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 341 aa  201  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 328 aa  192  5e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  35.14 
 
 		 309 aa  169  5e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  35.64 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  35.07 
 
 		 312 aa  145  9e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 348 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 307 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  34.27 
 
 		 306 aa  142  6e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  34.32 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  30.41 
 
 		 310 aa  136  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  34.72 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  32.76 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4793  regulatory protein, ArsR  32.48 
 
 		 331 aa  122  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3041  methyltransferase type 11  30.66 
 
 		 333 aa  122  6e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 334 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0650  putative transcriptional regulator  34.39 
 
 		 329 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07110  ArsR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 333 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5268  ArsR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 331 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149036  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4966  ArsR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 330 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5015  ArsR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 330 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1667 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4839  ArsR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 330 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2305  transcriptional regulator, ArsR family  33.99 
 
 		 311 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0384  transcriptional regulator, ArsR family  31.85 
 
 		 331 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0500  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 330 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1067  transcriptional regulator, ArsR family  31.34 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.420275 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05540  ArsR family regulatory protein  30.86 
 
 		 336 aa  109  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0471  ArsR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 335 aa  106  7e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.421006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0356  ArsR family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 304 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.208931  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  34.15 
 
 		 331 aa  98.2  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  33.1 
 
 		 309 aa  97.4  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 312 aa  95.9  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0160  methyltransferase type 11  34.77 
 
 		 322 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0747842 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1232  ArsR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 309 aa  86.3  6e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1265  transcriptional regulator  31.34 
 
 		 309 aa  86.3  6e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  33.15 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  29.35 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.12 
 
 		 420 aa  75.1  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.47 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0173  transcriptional regulator, ArsR family  32.15 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.47 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  34.93 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  29.24 
 
 		 206 aa  71.6  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  26.59 
 
 		 355 aa  70.1  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0162  transcriptional regulator, ArsR family  32.04 
 
 		 326 aa  69.7  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  39.19 
 
 		 119 aa  67.4  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0155  ArsR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  30.05 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  29.89 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  47.95 
 
 		 117 aa  63.9  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03350  DNA-binding transcriptional repressor  43.9 
 
 		 117 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449816  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0213  transcriptional regulator, ArsR family  43.9 
 
 		 117 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3820  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  43.9 
 
 		 117 aa  63.5  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03303  hypothetical protein  43.9 
 
 		 117 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.521109  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3703  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  43.9 
 
 		 117 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3984  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  43.9 
 
 		 117 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0215  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  43.9 
 
 		 117 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3793  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  45.21 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.462226 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4850  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  45.21 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  36.46 
 
 		 117 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  31.07 
 
 		 258 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  36.45 
 
 		 283 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3265  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  41.75 
 
 		 140 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 115 aa  61.2  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  44.44 
 
 		 133 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3430  Methyltransferase type 12  40 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 		 283 aa  62  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0559  regulatory protein, ArsR  44.93 
 
 		 123 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0567484  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  45.71 
 
 		 112 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  28.09 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.51 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.8 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  32.82 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0193071 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>