More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2034 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  100 
 
 		 202 aa  419  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  53.23 
 
 		 204 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2320  methyltransferase type 11  52.71 
 
 		 205 aa  211  7e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  51.47 
 
 		 204 aa  209  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  51.47 
 
 		 204 aa  208  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  50 
 
 		 204 aa  204  8e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  50 
 
 		 204 aa  204  9e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  50 
 
 		 204 aa  204  9e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  48.53 
 
 		 204 aa  201  4e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  49.5 
 
 		 204 aa  201  7e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3903  methyltransferase type 11  38.5 
 
 		 198 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.808495 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3895  methyltransferase type 11  38.5 
 
 		 198 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2862  methyltransferase type 11  36.46 
 
 		 207 aa  122  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2210  methyltransferase type 11  36.61 
 
 		 203 aa  114  6.9999999999999995e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19610  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.7 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0633091  normal  0.0668245 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  36.41 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5739  methyltransferase type 11  38.12 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3244  methyltransferase type 11  37.02 
 
 		 208 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  32.68 
 
 		 347 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12966  methyltransferase  34 
 
 		 270 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.21 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  31.82 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  30 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  41.58 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3790  methyltransferase type 11  33.03 
 
 		 196 aa  72  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1859  methyltransferase type 11  40.19 
 
 		 328 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  40.19 
 
 		 328 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1906  methyltransferase type 11  40.19 
 
 		 328 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  31.61 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  30.26 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  39.25 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  41.58 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  39.25 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  35.66 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  30.26 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  36.54 
 
 		 273 aa  68.2  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2811  Methyltransferase type 11  30.86 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.481855  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16171  hypothetical protein  30 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.80652  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 634 aa  66.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  34.43 
 
 		 270 aa  67  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2500  Methyltransferase type 11  36 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  28.85 
 
 		 244 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  28.85 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  28.57 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  40.38 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25.95 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  32.33 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  40.38 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2635  Methyltransferase type 11  41.25 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  33.1 
 
 		 268 aa  65.5  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  28.95 
 
 		 271 aa  65.1  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  40.38 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1761  DNA topoisomerase II  29.2 
 
 		 658 aa  65.1  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  42 
 
 		 331 aa  65.1  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  34.29 
 
 		 258 aa  65.1  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1113  methyltransferase type 11  29.31 
 
 		 319 aa  64.7  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0629842  normal  0.748747 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  40.19 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  40.19 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3246  Methyltransferase type 11  35.34 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00392072  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  34.01 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  40.19 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  39.39 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  29.58 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  40.19 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1030  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.740234 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2935  Methyltransferase type 11  38 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  28.03 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0767  Methyltransferase type 11  34.95 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.763548  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  30.46 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  40.74 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0242  hypothetical protein  30.1 
 
 		 363 aa  62.8  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.58 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  35.64 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  36.56 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  30.15 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2962  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  39.25 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.58 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  28.49 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8582  methyltransferase type 11  28.29 
 
 		 247 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563755  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0241  hypothetical protein  30.1 
 
 		 324 aa  62  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  37.38 
 
 		 257 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  40.82 
 
 		 241 aa  62  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.85 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.69 
 
 		 250 aa  62  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  35.77 
 
 		 286 aa  62  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  37.37 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  34.69 
 
 		 250 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  34.69 
 
 		 250 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39 
 
 		 325 aa  61.6  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.355376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 269 aa  61.6  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.58 
 
 		 256 aa  61.6  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  34.69 
 
 		 250 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 411 aa  61.2  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>