More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5351 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  100 
 
 
293 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  72.83 
 
 
276 aa  388  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  63.02 
 
 
262 aa  329  3e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  63.64 
 
 
265 aa  326  3e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5673  Methyltransferase type 11  59.79 
 
 
304 aa  315  7e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.301349 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  58.11 
 
 
278 aa  298  6e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  60.38 
 
 
269 aa  296  3e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  57.03 
 
 
282 aa  288  7e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  53.45 
 
 
284 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  59.33 
 
 
266 aa  282  4.0000000000000003e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  55.89 
 
 
276 aa  280  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  54.65 
 
 
362 aa  280  2e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1966  Methyltransferase type 11  58.62 
 
 
274 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.670216  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  52.52 
 
 
274 aa  272  5.000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  55.3 
 
 
269 aa  269  5e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2876  Methyltransferase type 11  52.54 
 
 
283 aa  268  8e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  55.73 
 
 
286 aa  265  5.999999999999999e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2949  Methyltransferase type 11  55.51 
 
 
299 aa  261  8e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  51.35 
 
 
316 aa  260  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2436  Methyltransferase type 11  53.82 
 
 
268 aa  257  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1227  Methyltransferase type 11  49.64 
 
 
300 aa  250  2e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2198  Methyltransferase type 11  56.76 
 
 
277 aa  250  2e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  36.02 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4949  methyltransferase type 11  35.71 
 
 
256 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  36 
 
 
260 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  34.66 
 
 
269 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  32.37 
 
 
242 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  28.64 
 
 
244 aa  79  0.00000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  34.36 
 
 
269 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 
271 aa  75.1  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  38.33 
 
 
242 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  28 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  34.88 
 
 
236 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.1 
 
 
236 aa  73.6  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1409  methyltransferase type 11  24.88 
 
 
243 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2006  hypothetical protein  29.27 
 
 
268 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  37.84 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  37.84 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0746  Methyltransferase type 11  29.44 
 
 
254 aa  72.8  0.000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0193664  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2516  hypothetical protein  30.32 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000821985  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  35.57 
 
 
260 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2164  hypothetical protein  30.29 
 
 
242 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.883153  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.52 
 
 
241 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2034  hypothetical protein  30.29 
 
 
242 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2580  hypothetical protein  30.29 
 
 
242 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0747  hypothetical protein  30.29 
 
 
242 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3087  hypothetical protein  30.29 
 
 
252 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2310  hypothetical protein  28.72 
 
 
260 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00350604  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1136  hypothetical protein  31.89 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051609  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1997  putative methyltransferase UbiE  31.89 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2135  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.89 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.246446  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3115  methyl transferase  30.29 
 
 
283 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2485  hypothetical protein  28.72 
 
 
260 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000990951  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3033  hypothetical protein  30.29 
 
 
252 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.274712  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  38.4 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0236  hypothetical protein  31.89 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1978  putative methyltransferase UbiE  31.89 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1576  hypothetical protein  31.89 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362024  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  35.66 
 
 
202 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4175  methyltransferase type 11  37.75 
 
 
279 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3351  methyltransferase type 11  29.28 
 
 
257 aa  69.3  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.96 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10240  methyltransferase family protein  28.86 
 
 
278 aa  69.3  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2777  methyltransferase type 11  29.26 
 
 
260 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.795  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  27.1 
 
 
246 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  29.84 
 
 
264 aa  68.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  34.25 
 
 
252 aa  68.9  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.47 
 
 
256 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2377  hypothetical protein  32.82 
 
 
292 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969915  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2832  methyl transferase  34.07 
 
 
259 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  33.89 
 
 
241 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2278  methyltransferase  28.19 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000221713  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25.35 
 
 
244 aa  67.4  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2897  hypothetical protein  28.72 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000728381  normal  0.0956288 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.46 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  33.89 
 
 
241 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.67 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0846  Methyltransferase type 11  30.22 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  40.95 
 
 
261 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2439  hypothetical protein  28.72 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
255 aa  67  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  40.78 
 
 
230 aa  67  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2003  methyltransferase type 11  28.98 
 
 
244 aa  66.2  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428029  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2180  putative methyltransferase  32.31 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  40.57 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2553  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  41.12 
 
 
229 aa  65.9  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.416549  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1811  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.12 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  40 
 
 
225 aa  65.1  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  39.37 
 
 
238 aa  65.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  38.33 
 
 
268 aa  65.1  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3846  putative methyltransferase ubiE/COQ5 family  42.31 
 
 
272 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0127  methyltransferase type 11  29.78 
 
 
245 aa  65.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  33.13 
 
 
212 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  36.94 
 
 
275 aa  65.1  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  36.54 
 
 
280 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  39.62 
 
 
266 aa  64.7  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.14 
 
 
255 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  41.28 
 
 
244 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0957  methyltransferase type 11  34.23 
 
 
290 aa  65.1  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>