More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3542 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3542  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  100 
 
 		 243 aa  481  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1577  methyltransferase type 11  51.79 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0911179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1001  methyltransferase type 11  38.36 
 
 		 237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0223  SAM-dependent methyltransferase  32.9 
 
 		 242 aa  112  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  36.97 
 
 		 225 aa  105  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3437  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 244 aa  101  9e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1806  hypothetical protein  33.8 
 
 		 228 aa  99.4  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.727626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1559  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 233 aa  96.3  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0523794  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1811  Methyltransferase type 11  37.06 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0639  Methyltransferase type 11  35.62 
 
 		 307 aa  93.2  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1612  Methyltransferase type 11  30.73 
 
 		 233 aa  92.4  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4050  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.35 
 
 		 261 aa  91.7  9e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2617  Methyltransferase type 11  31.8 
 
 		 228 aa  90.9  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3142  Methyltransferase type 11  29.2 
 
 		 248 aa  89.4  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1312  methyltransferase type 11  33.93 
 
 		 303 aa  87.8  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.117711  hitchhiker  0.0001856 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1820  Methyltransferase type 11  30.88 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  30.14 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1472  Methyltransferase type 11  32.59 
 
 		 242 aa  72  0.000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3273  Methyltransferase type 12  23.66 
 
 		 210 aa  71.6  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  30.32 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  42 
 
 		 155 aa  61.2  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  31.96 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5201  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.68 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0650  methyltransferase type 11  39.53 
 
 		 424 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.541697  normal  0.369974 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0110  methyltransferase type 11  28.83 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9102  hypothetical protein  35 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  28.65 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0165  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.92 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.119395  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  28.8 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  32.81 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  27.91 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  26.7 
 
 		 776 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  33.6 
 
 		 268 aa  57  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0252  hypothetical protein  26.35 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.56 
 
 		 271 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  32.28 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0258  hypothetical protein  26.35 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  27.33 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2089  putative methyltransferase  27.66 
 
 		 1014 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0627261  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1224  methyltransferase type 11  29.57 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.158383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  30 
 
 		 276 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2627  methyltransferase type 11  38.05 
 
 		 286 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.8455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  26.76 
 
 		 280 aa  54.7  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2318  methyltransferase type 11  27.67 
 
 		 349 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399773  normal  0.0108051 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  33.08 
 
 		 266 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1514  arsenite S-adenosylmethyltransferase  25.45 
 
 		 280 aa  54.7  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.732855  normal  0.394631 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  27.33 
 
 		 277 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2447  methyltransferase type 11  38.18 
 
 		 284 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.204404  normal  0.251404 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0744  Methyltransferase type 11  22.22 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0330334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1246  Methyltransferase type 11  28.83 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  27.88 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  32.09 
 
 		 261 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  30.16 
 
 		 301 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0673  methyltransferase type 11  35.54 
 
 		 253 aa  53.1  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  28.12 
 
 		 243 aa  53.5  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  29 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1466  Methyltransferase type 12  26.04 
 
 		 199 aa  53.5  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  34.91 
 
 		 270 aa  53.1  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 271 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  29.63 
 
 		 276 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  33.87 
 
 		 282 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  34.48 
 
 		 249 aa  52.8  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3308  methyltransferase type 11  29.56 
 
 		 239 aa  52.8  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.358181  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.92 
 
 		 250 aa  52.4  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0864  methyltransferase type 12  30.07 
 
 		 204 aa  52.4  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000143474  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  35.09 
 
 		 237 aa  52  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  26.62 
 
 		 266 aa  52.4  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3557  Methyltransferase type 11  29.78 
 
 		 369 aa  52.4  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  29.67 
 
 		 283 aa  52  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0668  Methyltransferase type 11  31.65 
 
 		 288 aa  52  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.85 
 
 		 235 aa  52  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  30.17 
 
 		 243 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  26.38 
 
 		 277 aa  52  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  30.17 
 
 		 243 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  36.72 
 
 		 267 aa  52  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  30.17 
 
 		 243 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  23.95 
 
 		 298 aa  52  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 293 aa  52  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1625  hypothetical protein  22.84 
 
 		 239 aa  52  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.207342 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3590  hypothetical protein  23.31 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.15692 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00700  conserved hypothetical protein  27.67 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  30 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  33.1 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  32.38 
 
 		 257 aa  51.2  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2550  methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 348 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00904798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1468  Methyltransferase type 11  31.71 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  38.32 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  24.57 
 
 		 270 aa  50.8  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0586  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.1 
 
 		 346 aa  50.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  31.93 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  33.1 
 
 		 239 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0972  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.5 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  31.68 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  26.75 
 
 		 268 aa  50.1  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>