More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06424 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06424  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  100 
 
 		 234 aa  489  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.99 
 
 		 238 aa  175  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.38 
 
 		 236 aa  175  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  37.99 
 
 		 238 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  38.94 
 
 		 235 aa  171  9e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  38.94 
 
 		 235 aa  169  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  36.16 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2481  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  37.17 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.817194 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  37.32 
 
 		 237 aa  155  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 		 252 aa  151  8.999999999999999e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  34.63 
 
 		 239 aa  145  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0699  Methyltransferase type 11  38.68 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0634895  normal  0.912408 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  34.76 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.83 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  33.49 
 
 		 257 aa  135  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  32.76 
 
 		 241 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  34.05 
 
 		 243 aa  132  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  32.34 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  31.84 
 
 		 236 aa  123  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.9 
 
 		 243 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 246 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 246 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6010  methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 246 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  29.25 
 
 		 233 aa  112  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  29.18 
 
 		 266 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  27.83 
 
 		 259 aa  102  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  30.25 
 
 		 243 aa  98.6  8e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0656  hypothetical protein  28.99 
 
 		 243 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0241729  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0529  methyltransferase  30.3 
 
 		 243 aa  96.3  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0533  methyltransferase type 11  29.33 
 
 		 243 aa  95.9  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4681  hypothetical protein  28.99 
 
 		 243 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.740312  hitchhiker  1.6173199999999999e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0585  hypothetical protein  30.3 
 
 		 243 aa  95.1  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0619  hypothetical protein  30.3 
 
 		 243 aa  95.1  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  36.24 
 
 		 249 aa  93.6  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0674  hypothetical protein  29.87 
 
 		 247 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.30135e-22 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0529  methyltransferase  29.87 
 
 		 243 aa  92  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0747  hypothetical protein  29.33 
 
 		 243 aa  91.7  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000483257  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0687  hypothetical protein  28 
 
 		 243 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  29.57 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2327  methylase  31.43 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.102662  normal  0.330615 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  34.81 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  37.74 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3678  Methyltransferase type 11  34.68 
 
 		 245 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  36.09 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  36.69 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2832  methyl transferase  35.21 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1136  hypothetical protein  34.62 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2135  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.62 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.246446  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1576  hypothetical protein  34.62 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362024  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0236  hypothetical protein  34.62 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1978  putative methyltransferase UbiE  34.62 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1997  putative methyltransferase UbiE  34.62 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2377  hypothetical protein  35.71 
 
 		 292 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969915  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  30.49 
 
 		 262 aa  78.6  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  30.49 
 
 		 262 aa  78.6  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  37.74 
 
 		 269 aa  78.6  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3351  methyltransferase type 11  28.37 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  34.45 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  31.19 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0127  methyltransferase type 11  32.86 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3115  methyl transferase  36.67 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3033  hypothetical protein  36.67 
 
 		 252 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.274712  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3087  hypothetical protein  36.67 
 
 		 252 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2164  hypothetical protein  36.67 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.883153  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2034  hypothetical protein  36.67 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.89 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0747  hypothetical protein  36.67 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2580  hypothetical protein  36.67 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3385  hypothetical protein  26.92 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1409  methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3148  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  26.67 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000361441  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2960  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.306356 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.33 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2003  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1328  methyl transferase  36.29 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3384  hypothetical protein  26.19 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  33.87 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4081  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  40.57 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  39.64 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.47 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  39.42 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1742  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.93 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  25.71 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232825  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2263  Methyltransferase type 11  24.23 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1356  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.93 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.836315 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3164  hypothetical protein  25.71 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0872868  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3058  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  25.71 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3414  hypothetical protein  25.71 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  39.6 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0170  methyltransferase type 11  30.46 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000954595  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  35.77 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3650  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  40.54 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  31.88 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1679  methyltransferase type 11  40 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1765  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  39.62 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.293992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  39.62 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00452266  normal  0.0302909 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0996  Methyltransferase type 11  35.77 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3362  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  29.07 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.68 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>