More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0358 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  100 
 
 		 362 aa  731    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  72.2 
 
 		 316 aa  410  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  58.02 
 
 		 274 aa  318  6e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  59.32 
 
 		 269 aa  319  6e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  61.33 
 
 		 286 aa  310  2e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  59.61 
 
 		 276 aa  307  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  61.04 
 
 		 284 aa  306  3e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  59.29 
 
 		 282 aa  303  5.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5673  Methyltransferase type 11  57.25 
 
 		 304 aa  299  6e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.301349 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2876  Methyltransferase type 11  58.69 
 
 		 283 aa  298  9e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  54.75 
 
 		 278 aa  292  5e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  58.87 
 
 		 262 aa  291  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  56.65 
 
 		 266 aa  290  2e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  54.41 
 
 		 276 aa  288  1e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  54.09 
 
 		 265 aa  280  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  54.65 
 
 		 293 aa  280  3e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2436  Methyltransferase type 11  57.54 
 
 		 268 aa  277  2e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1966  Methyltransferase type 11  54.75 
 
 		 274 aa  276  4e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.670216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2198  Methyltransferase type 11  57.2 
 
 		 277 aa  266  2.9999999999999995e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2949  Methyltransferase type 11  52.83 
 
 		 299 aa  257  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  50.58 
 
 		 269 aa  249  6e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1227  Methyltransferase type 11  45.8 
 
 		 300 aa  231  1e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4949  methyltransferase type 11  37.83 
 
 		 256 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  36.61 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  33.49 
 
 		 236 aa  89  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.8 
 
 		 236 aa  88.2  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  27.41 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2006  hypothetical protein  30.68 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  33.19 
 
 		 257 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29830  putative methyltransferase  35.23 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00181323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2556  methyltransferase  34.72 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1223  methyltransferase type 12  34.97 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0336  hypothetical protein  34.48 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10240  methyltransferase family protein  30.22 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 237 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  37.75 
 
 		 239 aa  75.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3033  hypothetical protein  33.51 
 
 		 252 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.274712  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3087  hypothetical protein  33.51 
 
 		 252 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  30.8 
 
 		 260 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2164  hypothetical protein  33.68 
 
 		 242 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.883153  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3115  methyl transferase  33.68 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0747  hypothetical protein  33.68 
 
 		 242 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2580  hypothetical protein  33.68 
 
 		 242 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2034  hypothetical protein  33.68 
 
 		 242 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  38.28 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  31.63 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.33 
 
 		 242 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 269 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1234  Methyltransferase type 12  29.58 
 
 		 277 aa  72.4  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  0.802761 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3927  methyltransferase type 12  26.69 
 
 		 273 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  25.91 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0746  Methyltransferase type 11  28.11 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0193664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1908  methyltransferase type 12  26.69 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.277487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3351  methyltransferase type 11  34.57 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2199  Methyltransferase type 11  31.18 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  41.18 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  41.18 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  42.86 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  28.5 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3561  methyltransferase type 12  27.13 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  0.312101 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3729  hypothetical protein  35.12 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.844109  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  37.98 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1604  methyltransferase type 12  30.2 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.785919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6010  methyltransferase type 11  40 
 
 		 246 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  39.83 
 
 		 244 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3609  Methyltransferase type 11  34.83 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0141  methyltransferase type 12  26.87 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  32.46 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0061  Orf34  42.06 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4214  methyltransferase type 12  26.87 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1943  Methyltransferase type 12  29.13 
 
 		 268 aa  67.8  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47008  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1562  UbiE/COQ5 family methlytransferase  42.06 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1474  UbiE/COQ5 family methlytransferase  42.06 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0302671  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0972  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.36 
 
 		 233 aa  67  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0127  methyltransferase type 11  31.63 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  39.84 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  31.22 
 
 		 264 aa  67  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2003  methyltransferase type 11  30.41 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  34.09 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0144  Methyltransferase type 12  26.37 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  32.99 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2310  hypothetical protein  27.75 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00350604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2485  hypothetical protein  27.75 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000990951  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  32.99 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2832  methyl transferase  34.96 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  25.26 
 
 		 243 aa  65.9  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 233 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2516  hypothetical protein  30.41 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000821985  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  40.68 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  40.21 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0145  methyltransferase type 12  26.37 
 
 		 255 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.748681 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1304  UbiE/COQ5 family methlytransferase  41.51 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308237  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  33.15 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  38.6 
 
 		 209 aa  65.1  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2960  Methyltransferase type 11  29.38 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.306356 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2278  methyltransferase  27.23 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000221713  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2777  methyltransferase type 11  29.1 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.795  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0732  methyltransferase type 11  34.08 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0142  methyltransferase type 12  29.08 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>