More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1456 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 284 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  92.88 
 
 		 286 aa  511  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  53.38 
 
 		 276 aa  281  9e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0668  Methyltransferase type 11  44.16 
 
 		 288 aa  228  6e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4893  methyltransferase type 11  43.73 
 
 		 274 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4452  methyltransferase type 11  44.87 
 
 		 277 aa  211  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3306  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.15 
 
 		 273 aa  207  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10074  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0172  methyltransferase type 11  44.28 
 
 		 275 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3215  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 278 aa  182  7e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000307808 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2958  hypothetical protein  33.7 
 
 		 278 aa  176  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  39.83 
 
 		 282 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  36.21 
 
 		 377 aa  88.2  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  39.01 
 
 		 271 aa  87.8  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  42.72 
 
 		 382 aa  86.3  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  35.56 
 
 		 278 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2857  methyltransferase type 11  27.91 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295819 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03100  sterol 24-C-methyltransferase, putative  34.48 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0399554  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  41.84 
 
 		 342 aa  81.6  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2451  Methyltransferase type 11  36.22 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  36.97 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  39.09 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  41.84 
 
 		 280 aa  79.3  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  37.25 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  29.19 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  31.49 
 
 		 275 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  34.23 
 
 		 392 aa  77.8  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20470  tocopherol o-methyltransferase  38.14 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80971  predicted protein  30.65 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  36.8 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04686  methyltransferase protein  32.21 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  31.4 
 
 		 559 aa  75.5  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  38.32 
 
 		 286 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  33.57 
 
 		 274 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6747  Methyltransferase type 11  30.12 
 
 		 286 aa  74.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0165  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.119395  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  34.75 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00562  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.28 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  31.21 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  41.58 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0809  Methyltransferase type 11  34.88 
 
 		 264 aa  72.4  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266836  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001927  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE/COQ5  40.37 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2432  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.64 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  41.18 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0400  methyltransferase type 11  33.93 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.555595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  37.38 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  34.31 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  37.38 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0542  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  42.59 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0676  Methyltransferase type 11  29.32 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01614  S-adenosyl-methionine-sterol-C-methyltransferas (AFU_orthologue; AFUA_4G09190)  37.17 
 
 		 387 aa  69.3  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.787149  normal  0.132042 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0475  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  30.3 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  36.3 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10824  predicted protein  37.29 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0540311  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1677  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  42.16 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  38.32 
 
 		 285 aa  68.9  0.00000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  30.88 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  35 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  34 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2996  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.51 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30710  predicted protein  34.21 
 
 		 365 aa  67.4  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  35.38 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  41.18 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0744  Methyltransferase type 11  30.4 
 
 		 248 aa  67  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0330334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  29.93 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2447  methyltransferase type 11  28.05 
 
 		 277 aa  67  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3202  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  37.61 
 
 		 251 aa  67  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1180  methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 279 aa  67  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1568  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.17 
 
 		 257 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0419  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.88 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1008  methyltransferase type 11  34.3 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2617  Methyltransferase type 11  30.12 
 
 		 228 aa  67  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0506  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.88 
 
 		 251 aa  67  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4254  UbiE/COQ5 methyltransferase  41.18 
 
 		 272 aa  67  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0069  phosphoethanolamine N-methyltransferase  27.17 
 
 		 264 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0516193  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0431  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.88 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159062  hitchhiker  0.0000667 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1480  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.17 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.731828  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3895  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.88 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.4649  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0294  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  38.53 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00915266  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  40.78 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.17 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.42 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0445  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.88 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4421  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.75 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4199  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  29.41 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.59 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  42.34 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  31.08 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4899  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.93 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3189  MCP methyltransferase, CheR-type  38.14 
 
 		 297 aa  65.5  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00181305  normal  0.0716024 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6259  Methyltransferase type 11  38.14 
 
 		 270 aa  65.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.51 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.39 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2959  methyltransferase type 11  41.03 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0405  demethylmenaquinone methyltransferase  29.41 
 
 		 251 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.403287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3725  demethylmenaquinone methyltransferase  29.41 
 
 		 251 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.52 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4175  methyltransferase type 11  40 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>