More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0173 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0173  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
326 aa  609  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0162  transcriptional regulator, ArsR family  98.16 
 
 
326 aa  597  1e-169  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0155  ArsR family transcriptional regulator  97.73 
 
 
326 aa  484  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0160  methyltransferase type 11  72.92 
 
 
322 aa  378  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0747842 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  38.64 
 
 
307 aa  158  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  37.66 
 
 
307 aa  156  6e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  38.49 
 
 
305 aa  149  6e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  35.69 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
348 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 
312 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  38.57 
 
 
342 aa  140  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  36.48 
 
 
309 aa  139  7e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  34.85 
 
 
310 aa  138  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  39.46 
 
 
354 aa  138  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  37.46 
 
 
317 aa  138  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  36.55 
 
 
307 aa  138  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  38.05 
 
 
327 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  39.46 
 
 
349 aa  137  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  37.02 
 
 
305 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  37.06 
 
 
328 aa  135  9e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  38.13 
 
 
309 aa  134  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  38.26 
 
 
340 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  38.8 
 
 
339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  36.81 
 
 
341 aa  128  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0356  ArsR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.208931  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  36.69 
 
 
331 aa  124  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  35.56 
 
 
306 aa  124  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
337 aa  124  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  33.56 
 
 
341 aa  122  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  32.36 
 
 
312 aa  122  7e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  36.1 
 
 
330 aa  122  8e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2305  transcriptional regulator, ArsR family  36.49 
 
 
311 aa  120  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1265  transcriptional regulator  35.02 
 
 
309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1232  ArsR family transcriptional regulator  35.02 
 
 
309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
341 aa  119  7.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  34.63 
 
 
341 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  35.84 
 
 
335 aa  117  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  36.51 
 
 
349 aa  117  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  32.36 
 
 
341 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0650  putative transcriptional regulator  35.31 
 
 
329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07110  ArsR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  34.8 
 
 
341 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1067  transcriptional regulator, ArsR family  31.8 
 
 
305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.420275 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05540  ArsR family regulatory protein  36.69 
 
 
336 aa  113  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0808  transcriptional regulator, ArsR family  37.87 
 
 
324 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.203378 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2402  ArsR family transcriptional regulator  34.42 
 
 
323 aa  109  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  35.07 
 
 
328 aa  108  9.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5268  ArsR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
331 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149036  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2116  methyltransferase type 11  32.69 
 
 
340 aa  103  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.126777 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
334 aa  103  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0384  transcriptional regulator, ArsR family  34.98 
 
 
331 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
337 aa  98.6  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4966  ArsR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
330 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5015  ArsR family transcriptional regulator  33.22 
 
 
330 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.1667 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0471  ArsR family transcriptional regulator  27.54 
 
 
335 aa  98.2  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.421006  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4839  ArsR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
330 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  33.87 
 
 
206 aa  97.4  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4793  regulatory protein, ArsR  34.86 
 
 
331 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0500  ArsR family transcriptional regulator  32.55 
 
 
330 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  31.96 
 
 
206 aa  94.4  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.7 
 
 
207 aa  91.7  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.14 
 
 
207 aa  88.6  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3410  ArsR family transcriptional regulator  34.51 
 
 
329 aa  88.2  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0187563  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  31.42 
 
 
355 aa  84.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3041  methyltransferase type 11  28.03 
 
 
333 aa  84.3  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.42 
 
 
420 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  35.75 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  36.63 
 
 
319 aa  80.1  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  47.71 
 
 
305 aa  79.7  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  33.84 
 
 
210 aa  79.7  0.00000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  32.37 
 
 
218 aa  77.4  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  37.01 
 
 
225 aa  76.3  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  47.47 
 
 
252 aa  74.3  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  33.02 
 
 
211 aa  73.6  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  30.87 
 
 
238 aa  73.2  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  42.55 
 
 
269 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1392  putative S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  31.76 
 
 
208 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0586874  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  47.42 
 
 
257 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.19 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  34.16 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  33.88 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5792  Methyltransferase type 11  44 
 
 
239 aa  70.1  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2133  methyltransferase type 11  39.32 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.917807  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.23 
 
 
250 aa  69.3  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  27.68 
 
 
219 aa  69.3  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1066  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.36 
 
 
269 aa  69.3  0.00000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  37.97 
 
 
244 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  33.88 
 
 
263 aa  68.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0559  methyltransferase type 11  40 
 
 
216 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.95 
 
 
244 aa  68.9  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.86 
 
 
233 aa  68.6  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  33.15 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2089  putative methyltransferase  38.36 
 
 
1014 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0627261  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  42.74 
 
 
272 aa  67.8  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4278  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 
186 aa  67.8  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.867588  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  43.88 
 
 
236 aa  67.8  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  36.22 
 
 
277 aa  67.4  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1004  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.36 
 
 
247 aa  67.4  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.202483  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  38.81 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>