More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4088 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_4088  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 244 aa  504  9.999999999999999e-143  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4275  Methyltransferase type 11  34.75 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.18004 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  36.79 
 
 		 364 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  38.98 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  38.05 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1717  Methyltransferase type 11  36.43 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1312  methyltransferase type 11  43.75 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.117711  hitchhiker  0.0001856 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  35.4 
 
 		 243 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  35.4 
 
 		 243 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  35.4 
 
 		 243 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.29 
 
 		 236 aa  67  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  34.78 
 
 		 243 aa  67  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  36.44 
 
 		 239 aa  67  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  35.29 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  32.2 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  35.85 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  33.63 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  46.15 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 248 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  34.51 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  38.64 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  34.51 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  38.3 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  41.75 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16171  hypothetical protein  33.8 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.80652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  38 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  33.05 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3004  methionine biosynthesis protein MetW  38.52 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1633  Methyltransferase type 11  39.6 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0626  methyltransferase type 11  40.66 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00710227 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  37.76 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5792  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  35.4 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.87 
 
 		 345 aa  62.4  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.83 
 
 		 251 aa  62  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.83 
 
 		 251 aa  62  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.83 
 
 		 251 aa  62  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.83 
 
 		 251 aa  62  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 265 aa  62  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.83 
 
 		 251 aa  62  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.83 
 
 		 251 aa  62  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  36 
 
 		 325 aa  62  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  39.18 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  38.95 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  40.91 
 
 		 197 aa  61.6  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  38.52 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  39.56 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0400  methyltransferase type 11  35.78 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.555595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.56 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  40.2 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  33.08 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1635  Methyltransferase type 11  38.53 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.977952  normal  0.0455749 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  33.59 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0198  methyltransferase type 11  35.64 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0695927  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0744  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0330334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  26.11 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  35 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4099  methyltransferase type 11  35.87 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.86 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  35 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  41.24 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4175  methyltransferase type 11  35.87 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3437  Methyltransferase type 11  34.91 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4073  Methyltransferase type 11  34.69 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  37.11 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  36.89 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4330  methyltransferase type 11  35.56 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.510233  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  41.94 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0632  type 11 methyltransferase  35.79 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.186651 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  35.11 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0006  hypothetical protein  26.97 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.868865  normal  0.0557095 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  41.3 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  35.09 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  36.26 
 
 		 239 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  35 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  37.38 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  27.89 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.69 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  36.26 
 
 		 239 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.94 
 
 		 258 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0842  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.36 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3305  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  39.18 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  36.26 
 
 		 239 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  35.79 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  35.78 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1773  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.78 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  33.6 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  37 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  32.33 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.39 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0957  methyltransferase type 11  38.61 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  31.33 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>