More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13054 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  670    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  84.26 
 
 
328 aa  567  1e-160  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1859  methyltransferase type 11  84.26 
 
 
328 aa  567  1e-160  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1906  methyltransferase type 11  84.26 
 
 
328 aa  567  1e-160  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  85.4 
 
 
332 aa  560  1e-158  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  85.71 
 
 
341 aa  559  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  70.95 
 
 
324 aa  479  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2935  Methyltransferase type 11  71.43 
 
 
320 aa  460  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  65.83 
 
 
325 aa  430  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.355376  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  64.98 
 
 
331 aa  416  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4848  Methyltransferase type 11  66.45 
 
 
310 aa  382  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4655  Methyltransferase type 11  35.83 
 
 
310 aa  200  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  39.8 
 
 
266 aa  77.8  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.67 
 
 
250 aa  74.3  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2807  Methyltransferase type 11  37.96 
 
 
228 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  41.58 
 
 
202 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  28.1 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  37.32 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  36.21 
 
 
256 aa  72  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  40.78 
 
 
204 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  40.78 
 
 
204 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  40.78 
 
 
204 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  41.49 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  33.94 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  38.06 
 
 
265 aa  70.5  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0400  methyltransferase type 11  45.1 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.555595  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.04 
 
 
233 aa  70.1  0.00000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  39.81 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.37 
 
 
258 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  39.09 
 
 
256 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  43.64 
 
 
634 aa  68.9  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.58 
 
 
237 aa  68.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  38 
 
 
258 aa  68.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  36.52 
 
 
266 aa  68.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6509  methyltransferase type 11  34.25 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434141  normal 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
270 aa  68.2  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0334  Methyltransferase type 11  29.87 
 
 
257 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000194414  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  39.09 
 
 
256 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  36.28 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  44 
 
 
257 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5653  methyltransferase type 11  34.25 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154471  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6018  methyltransferase type 11  34.25 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.153765  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3875  Methyltransferase type 11  26.37 
 
 
268 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.32 
 
 
236 aa  67.4  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  38.02 
 
 
268 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  32.61 
 
 
415 aa  67.4  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
263 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.14 
 
 
201 aa  67.4  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  42.06 
 
 
204 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  42.06 
 
 
204 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  40.91 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  35.16 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  39.62 
 
 
204 aa  67  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4086  methyltransferase type 11  34.53 
 
 
249 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315577  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  39.09 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2320  methyltransferase type 11  39.42 
 
 
205 aa  67  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7427  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.56 
 
 
220 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0427142  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1886  Methyltransferase type 11  33.7 
 
 
253 aa  66.2  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187674  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  42.27 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1028  methyltransferase type 11  44.12 
 
 
250 aa  66.2  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2811  Methyltransferase type 11  31.54 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.481855  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  36.45 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 
335 aa  65.9  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  31.93 
 
 
283 aa  65.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6134  methyltransferase type 11  33.57 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.145601  normal  0.0218248 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  35.83 
 
 
348 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0699  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
231 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0634895  normal  0.912408 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  39.29 
 
 
268 aa  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1008  methyltransferase type 11  37.1 
 
 
256 aa  65.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  38.61 
 
 
258 aa  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  41.35 
 
 
317 aa  65.1  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.57 
 
 
258 aa  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2635  Methyltransferase type 11  44.59 
 
 
199 aa  65.1  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0758  Methyltransferase type 11  36 
 
 
189 aa  64.7  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00287175  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1272  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.62 
 
 
228 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  40 
 
 
281 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  35.81 
 
 
254 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  37.86 
 
 
256 aa  64.7  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  38.05 
 
 
253 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  34.01 
 
 
309 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  39.45 
 
 
342 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.74 
 
 
248 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.81 
 
 
254 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  39.81 
 
 
354 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0696  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.22 
 
 
229 aa  63.9  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4779  Methyltransferase type 11  38 
 
 
264 aa  63.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766265 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  34.39 
 
 
252 aa  64.3  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  35.81 
 
 
254 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  32.86 
 
 
259 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  26.81 
 
 
243 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  39.81 
 
 
349 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  36.89 
 
 
226 aa  63.5  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3356  ubiquinone/menaquinone methyltransferase  32.31 
 
 
318 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000127941  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3419  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.4 
 
 
299 aa  63.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  31.33 
 
 
283 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1015  Methyltransferase type 11  34.68 
 
 
213 aa  63.9  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371605  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  34.53 
 
 
272 aa  63.5  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0932  putative methyltransferase  43 
 
 
217 aa  63.9  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  35.19 
 
 
258 aa  63.2  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>