More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7117 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_7117  Methyltransferase type 11  100 
 
 
229 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.829004  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6852  Methyltransferase type 11  37.71 
 
 
217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18943  normal  0.739847 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0633  hypothetical protein  33.66 
 
 
217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.182663  normal  0.273466 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1512  methyltransferase type 11  30.29 
 
 
217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0798  Methyltransferase type 11  30.89 
 
 
229 aa  103  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5837  Methyltransferase type 11  34.25 
 
 
206 aa  102  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2418  Methyltransferase type 11  33.49 
 
 
216 aa  99  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.224648 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1282  methyltransferase type 11  34.66 
 
 
220 aa  94  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.1 
 
 
223 aa  85.9  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.05 
 
 
200 aa  83.2  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2086  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 
219 aa  82  0.000000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.39993  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4275  methyltransferase type 11  36.11 
 
 
236 aa  80.5  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1944  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
212 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.108807  normal  0.982721 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1964  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
212 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2010  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
212 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  27.93 
 
 
208 aa  79  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10334  hypothetical protein  32.43 
 
 
208 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.672272 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0314  putative methyltransferase  28.17 
 
 
211 aa  74.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04910  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.54 
 
 
386 aa  72.8  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2597  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
236 aa  72  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.254327  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1467  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.62 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  36.49 
 
 
254 aa  67  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1161  methyltransferase type 11  24.68 
 
 
196 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  36.49 
 
 
254 aa  67  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  34.11 
 
 
273 aa  66.6  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  42.59 
 
 
232 aa  66.2  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0106  putative methyl transferase  27.86 
 
 
205 aa  65.9  0.0000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  36.19 
 
 
187 aa  64.3  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
211 aa  65.1  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3338  Methyltransferase type 11  33.91 
 
 
210 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1153  SAM-dependent methyltransferase  24.03 
 
 
196 aa  62.8  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1375  hypothetical protein  22.73 
 
 
196 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  28.79 
 
 
199 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1147  SAM-dependent methyltransferase  23.38 
 
 
208 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  33.15 
 
 
267 aa  62  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 
269 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1413  SAM-dependent methyltransferase  24.03 
 
 
196 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4711  Methyltransferase type 11  34.04 
 
 
176 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12710  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.33 
 
 
198 aa  59.7  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  27.73 
 
 
213 aa  59.7  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  30.5 
 
 
205 aa  60.1  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  28.17 
 
 
290 aa  59.3  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  29.27 
 
 
202 aa  59.7  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  29.69 
 
 
295 aa  59.3  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1589  Methyltransferase type 11  33.59 
 
 
209 aa  59.3  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  39.45 
 
 
228 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  28.21 
 
 
207 aa  58.5  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  31.29 
 
 
240 aa  58.5  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1635  Methyltransferase type 11  32.24 
 
 
252 aa  58.5  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.977952  normal  0.0455749 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  37.04 
 
 
233 aa  58.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 
284 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1315  Methyltransferase type 12  39.62 
 
 
179 aa  57.8  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1078  SAM-dependent methyltransferase  30.97 
 
 
201 aa  57.4  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.215412  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  32.26 
 
 
229 aa  57  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  31.97 
 
 
204 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  31.97 
 
 
204 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  31.97 
 
 
204 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  35.34 
 
 
225 aa  56.6  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3065  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  38.24 
 
 
216 aa  56.2  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627483  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0507  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 
258 aa  56.6  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459981  hitchhiker  0.00000192307 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  34.06 
 
 
348 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  26.24 
 
 
200 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  26.24 
 
 
200 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3328  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  38.24 
 
 
210 aa  55.8  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  31.97 
 
 
204 aa  55.8  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1378  Methyltransferase type 11  29.01 
 
 
207 aa  55.5  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2500  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 
221 aa  55.8  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126168  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  26.57 
 
 
295 aa  55.5  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3370  Methyltransferase type 11  35 
 
 
253 aa  55.1  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  37.39 
 
 
337 aa  55.1  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2811  Methyltransferase type 11  36.44 
 
 
204 aa  55.1  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.481855  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  27.86 
 
 
832 aa  54.3  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.39 
 
 
230 aa  54.7  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  27.81 
 
 
411 aa  54.3  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3033  thioesterase  28.95 
 
 
829 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.862159  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
266 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0388  Methyltransferase type 11  27.65 
 
 
226 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0410842 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2782  methyltransferase type 11  40.17 
 
 
234 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320592  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.76 
 
 
280 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0914  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.71 
 
 
255 aa  53.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  30.23 
 
 
276 aa  53.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  28.33 
 
 
201 aa  53.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1027  Methyltransferase type 11  29.88 
 
 
258 aa  53.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  26.9 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6077  Methyltransferase type 11  29.61 
 
 
277 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.315329 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  33.33 
 
 
263 aa  53.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  30.25 
 
 
204 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2290  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
226 aa  53.5  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  29.55 
 
 
237 aa  53.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  38.68 
 
 
309 aa  52.8  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0025  methyltransferase type 11  35.58 
 
 
213 aa  52.8  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  31.36 
 
 
215 aa  52.8  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  32.81 
 
 
293 aa  52.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1059  methyltransferase type 11  29.91 
 
 
283 aa  52.8  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 
259 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  26 
 
 
207 aa  52.4  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  29.41 
 
 
204 aa  52.4  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  33.88 
 
 
236 aa  52.4  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2411  methyltransferase type 11  31.09 
 
 
263 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11780  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.14 
 
 
262 aa  52  0.000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>