More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2907 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2907  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 240 aa  480  1e-135  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0895  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.18 
 
 		 220 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195725 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0042  Methyltransferase type 12  32.92 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2592  hypothetical protein  32.22 
 
 		 220 aa  100  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1655  methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.159478  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0120  Methyltransferase type 12  29.29 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0315  hypothetical protein  27.43 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1278  hypothetical protein  29.05 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14181  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.9 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  31.79 
 
 		 305 aa  67  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1199  hypothetical protein  26.27 
 
 		 223 aa  67  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.105724  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  36.44 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  36.44 
 
 		 256 aa  65.1  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  36.44 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  36.44 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  35.59 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0519  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.67 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.421388  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 349 aa  62  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2892  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.43 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3154  hypothetical protein  30.43 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0703  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  30.43 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161122  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1466  Methyltransferase type 12  29.11 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1464  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.43 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0124  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.43 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.528868  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.03 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000221573  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  23.18 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0537  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.08 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  31.33 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6134  methyltransferase type 11  26.52 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.145601  normal  0.0218248 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07171  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  22.51 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0662  hypothetical protein  22.76 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0204  Methyltransferase type 12  24.69 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1055  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  29.38 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.265378 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6509  methyltransferase type 11  26.15 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5653  methyltransferase type 11  26.15 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154471  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6018  methyltransferase type 11  26.15 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.153765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07721  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  24.1 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000795739 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2810  methyltransferase type 12  31.11 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7427  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.76 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0427142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0005  methyltransferase  29.69 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.168517  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6701  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  29.92 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3086  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.72 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.516357 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07151  methylase  21.22 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.353179  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2589  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.78 
 
 		 262 aa  52.8  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  30.77 
 
 		 414 aa  52.8  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  29.91 
 
 		 275 aa  52.8  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07351  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  21.05 
 
 		 231 aa  52.8  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.138217  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2013  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.14 
 
 		 241 aa  52.4  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0094  SAM-dependent methyltransferase  21.86 
 
 		 227 aa  52.4  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.333279  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 218 aa  52.4  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1561  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.38 
 
 		 256 aa  52.4  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.676344 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2290  Methyltransferase type 11  28.81 
 
 		 226 aa  52.4  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  30.09 
 
 		 285 aa  52  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.67 
 
 		 264 aa  52  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2020  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.09 
 
 		 236 aa  52.4  0.000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.11 
 
 		 250 aa  52  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  25 
 
 		 262 aa  52  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0110  methyltransferase type 11  27.54 
 
 		 274 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.48 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  27.88 
 
 		 270 aa  51.2  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.56 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 348 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 327 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 349 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  33.94 
 
 		 354 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07191  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  23.64 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.0203679 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2959  ribosomal protein L11 methyltransferase  30 
 
 		 309 aa  51.6  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000148567  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.56 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1246  Methyltransferase type 11  28.07 
 
 		 288 aa  50.4  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  33.59 
 
 		 305 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  33.94 
 
 		 342 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  33.65 
 
 		 273 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1028  methyltransferase type 11  31.96 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0947  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.28 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2959  methyltransferase type 11  28.67 
 
 		 273 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0474  methyltransferase type 11  27.2 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00410704  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2333  O-methyltransferase family protein  25.68 
 
 		 328 aa  50.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  29.37 
 
 		 295 aa  50.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1926  Methyltransferase type 11  30.17 
 
 		 281 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.56 
 
 		 256 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 339 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  33.06 
 
 		 307 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0400  methyltransferase type 11  30.93 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.555595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1594  methyltransferase type 11  27.45 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0885  methyltransferase, putative  32.14 
 
 		 214 aa  49.7  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.784579  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2339  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 191 aa  49.7  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.755854  normal  0.422901 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 266 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.25 
 
 		 243 aa  49.7  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  31.31 
 
 		 269 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4023  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.78 
 
 		 240 aa  49.3  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0225  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.46 
 
 		 306 aa  49.3  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  26.42 
 
 		 280 aa  49.3  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50330  hypothetical protein  24.37 
 
 		 253 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.271099  hitchhiker  0.000351246 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 256 aa  49.3  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  28.85 
 
 		 229 aa  49.3  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>