More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6134 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6134  methyltransferase type 11  100 
 
 		 220 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.145601  normal  0.0218248 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7427  UbiE/COQ5 methyltransferase  96.36 
 
 		 220 aa  420  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0427142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5653  methyltransferase type 11  95.91 
 
 		 220 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154471  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6018  methyltransferase type 11  95.91 
 
 		 220 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.153765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6509  methyltransferase type 11  95.91 
 
 		 220 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0703  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  75.58 
 
 		 221 aa  332  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161122  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2892  UbiE/COQ5 family methlytransferase  75.12 
 
 		 221 aa  330  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3154  hypothetical protein  75.12 
 
 		 221 aa  330  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0537  UbiE/COQ5 family methlytransferase  75.12 
 
 		 221 aa  330  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0124  UbiE/COQ5 family methlytransferase  75.12 
 
 		 221 aa  330  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.528868  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1464  UbiE/COQ5 family methlytransferase  75.12 
 
 		 221 aa  330  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0519  UbiE/COQ5 family methlytransferase  74.65 
 
 		 221 aa  328  4e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.421388  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6701  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.09 
 
 		 223 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  31.18 
 
 		 261 aa  78.6  0.00000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0895  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.17 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195725 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 309 aa  68.9  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 411 aa  68.6  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  31.16 
 
 		 305 aa  68.2  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4023  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.25 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  35.42 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  34.51 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7094  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.75 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000661752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1859  methyltransferase type 11  35.42 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1906  methyltransferase type 11  35.42 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  33.57 
 
 		 327 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0258  hypothetical protein  38.37 
 
 		 253 aa  65.1  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  41.24 
 
 		 332 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0252  hypothetical protein  38.37 
 
 		 253 aa  65.1  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  34.72 
 
 		 341 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6455  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.92 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  26.71 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  37.65 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  34.94 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.25 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6259  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  29.87 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 269 aa  62  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.49 
 
 		 345 aa  62.4  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  31.55 
 
 		 307 aa  62  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  27.71 
 
 		 283 aa  62  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  27.68 
 
 		 248 aa  61.6  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.93 
 
 		 280 aa  61.6  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  36.61 
 
 		 276 aa  61.6  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  33.91 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  28.18 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0165  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.2 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.119395  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1709  Methyltransferase type 11  33.14 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.25 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  31.76 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.8 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2907  Methyltransferase type 11  26.52 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1030  Methyltransferase type 11  36.42 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.740234 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  33.06 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.32 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  31.01 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0798  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.11 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  26.06 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4556  methyltransferase type 11  38.28 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  32.7 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1926  Methyltransferase type 11  29.65 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  30.32 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.59 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0503  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.33 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  32.1 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  32.81 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3960  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.21 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0746465 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  26.34 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.28 
 
 		 420 aa  59.3  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.65 
 
 		 325 aa  58.9  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.355376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  29.22 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 348 aa  58.9  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  37 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.11 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0864  methyltransferase type 11  25.91 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.81939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  35.96 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  31.29 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  23.87 
 
 		 263 aa  58.5  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4655  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 		 310 aa  58.5  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.67 
 
 		 241 aa  58.2  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  26.51 
 
 		 283 aa  58.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 		 284 aa  58.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3065  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627483  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0747  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.67 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0110  methyltransferase type 11  25.73 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2014  methyltransferase type 11  25.93 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.51029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  31.69 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20470  tocopherol o-methyltransferase  36.14 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1594  methyltransferase type 11  29.81 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2635  Methyltransferase type 11  37.08 
 
 		 199 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  28.36 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2910  putative RNA methylase  32.54 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.094641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>