More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3215 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3215  methyltransferase type 11  100 
 
 		 278 aa  577  1e-164  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000307808 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  41.26 
 
 		 276 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4893  methyltransferase type 11  40.61 
 
 		 274 aa  194  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3306  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.42 
 
 		 273 aa  191  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10074  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4452  methyltransferase type 11  38.76 
 
 		 277 aa  188  8e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2958  hypothetical protein  35.69 
 
 		 278 aa  185  6e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0668  Methyltransferase type 11  38.43 
 
 		 288 aa  179  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 		 286 aa  175  6e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 284 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0172  methyltransferase type 11  35.74 
 
 		 275 aa  135  7.000000000000001e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  32.04 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  27.76 
 
 		 282 aa  96.3  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0676  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 280 aa  80.5  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  29.66 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  33.9 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  36.03 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  31.75 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0809  Methyltransferase type 11  33.82 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266836  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  32.54 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.33 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10824  predicted protein  31.78 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0540311  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6747  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 286 aa  75.5  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  35.09 
 
 		 284 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 254 aa  75.1  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2451  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  27.49 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  24.54 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  26.56 
 
 		 776 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0258  hypothetical protein  29.69 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80971  predicted protein  31.62 
 
 		 377 aa  71.6  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0252  hypothetical protein  29.69 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  25.65 
 
 		 275 aa  72  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42420  predicted protein  28.1 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.679564 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.53 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0165  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.57 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.119395  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  31.72 
 
 		 392 aa  69.3  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  28.8 
 
 		 559 aa  68.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30710  predicted protein  31.3 
 
 		 365 aa  68.2  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1022  Methyltransferase type 11  27.49 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  30.25 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  33.33 
 
 		 310 aa  67  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  33.68 
 
 		 293 aa  67  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  25.97 
 
 		 274 aa  67  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20470  tocopherol o-methyltransferase  32.38 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5201  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.53 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.39 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 382 aa  66.2  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4050  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25.65 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19461  SAM-binding motif-containing protein  33.33 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  29.66 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 271 aa  65.5  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_003296  RS04686  methyltransferase protein  34.23 
 
 		 274 aa  65.5  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  30.93 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  26.09 
 
 		 271 aa  65.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2596  Methyltransferase type 11  32.3 
 
 		 311 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16281  SAM-binding motif-containing protein  27.81 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4388  methyltransferase type 11  26.54 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0989044  normal  0.24508 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01614  S-adenosyl-methionine-sterol-C-methyltransferas (AFU_orthologue; AFUA_4G09190)  32.04 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.787149  normal  0.132042 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  33.33 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  34.29 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  34.62 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  30.17 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16851  SAM-binding motif-containing protein  31.37 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1467  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.46 
 
 		 203 aa  62  0.000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.77 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0223  SAM-dependent methyltransferase  28.8 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2025  sterol-C-methyltransferase  33.33 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1422  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.99 
 
 		 229 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0507  Methyltransferase type 11  29.08 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459981  hitchhiker  0.00000192307 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2447  methyltransferase type 11  28.19 
 
 		 277 aa  62  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 634 aa  60.8  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  30.39 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  31.19 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.33 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  29.27 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1693  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.13 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39710  predicted protein  26.71 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  26.14 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2857  methyltransferase type 11  26.95 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295819 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0061  Orf34  32.48 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.33 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1562  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.48 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  33.33 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1474  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.48 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0302671  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  26.14 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0521  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 1012 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0744  Methyltransferase type 11  25.61 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0330334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  29.82 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  25.35 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  30.2 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0984  methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  31.45 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  34.56 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4318  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.27 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.126123  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  33.03 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1312  methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.117711  hitchhiker  0.0001856 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  30.43 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  34.56 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  33.04 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>