More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3274 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  100 
 
 
261 aa  523  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  55.13 
 
 
271 aa  281  8.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  53.31 
 
 
279 aa  273  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  41.3 
 
 
287 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  43.48 
 
 
282 aa  179  5.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  43.91 
 
 
278 aa  177  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  44.93 
 
 
275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0604  methyltransferase type 11  41.44 
 
 
276 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  42.6 
 
 
274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  43.6 
 
 
382 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  34.7 
 
 
284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.81 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  33.64 
 
 
342 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  29.3 
 
 
283 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  29.3 
 
 
283 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  41.73 
 
 
377 aa  104  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.48 
 
 
305 aa  103  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  34.93 
 
 
304 aa  102  4e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  31.63 
 
 
286 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  46.79 
 
 
392 aa  102  9e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  39.87 
 
 
295 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3261  SAM-dependent methyltransferase  31.19 
 
 
287 aa  100  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234445  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  33.14 
 
 
280 aa  100  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.44 
 
 
282 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2147  methyltransferase type 11  30.37 
 
 
283 aa  99.8  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  33.88 
 
 
293 aa  99  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30710  predicted protein  35.62 
 
 
365 aa  97.8  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  29.74 
 
 
311 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  33.53 
 
 
311 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  34.1 
 
 
306 aa  94  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0676  Methyltransferase type 11  25.54 
 
 
280 aa  94.4  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  29.27 
 
 
328 aa  94.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16851  SAM-binding motif-containing protein  32.22 
 
 
311 aa  93.2  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.14 
 
 
330 aa  91.3  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  32.76 
 
 
328 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  32.75 
 
 
310 aa  90.9  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  36.02 
 
 
295 aa  90.1  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  39.57 
 
 
225 aa  90.1  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4388  methyltransferase type 11  30.81 
 
 
267 aa  89.7  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0989044  normal  0.24508 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  32.22 
 
 
310 aa  89.7  5e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19461  SAM-binding motif-containing protein  31.67 
 
 
310 aa  89.7  5e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4452  methyltransferase type 11  32.97 
 
 
277 aa  89.7  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20470  tocopherol o-methyltransferase  33.79 
 
 
318 aa  89  7e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1559  hypothetical protein  42.72 
 
 
208 aa  88.2  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00538046  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2025  sterol-C-methyltransferase  33.01 
 
 
310 aa  88.2  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03100  sterol 24-C-methyltransferase, putative  38.94 
 
 
343 aa  86.7  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0399554  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10824  predicted protein  31.9 
 
 
304 aa  86.3  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0540311  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23681  SAM-binding motif-containing protein  33.92 
 
 
304 aa  85.5  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0592385 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80971  predicted protein  31.54 
 
 
377 aa  85.5  9e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10269  predicted protein  33.66 
 
 
295 aa  84  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  31.8 
 
 
310 aa  84.3  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 
276 aa  84  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2451  Methyltransferase type 11  30.98 
 
 
267 aa  82  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4893  methyltransferase type 11  30.99 
 
 
274 aa  82  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0521  Methyltransferase type 11  31.9 
 
 
1012 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200159  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3306  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.76 
 
 
273 aa  81.3  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10074  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  33.73 
 
 
281 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  45.63 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.96 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2857  methyltransferase type 11  29.13 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.295819 
 
 
-
 
NC_003296  RS04686  methyltransferase protein  36.94 
 
 
274 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  40.54 
 
 
210 aa  80.1  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2411  methyltransferase type 11  30.89 
 
 
263 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2109  methyltransferase type 11  32.57 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.709004  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0172  methyltransferase type 11  33.71 
 
 
275 aa  79.7  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16281  SAM-binding motif-containing protein  31.4 
 
 
309 aa  79.3  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  32.29 
 
 
276 aa  79  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2447  methyltransferase type 11  25.42 
 
 
277 aa  79  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  37.89 
 
 
240 aa  78.2  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0725  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4089  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.14 
 
 
277 aa  77.4  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  45.37 
 
 
276 aa  77  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4594  Methyltransferase type 11  36.97 
 
 
271 aa  76.6  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6747  Methyltransferase type 11  29.76 
 
 
286 aa  76.6  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1353  Methyltransferase type 11  32.29 
 
 
280 aa  76.6  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0337053  hitchhiker  0.000000492717 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1636  methyltransferase type 11  34.39 
 
 
261 aa  77  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.431948  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2966  Methyltransferase type 11  32.86 
 
 
572 aa  76.6  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  35.66 
 
 
624 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  31.71 
 
 
347 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
286 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  34.93 
 
 
269 aa  76.3  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  31.06 
 
 
272 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  31.21 
 
 
559 aa  76.3  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0809  Methyltransferase type 11  28.4 
 
 
264 aa  75.9  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266836  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  39.66 
 
 
255 aa  75.9  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0469  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.25 
 
 
234 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  35.54 
 
 
215 aa  75.9  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1836  Methyltransferase type 11  30.05 
 
 
296 aa  75.5  0.0000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  33.94 
 
 
271 aa  75.5  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1253  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.41 
 
 
420 aa  74.7  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.087118  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1066  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.06 
 
 
269 aa  74.7  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  29.95 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  34.43 
 
 
168 aa  74.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  37.01 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3215  methyltransferase type 11  27.49 
 
 
278 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000307808 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5837  Methyltransferase type 11  35.58 
 
 
206 aa  74.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42420  predicted protein  30.25 
 
 
317 aa  74.3  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.679564 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1317  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.67 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6507  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2418  Methyltransferase type 11  38.53 
 
 
216 aa  73.6  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.224648 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>