More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4050 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4050  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  100 
 
 		 261 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  37.44 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  39.34 
 
 		 271 aa  139  6e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  33.85 
 
 		 261 aa  133  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  34.35 
 
 		 776 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0165  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.31 
 
 		 283 aa  112  6e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.119395  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1811  Methyltransferase type 11  32.24 
 
 		 235 aa  95.1  9e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3142  Methyltransferase type 11  29.57 
 
 		 248 aa  91.3  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3542  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.35 
 
 		 243 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0223  SAM-dependent methyltransferase  30.27 
 
 		 242 aa  90.5  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0110  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 274 aa  89.7  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1472  Methyltransferase type 11  31.91 
 
 		 242 aa  85.9  7e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3437  Methyltransferase type 11  25.58 
 
 		 244 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  32.21 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1577  methyltransferase type 11  29.79 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0911179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  28.8 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1201  arsenite S-adenosylmethyltransferase  28.73 
 
 		 270 aa  82  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  28.8 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1312  methyltransferase type 11  29.48 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.117711  hitchhiker  0.0001856 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0639  Methyltransferase type 11  26.27 
 
 		 307 aa  79  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0809  Methyltransferase type 11  28.27 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266836  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0258  hypothetical protein  28.9 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1625  hypothetical protein  29.14 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.207342 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0252  hypothetical protein  28.9 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  26.8 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2447  methyltransferase type 11  28.69 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  26.8 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0485  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.14 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.693247  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  27.08 
 
 		 270 aa  75.1  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  26.94 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1559  Methyltransferase type 11  28.19 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0523794  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2617  Methyltransferase type 11  32.82 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  28.69 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1001  methyltransferase type 11  29.2 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0499  Methyltransferase type 11  30.14 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000709402  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.78 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3693  hypothetical protein  27.01 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336986  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  29.61 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.42 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  27.81 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1926  Methyltransferase type 11  31.06 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1612  Methyltransferase type 11  28.74 
 
 		 233 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  38.78 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08531  putative methyltransferase  27.81 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  28.1 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3590  hypothetical protein  28.16 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.15692 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  29.82 
 
 		 559 aa  71.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2241  methyltransferase type 11  27.71 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.602908  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1914  Methyltransferase type 11  34.25 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0388  type 11 methyltransferase  32.48 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3339  methyltransferase  27.59 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0677  methyltransferase-like  27.42 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2451  Methyltransferase type 11  31.34 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  29.61 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  34.85 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  30.67 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2013  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.36 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.82 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3376  hypothetical protein  28.16 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3290  methyltransferase  27.01 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2958  hypothetical protein  25.47 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3641  hypothetical protein  28.16 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  29.22 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5201  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.36 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0744  Methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0330334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3607  hypothetical protein  25.86 
 
 		 239 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1984  methyltransferase-like  27.04 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.52 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3600  hypothetical protein  25.86 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2358  methyltransferase type 11  26.97 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.53267  normal  0.0101141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5881  methyltransferase type 11  36.19 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  28.95 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  28.76 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3797  hypothetical protein  36.57 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0549  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  35.51 
 
 		 265 aa  67  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2089  putative methyltransferase  25.45 
 
 		 1014 aa  67  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0627261  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2959  methyltransferase type 11  32.81 
 
 		 273 aa  67  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04351  putative methyltransferase  26.34 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.62 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3346  Methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.408224  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.62 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04661  putative methyltransferase  26.34 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  26.03 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0560  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.8 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  30.38 
 
 		 377 aa  65.9  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3215  methyltransferase type 11  25.65 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000307808 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2718  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.19 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.45 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0587723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  29.33 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  25.17 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.87 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.133414 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>