More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1467 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1467  UbiE/COQ5 family methlytransferase  100 
 
 
203 aa  424  1e-118  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0314  putative methyltransferase  35.71 
 
 
211 aa  141  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1153  SAM-dependent methyltransferase  36.76 
 
 
196 aa  136  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1413  SAM-dependent methyltransferase  37.93 
 
 
196 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1147  SAM-dependent methyltransferase  36.95 
 
 
208 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.99 
 
 
200 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1161  methyltransferase type 11  37.44 
 
 
196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1375  hypothetical protein  34.98 
 
 
196 aa  124  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04910  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.5 
 
 
386 aa  122  3e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.97 
 
 
223 aa  115  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  35.42 
 
 
208 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0106  putative methyl transferase  30.73 
 
 
205 aa  98.6  5e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5837  Methyltransferase type 11  31.48 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  35.58 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2597  methyltransferase type 11  31.01 
 
 
236 aa  72.8  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.254327  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0756  Methyltransferase type 11  30.72 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  31.73 
 
 
278 aa  65.1  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  28.03 
 
 
215 aa  65.5  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 
271 aa  65.1  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32 
 
 
280 aa  64.7  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.35 
 
 
250 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3086  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  30.28 
 
 
213 aa  64.3  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7117  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 
229 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.829004  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2935  Methyltransferase type 11  29.7 
 
 
320 aa  63.2  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  33.04 
 
 
287 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1282  methyltransferase type 11  29.45 
 
 
220 aa  62.4  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.41 
 
 
215 aa  62.8  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1022  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
273 aa  62.4  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4275  methyltransferase type 11  28.79 
 
 
236 aa  62.4  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3215  methyltransferase type 11  32.46 
 
 
278 aa  62  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000307808 
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  36.57 
 
 
280 aa  61.6  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  25.79 
 
 
207 aa  61.2  0.000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1635  Methyltransferase type 11  32.34 
 
 
252 aa  61.2  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.977952  normal  0.0455749 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1378  Methyltransferase type 11  26.34 
 
 
207 aa  61.2  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.82 
 
 
277 aa  60.5  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  37.96 
 
 
277 aa  60.8  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  31.48 
 
 
209 aa  60.5  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3055  methyltransferase type 11  30.19 
 
 
258 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000014304  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  31.73 
 
 
274 aa  60.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1008  methyltransferase type 11  33.03 
 
 
256 aa  60.5  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.23 
 
 
256 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.25 
 
 
201 aa  60.1  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  28.48 
 
 
256 aa  60.1  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  29.76 
 
 
250 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  25.65 
 
 
257 aa  60.1  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  29.08 
 
 
232 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1927  Methyltransferase type 11  28.1 
 
 
209 aa  59.7  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.170226  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2423  methyltransferase type 11  35.54 
 
 
254 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0780053 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
634 aa  59.7  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2160  methyltransferase type 11  27.03 
 
 
236 aa  59.3  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.264842  normal  0.115714 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  29.14 
 
 
207 aa  58.9  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  27.81 
 
 
327 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.09 
 
 
266 aa  58.5  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 
259 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2319  methyltransferase type 11  33.9 
 
 
178 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690206  normal  0.0712991 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  34.45 
 
 
324 aa  58.5  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  29.7 
 
 
261 aa  58.2  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  34.62 
 
 
259 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.93 
 
 
256 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.93 
 
 
256 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4711  Methyltransferase type 11  31.86 
 
 
176 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  35.29 
 
 
254 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2876  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
283 aa  57.4  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
269 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  36.36 
 
 
262 aa  57.4  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  36.19 
 
 
331 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 
254 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30710  predicted protein  29.14 
 
 
365 aa  57.4  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.93 
 
 
256 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  29.41 
 
 
250 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10824  predicted protein  33.66 
 
 
304 aa  57  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0540311  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0798  Methyltransferase type 11  27.54 
 
 
229 aa  56.6  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.86 
 
 
256 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  32.88 
 
 
251 aa  56.6  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2269  methyltransferase type 11  26.85 
 
 
240 aa  56.6  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.541668  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  30.94 
 
 
250 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  36.11 
 
 
237 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  31.91 
 
 
250 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  31.71 
 
 
276 aa  56.6  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  28.46 
 
 
332 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1113  methyltransferase type 11  26.39 
 
 
319 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0629842  normal  0.748747 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  28.97 
 
 
275 aa  56.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  28.29 
 
 
328 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  25.81 
 
 
256 aa  56.2  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  34.82 
 
 
202 aa  56.2  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  29.41 
 
 
250 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1859  methyltransferase type 11  28.29 
 
 
328 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  31.86 
 
 
256 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10334  hypothetical protein  26.79 
 
 
208 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.672272 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  29.41 
 
 
250 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  35.85 
 
 
272 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1906  methyltransferase type 11  28.29 
 
 
328 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  28.46 
 
 
341 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  30.59 
 
 
253 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  31.86 
 
 
256 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  36.79 
 
 
265 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  29.94 
 
 
238 aa  56.6  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1886  Methyltransferase type 11  36.04 
 
 
253 aa  55.8  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187674  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  31.13 
 
 
243 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>