More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3510 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  100 
 
 
282 aa  573  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  80.87 
 
 
278 aa  476  1e-133  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2147  methyltransferase type 11  39.93 
 
 
283 aa  222  4.9999999999999996e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  41.73 
 
 
275 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  39.66 
 
 
287 aa  190  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  43.11 
 
 
279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  43.48 
 
 
261 aa  179  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  39.19 
 
 
274 aa  177  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0604  methyltransferase type 11  43.24 
 
 
276 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  41.45 
 
 
271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  39.6 
 
 
382 aa  143  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  37.57 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  37.38 
 
 
284 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  32.86 
 
 
286 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 
283 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  32.06 
 
 
283 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20470  tocopherol o-methyltransferase  36.71 
 
 
318 aa  119  4.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  36.14 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36 
 
 
305 aa  117  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.1 
 
 
330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.823717 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  38.41 
 
 
377 aa  112  9e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  31.47 
 
 
280 aa  111  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30710  predicted protein  35 
 
 
365 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80971  predicted protein  32.02 
 
 
377 aa  108  9.000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03100  sterol 24-C-methyltransferase, putative  32.43 
 
 
343 aa  107  3e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0399554  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  32.26 
 
 
328 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  28.95 
 
 
342 aa  105  8e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  38.56 
 
 
392 aa  104  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3261  SAM-dependent methyltransferase  30.22 
 
 
287 aa  103  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234445  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.39 
 
 
282 aa  103  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  30.96 
 
 
328 aa  102  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10824  predicted protein  37.66 
 
 
304 aa  102  6e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0540311  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  33.18 
 
 
310 aa  102  7e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0809  Methyltransferase type 11  26.92 
 
 
264 aa  101  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266836  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  31 
 
 
306 aa  101  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4388  methyltransferase type 11  29.28 
 
 
267 aa  98.2  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0989044  normal  0.24508 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0676  Methyltransferase type 11  25.46 
 
 
280 aa  97.8  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  31.73 
 
 
304 aa  97.1  3e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1353  Methyltransferase type 11  32.34 
 
 
280 aa  96.7  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0337053  hitchhiker  0.000000492717 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  37.18 
 
 
295 aa  96.3  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2857  methyltransferase type 11  36.25 
 
 
279 aa  96.3  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.295819 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3215  methyltransferase type 11  27.76 
 
 
278 aa  96.3  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000307808 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2451  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 
267 aa  95.9  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0521  Methyltransferase type 11  30.1 
 
 
1012 aa  95.5  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200159  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04686  methyltransferase protein  34.57 
 
 
274 aa  95.5  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3306  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.93 
 
 
273 aa  94.7  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10074  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10269  predicted protein  31.15 
 
 
295 aa  95.1  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42420  predicted protein  30.49 
 
 
317 aa  94.4  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.679564 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2025  sterol-C-methyltransferase  32.08 
 
 
310 aa  94  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  36.05 
 
 
311 aa  92.8  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 
284 aa  91.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19461  SAM-binding motif-containing protein  28.18 
 
 
310 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  28.18 
 
 
310 aa  90.9  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  36.05 
 
 
310 aa  90.5  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16281  SAM-binding motif-containing protein  32.8 
 
 
309 aa  90.5  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23681  SAM-binding motif-containing protein  32.8 
 
 
304 aa  90.5  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0592385 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  34.01 
 
 
311 aa  90.1  4e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  35.44 
 
 
261 aa  90.1  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1559  hypothetical protein  32.26 
 
 
208 aa  89.4  7e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00538046  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01614  S-adenosyl-methionine-sterol-C-methyltransferas (AFU_orthologue; AFUA_4G09190)  35.34 
 
 
387 aa  88.2  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.787149  normal  0.132042 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2447  methyltransferase type 11  23.85 
 
 
277 aa  88.6  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  32.08 
 
 
559 aa  88.6  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16851  SAM-binding motif-containing protein  34.01 
 
 
311 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6747  Methyltransferase type 11  28.51 
 
 
286 aa  87.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0984  methyltransferase type 11  29.43 
 
 
300 aa  87.8  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  26.01 
 
 
270 aa  87.8  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4452  methyltransferase type 11  37.61 
 
 
277 aa  87.8  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  36.3 
 
 
295 aa  87  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17021  putative sarcosine-dimethylglycine methyltransferase  25.62 
 
 
282 aa  87  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.650309 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0668  Methyltransferase type 11  39.52 
 
 
288 aa  86.7  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  38.89 
 
 
286 aa  85.9  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  41.8 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1026  methyltransferase type 11  34.07 
 
 
277 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4893  methyltransferase type 11  31.79 
 
 
274 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1677  methyltransferase type 11  34 
 
 
278 aa  83.2  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1317  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  29.34 
 
 
387 aa  82  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.875361  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3068  Methyltransferase type 12  30.53 
 
 
288 aa  81.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0546  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  29.34 
 
 
387 aa  81.6  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.35 
 
 
223 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1198  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  29.34 
 
 
387 aa  81.6  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2109  methyltransferase type 11  27.39 
 
 
296 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.709004  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1028  methyltransferase type 11  42.86 
 
 
250 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  30.64 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  35.33 
 
 
271 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  30.11 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  35.65 
 
 
276 aa  81.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1057  Methyltransferase type 11  26.89 
 
 
292 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.783467  hitchhiker  0.00010073 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2417  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.08 
 
 
414 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0333  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.96 
 
 
445 aa  80.5  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.953487 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2741  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  30.23 
 
 
400 aa  80.9  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.37 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2358  methyltransferase type 11  40.68 
 
 
216 aa  79  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.53267  normal  0.0101141 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2966  Methyltransferase type 11  31.06 
 
 
572 aa  79  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0050  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.72 
 
 
471 aa  79  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0716  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.42 
 
 
406 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.719598  normal  0.139789 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1411  Methyltransferase type 11  30.13 
 
 
292 aa  78.6  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.456001  normal  0.135358 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0172  methyltransferase type 11  36.67 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  37.23 
 
 
276 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  38.79 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>