More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2596 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  100 
 
 		 271 aa  526  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  82.29 
 
 		 271 aa  402  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  49.81 
 
 		 776 aa  235  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  46.48 
 
 		 261 aa  210  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4050  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.44 
 
 		 261 aa  141  9e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  35.52 
 
 		 276 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0809  Methyltransferase type 11  36.07 
 
 		 264 aa  97.4  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266836  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  42.42 
 
 		 276 aa  95.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 279 aa  94.7  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  32.34 
 
 		 274 aa  94  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0165  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.83 
 
 		 283 aa  92.4  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.119395  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.94 
 
 		 280 aa  90.1  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1224  methyltransferase type 11  31.97 
 
 		 282 aa  90.1  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.158383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  37.06 
 
 		 265 aa  89  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  36.88 
 
 		 268 aa  89  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3346  Methyltransferase type 11  39.22 
 
 		 265 aa  88.6  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.408224  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.33 
 
 		 277 aa  88.2  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  33.85 
 
 		 263 aa  88.2  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2959  methyltransferase type 11  35.54 
 
 		 273 aa  87.8  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.93 
 
 		 277 aa  85.1  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3376  Methyltransferase type 11  37.82 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0407493  hitchhiker  0.00438973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  37.11 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  30.38 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0923  Methyltransferase type 11  36.69 
 
 		 1039 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.804895  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.97 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  34.34 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3308  methyltransferase type 11  36.42 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.358181  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.15 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04686  methyltransferase protein  29.91 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0251  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.33 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2451  Methyltransferase type 11  34.97 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0591  Methyltransferase type 11  38.27 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.812194 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  29.24 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0668  Methyltransferase type 11  38.64 
 
 		 288 aa  79.3  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  29.96 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2089  putative methyltransferase  35.93 
 
 		 1014 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0627261  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3743  methyltransferase type 11  36.94 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  35.05 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1246  Methyltransferase type 11  36.94 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.09 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4075  Methyltransferase type 11  26.15 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  33.56 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  39.75 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.53 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  34.44 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4114  Methyltransferase type 11  25.77 
 
 		 365 aa  75.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.199074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0252  hypothetical protein  29.41 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0258  hypothetical protein  29.41 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  38.41 
 
 		 295 aa  75.5  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  31.68 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1514  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.49 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.732855  normal  0.394631 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4452  methyltransferase type 11  37.98 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  34.64 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3423  Methyltransferase type 11  36.67 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.101773 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0110  methyltransferase type 11  34.15 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0499  Methyltransferase type 11  35.46 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000709402  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0104  Methyltransferase type 11  36.48 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1001  methyltransferase type 11  33.01 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 355 aa  72.8  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2958  hypothetical protein  27.98 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4893  methyltransferase type 11  35.66 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2645  methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.75506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  36.42 
 
 		 409 aa  72.4  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1201  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.43 
 
 		 270 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1926  Methyltransferase type 11  31.98 
 
 		 281 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1026  methyltransferase type 11  43.48 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32.68 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  31.98 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  34.59 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6112  arsenite S-adenosylmethyltransferase  28.71 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1625  hypothetical protein  30.72 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.207342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  33.55 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  26.88 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  27.32 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2791  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.82 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  34.71 
 
 		 559 aa  69.3  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0223  SAM-dependent methyltransferase  28.63 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  31.79 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  26.83 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1027  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0172  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4175  methyltransferase type 11  38 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5201  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.47 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25.24 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1559  Methyltransferase type 11  32.39 
 
 		 233 aa  67  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0523794  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0744  Methyltransferase type 11  30.64 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0330334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2857  methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 279 aa  67  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295819 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04625  arsenic methyltransferase Cyt19, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G15020)  28.76 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1196  Methyltransferase type 11  30.07 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5646  methyltransferase type 11  37.69 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  36.17 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  36.67 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2227  Methyltransferase type 11  24.64 
 
 		 396 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372982 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  37.89 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  39.81 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  36.59 
 
 		 382 aa  65.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  34.75 
 
 		 284 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3215  methyltransferase type 11  26.09 
 
 		 278 aa  65.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000307808 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>