More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_12280 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  100 
 
 		 236 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  63.36 
 
 		 236 aa  309  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  56.47 
 
 		 260 aa  261  6.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  55.32 
 
 		 252 aa  236  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  52.36 
 
 		 257 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  50.83 
 
 		 244 aa  171  6.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0699  Methyltransferase type 11  44.39 
 
 		 231 aa  161  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0634895  normal  0.912408 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  37.75 
 
 		 235 aa  157  9e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.61 
 
 		 238 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.12 
 
 		 236 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  37.56 
 
 		 235 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2481  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  37.25 
 
 		 235 aa  156  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.817194 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  36.71 
 
 		 250 aa  154  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  37.25 
 
 		 238 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  38.83 
 
 		 237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  39.91 
 
 		 239 aa  140  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06424  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.83 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  40.59 
 
 		 266 aa  132  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 233 aa  128  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  38.12 
 
 		 259 aa  125  7e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  34.93 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  38.91 
 
 		 243 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 243 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  38.92 
 
 		 246 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  38.42 
 
 		 246 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6010  methyltransferase type 11  38.42 
 
 		 246 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2327  methylase  32.86 
 
 		 241 aa  102  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.102662  normal  0.330615 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1955  methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 219 aa  98.6  7e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  35.94 
 
 		 276 aa  91.7  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  29.55 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  27.98 
 
 		 243 aa  90.1  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  36.15 
 
 		 262 aa  89  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  34.95 
 
 		 251 aa  88.6  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0533  methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 243 aa  88.2  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  33.8 
 
 		 362 aa  88.2  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  30.49 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0656  hypothetical protein  30.05 
 
 		 243 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0241729  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  45.92 
 
 		 268 aa  86.7  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4681  hypothetical protein  29.53 
 
 		 243 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.740312  hitchhiker  1.6173199999999999e-21 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2436  Methyltransferase type 11  34.58 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.42 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 348 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  44.66 
 
 		 312 aa  82  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  30.41 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0747  hypothetical protein  29.53 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000483257  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  28.44 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  41.41 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  31.94 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0585  hypothetical protein  30.3 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  35.68 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0619  hypothetical protein  30.3 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  34.27 
 
 		 286 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  38.41 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0687  hypothetical protein  29.26 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0529  methyltransferase  30.3 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0674  hypothetical protein  30.3 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.30135e-22 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  36.78 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2960  Methyltransferase type 11  30.84 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.306356 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  36.78 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  31.92 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0529  methyltransferase  30.61 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3678  Methyltransferase type 11  28.5 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2104  Methyltransferase type 11  30.45 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0094319  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  35.2 
 
 		 316 aa  78.6  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.26 
 
 		 241 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2876  Methyltransferase type 11  34.64 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.65 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1761  DNA topoisomerase II  40.68 
 
 		 658 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  40.87 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  34.51 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4181  methyltransferase type 11  32.72 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4832  methyltransferase type 11  32.72 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3334  methyltransferase type 11  32.72 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  40.78 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.86 
 
 		 282 aa  75.5  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  39.62 
 
 		 268 aa  75.1  0.0000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  36.97 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2117  Methyltransferase type 11  32.3 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2377  hypothetical protein  29.63 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969915  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  28.51 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1638  Methyltransferase type 11  45.45 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  0.179609 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0846  Methyltransferase type 11  31.38 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  28.51 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  35.57 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.91 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  34.1 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  35.57 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  35.57 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1409  methyltransferase type 11  24.32 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2949  Methyltransferase type 11  37.3 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  42.02 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  26.98 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  43.12 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  46.08 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  34.18 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5792  Methyltransferase type 11  47.96 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.57 
 
 		 244 aa  72  0.000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  36.91 
 
 		 250 aa  72  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  36.7 
 
 		 250 aa  72  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1997  putative methyltransferase UbiE  28.31 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>