More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C3265 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C3265  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  100 
 
 
140 aa  290  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03350  DNA-binding transcriptional repressor  76.32 
 
 
117 aa  185  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449816  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0213  transcriptional regulator, ArsR family  76.32 
 
 
117 aa  185  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3984  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  76.32 
 
 
117 aa  185  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03303  hypothetical protein  76.32 
 
 
117 aa  185  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.521109  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3703  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  75.44 
 
 
117 aa  184  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3793  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  76.32 
 
 
117 aa  184  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.462226 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0215  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  75.44 
 
 
117 aa  184  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4850  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  77.19 
 
 
117 aa  183  7e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3820  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  74.34 
 
 
117 aa  179  8.000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3281  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  67.26 
 
 
113 aa  159  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0944  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  67.26 
 
 
113 aa  159  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0793455  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3415  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  65.49 
 
 
113 aa  155  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.64554  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  69.31 
 
 
110 aa  152  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4255  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  59.43 
 
 
106 aa  144  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0970362 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2391  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  58.49 
 
 
106 aa  141  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  53.68 
 
 
115 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3034  regulatory protein, ArsR  53.68 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3781  ArsR family transcriptional regulator  52.94 
 
 
110 aa  110  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00283923  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25920  regulatory protein, ArsR family  46.02 
 
 
118 aa  110  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03333  predicted transcriptional regulator  51.89 
 
 
113 aa  110  9e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3077  ArsR family transcriptional regulator  57.14 
 
 
115 aa  110  9e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183094  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2718  arsenic resistance transcriptional regulator  57.14 
 
 
115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  60 
 
 
114 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3738  ArsR family transcriptional regulator  46.09 
 
 
116 aa  108  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0417  ArsR family transcriptional regulator  58.54 
 
 
115 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35130  arsenic resistance transcriptional regulator  54.17 
 
 
116 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.362165  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2400  ArsR family transcriptional regulator  58.33 
 
 
115 aa  104  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00774399 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  50 
 
 
133 aa  104  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3638  regulatory protein, ArsR  45.95 
 
 
134 aa  104  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  51.49 
 
 
128 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0532  ArsR family transcriptional regulator  51.76 
 
 
114 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2713  ArsR family transcriptional regulator  57.65 
 
 
114 aa  101  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  55.81 
 
 
117 aa  100  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  48 
 
 
114 aa  100  9e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 
114 aa  99.4  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  48 
 
 
114 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3499  ArsR family transcriptional regulator  50.59 
 
 
114 aa  99.4  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0532  ArsR family transcriptional regulator  53.75 
 
 
114 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3398  ArsR family transcriptional regulator  53.57 
 
 
114 aa  98.2  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.88548  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  53.66 
 
 
114 aa  98.6  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5146  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
118 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.426195  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1220  regulatory protein, ArsR  50 
 
 
115 aa  97.4  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1851  regulatory protein ArsR  53.16 
 
 
114 aa  97.1  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120336  hitchhiker  0.00320391 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3820  regulatory protein, ArsR  50 
 
 
115 aa  95.9  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00297  transcriptional regulator  46.73 
 
 
111 aa  95.9  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002125  transcriptional regulator ArsR family  46.73 
 
 
111 aa  95.9  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2335  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
115 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0532  arsenical resistence operon repressor  51.22 
 
 
114 aa  94.7  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 
258 aa  94  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2819  transcriptional regulator, ArsR family  53.16 
 
 
109 aa  93.6  7e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3552  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.12 
 
 
305 aa  93.6  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3637  transcriptional regulator of ArsR family protein  51.81 
 
 
115 aa  92  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.227676  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1483  ArsR family transcriptional regulator  42.98 
 
 
135 aa  90.5  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0586  ArsR family transcriptional regulator  42.99 
 
 
113 aa  89.7  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.516582  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3358  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
275 aa  89  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4004  transcriptional regulator, ArsR family protein  46.99 
 
 
270 aa  89  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1608  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
124 aa  89.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.15786  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  53.95 
 
 
117 aa  89  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05104  arsenate reductase  40.4 
 
 
248 aa  88.2  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1112  regulatory protein, ArsR  54.02 
 
 
134 aa  86.7  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.202553  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2969  ArsR family transcriptional regulator  41.51 
 
 
120 aa  85.9  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.530376 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  45.05 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1138  regulatory protein, ArsR  43.53 
 
 
89 aa  80.1  0.000000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1154  transcriptional regulator, ArsR family  56.06 
 
 
113 aa  79  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303698  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2350  transcriptional regulator, ArsR family  43.24 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.917554  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  50.63 
 
 
115 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  40.95 
 
 
337 aa  75.1  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  49.37 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  47.89 
 
 
119 aa  73.9  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  45.12 
 
 
123 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  40.2 
 
 
125 aa  73.6  0.0000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3418  regulatory protein ArsR  37.93 
 
 
99 aa  72.8  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.799155  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  43.66 
 
 
104 aa  72.4  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 
125 aa  72  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  47.78 
 
 
111 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  47.78 
 
 
111 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3941  regulatory protein ArsR  39.02 
 
 
99 aa  72.4  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2563  transcriptional regulator, ArsR family  56.25 
 
 
112 aa  71.2  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000881945  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  49.28 
 
 
121 aa  71.2  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1301  transcriptional regulator, ArsR family  43.62 
 
 
112 aa  70.9  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
110 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  47.14 
 
 
113 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  48.61 
 
 
108 aa  68.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4201  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
94 aa  68.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314782  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  46.88 
 
 
95 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1407  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 
92 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142872  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0936  transcriptional regulator, ArsR family  39.33 
 
 
103 aa  68.6  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00366082  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  50.72 
 
 
112 aa  68.2  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 
112 aa  68.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
328 aa  67.8  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  48.53 
 
 
327 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
105 aa  67.4  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 
117 aa  67.4  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  45.71 
 
 
183 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  36.04 
 
 
317 aa  67.4  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.66 
 
 
113 aa  67  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 
127 aa  67  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3359  ArsR family transcriptional regulator  47.69 
 
 
107 aa  67  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  44.12 
 
 
126 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>