More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1312 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1312  methyltransferase type 11  100 
 
 
303 aa  605  9.999999999999999e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.117711  hitchhiker  0.0001856 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0223  SAM-dependent methyltransferase  44.07 
 
 
242 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3142  Methyltransferase type 11  39.06 
 
 
248 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3437  Methyltransferase type 11  39.83 
 
 
244 aa  159  8e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1001  methyltransferase type 11  41.1 
 
 
237 aa  158  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1472  Methyltransferase type 11  33.19 
 
 
242 aa  153  4e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  40.17 
 
 
225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1577  methyltransferase type 11  34.62 
 
 
301 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0911179  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1612  Methyltransferase type 11  34.48 
 
 
233 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2617  Methyltransferase type 11  35.6 
 
 
228 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1806  hypothetical protein  34.23 
 
 
228 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.727626  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3542  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.73 
 
 
243 aa  96.3  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1559  Methyltransferase type 11  33.93 
 
 
233 aa  95.5  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0523794  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1811  Methyltransferase type 11  30.4 
 
 
235 aa  94.7  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4050  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.88 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0639  Methyltransferase type 11  32.9 
 
 
307 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3339  methyltransferase  33.33 
 
 
239 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3273  Methyltransferase type 12  26.46 
 
 
210 aa  82  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3376  hypothetical protein  31.71 
 
 
239 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3590  hypothetical protein  31.71 
 
 
239 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.15692 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3641  hypothetical protein  31.71 
 
 
239 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3290  methyltransferase  31.71 
 
 
239 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  28.95 
 
 
270 aa  77.8  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1625  hypothetical protein  30.89 
 
 
239 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.207342 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3600  hypothetical protein  30.08 
 
 
239 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3693  hypothetical protein  31.71 
 
 
239 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336986  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3269  methyltransferase type 11  31.71 
 
 
239 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.20677  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  30.28 
 
 
267 aa  75.1  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3607  hypothetical protein  29.27 
 
 
239 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  35.85 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2241  methyltransferase type 11  28.91 
 
 
239 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.602908  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.63 
 
 
271 aa  72.8  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  29.85 
 
 
263 aa  73.2  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.88 
 
 
205 aa  72.4  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  30.65 
 
 
202 aa  71.2  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  32.79 
 
 
301 aa  70.5  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4088  Methyltransferase type 11  43.75 
 
 
244 aa  70.5  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.75 
 
 
283 aa  69.3  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
254 aa  68.6  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3487  methyltransferase type 11  42.22 
 
 
253 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.703718  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.25 
 
 
276 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.17 
 
 
237 aa  68.9  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  30.47 
 
 
254 aa  68.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  27.57 
 
 
261 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5792  Methyltransferase type 11  37.39 
 
 
239 aa  67  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  35.05 
 
 
295 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1820  Methyltransferase type 11  37.76 
 
 
315 aa  67  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3639  Methyltransferase type 11  40.22 
 
 
253 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  40.4 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0258  hypothetical protein  24.64 
 
 
253 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0252  hypothetical protein  24.64 
 
 
253 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  29.17 
 
 
271 aa  64.3  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.46 
 
 
249 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0587723  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  29.06 
 
 
278 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0105  methyltransferase type 11  40.2 
 
 
247 aa  65.1  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1201  arsenite S-adenosylmethyltransferase  27.92 
 
 
270 aa  63.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  37.82 
 
 
244 aa  63.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  32.56 
 
 
282 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0744  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
248 aa  63.9  0.000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0330334  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  29.01 
 
 
252 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  38.32 
 
 
210 aa  63.5  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  32.77 
 
 
232 aa  63.2  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2269  methyltransferase type 11  31.69 
 
 
240 aa  62.8  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.541668  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  29.53 
 
 
262 aa  62.4  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.2 
 
 
305 aa  62.4  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.69 
 
 
252 aa  62.4  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.423276 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04625  arsenic methyltransferase Cyt19, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G15020)  28.24 
 
 
282 aa  62  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3215  methyltransferase type 11  29.85 
 
 
278 aa  62  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000307808 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  29.61 
 
 
271 aa  62  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  28.12 
 
 
266 aa  61.6  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  42 
 
 
257 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  34.58 
 
 
226 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3571  Methyltransferase type 11  41.46 
 
 
253 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.103382  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3346  Methyltransferase type 11  31.97 
 
 
265 aa  61.6  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.408224  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  34.95 
 
 
238 aa  61.2  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  33.64 
 
 
236 aa  60.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  33.64 
 
 
236 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0965  Methyltransferase type 11  35.25 
 
 
261 aa  60.8  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0162273  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 
240 aa  60.8  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0499  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 
264 aa  60.1  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000709402  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  25.96 
 
 
1000 aa  60.5  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  25 
 
 
206 aa  60.5  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  33.64 
 
 
236 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  33.64 
 
 
236 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  33.64 
 
 
236 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1246  Methyltransferase type 11  28.82 
 
 
288 aa  60.1  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  31.97 
 
 
265 aa  60.1  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1635  Methyltransferase type 11  39.29 
 
 
252 aa  60.1  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.977952  normal  0.0455749 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  36.28 
 
 
258 aa  59.7  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0601  Methyltransferase type 11  30 
 
 
268 aa  59.7  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0183  methyltransferase type 11  35.2 
 
 
223 aa  59.7  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0293588  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  33.64 
 
 
226 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  37.11 
 
 
305 aa  59.3  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.97 
 
 
280 aa  59.3  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.51 
 
 
215 aa  59.3  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0492  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  35.4 
 
 
232 aa  59.3  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2186  hypothetical protein  33.64 
 
 
199 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286296  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2106  hypothetical protein  33.64 
 
 
209 aa  58.9  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2013  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.53 
 
 
241 aa  58.9  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>