More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0011 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  100 
 
 
289 aa  573  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  76.27 
 
 
243 aa  372  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  62.87 
 
 
243 aa  326  3e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  57.95 
 
 
255 aa  319  3e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  61.02 
 
 
237 aa  311  5.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  61.44 
 
 
237 aa  308  6.999999999999999e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  60.59 
 
 
241 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  58.9 
 
 
241 aa  301  7.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  59.32 
 
 
241 aa  301  8.000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  61.86 
 
 
237 aa  301  8.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  62.71 
 
 
239 aa  298  6e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  57.02 
 
 
243 aa  281  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  57.02 
 
 
243 aa  281  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  57.02 
 
 
243 aa  281  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  53.25 
 
 
249 aa  266  4e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  61.44 
 
 
251 aa  264  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  49.58 
 
 
238 aa  236  3e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  44.35 
 
 
240 aa  220  3e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  44.81 
 
 
238 aa  211  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  46.09 
 
 
240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  41.56 
 
 
239 aa  186  5e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  45.21 
 
 
222 aa  154  1e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6255  methyltransferase domain-containing protein  31.13 
 
 
257 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.88528  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6253  methyltransferase domain-containing protein  28.63 
 
 
276 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72050  hypothetical protein  31.38 
 
 
278 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.892313  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5676  hypothetical protein  29.54 
 
 
272 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  31.71 
 
 
293 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  30.57 
 
 
266 aa  81.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1761  methyltransferase type 11  35.71 
 
 
257 aa  75.1  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  44.57 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  39.47 
 
 
276 aa  72.4  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  31.74 
 
 
244 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5678  hypothetical protein  26.97 
 
 
294 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.622302  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4082  Methyltransferase type 11  34.59 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2646  Methyltransferase type 11  33.53 
 
 
248 aa  68.9  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.676764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  38.79 
 
 
271 aa  68.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72030  hypothetical protein  29.8 
 
 
287 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 
274 aa  68.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  26.89 
 
 
235 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0732  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.25 
 
 
277 aa  67  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.466565  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  39.62 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  42.06 
 
 
278 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  40 
 
 
710 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  39.83 
 
 
233 aa  66.2  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0957  methyltransferase type 11  34.55 
 
 
290 aa  65.1  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  42 
 
 
259 aa  65.1  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  40.37 
 
 
711 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  39.52 
 
 
265 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  29.17 
 
 
226 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2558  Methyltransferase type 11  32.81 
 
 
288 aa  64.7  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  35.9 
 
 
256 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  30.46 
 
 
293 aa  63.9  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  36.97 
 
 
241 aa  63.9  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4822  Methyltransferase type 11  37.98 
 
 
233 aa  63.5  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  38.26 
 
 
261 aa  63.5  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 
226 aa  63.5  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  39.09 
 
 
266 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3259  methyltransferase type 11  42.45 
 
 
244 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4421  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.07 
 
 
236 aa  63.5  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
225 aa  63.5  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2186  Methyltransferase type 11  34.95 
 
 
254 aa  63.2  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.62 
 
 
230 aa  63.2  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0147  Methyltransferase type 11  34.59 
 
 
240 aa  63.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3055  methyltransferase type 11  40 
 
 
258 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000014304  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4088  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 
244 aa  62.8  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  39.82 
 
 
281 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  28.33 
 
 
236 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  43.27 
 
 
251 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  34.73 
 
 
254 aa  62.8  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  34.73 
 
 
254 aa  62.8  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  43.27 
 
 
251 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  28.33 
 
 
236 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  28.33 
 
 
236 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  28.33 
 
 
236 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  29.2 
 
 
236 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1378  Methyltransferase type 11  32.5 
 
 
207 aa  61.6  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  28.33 
 
 
226 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  30.53 
 
 
253 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.34 
 
 
256 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
328 aa  62  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5881  methyltransferase type 11  33.97 
 
 
237 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  34.4 
 
 
279 aa  61.6  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23681  SAM-binding motif-containing protein  30.59 
 
 
304 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0592385 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  32.69 
 
 
250 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  36.61 
 
 
328 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  43.27 
 
 
251 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.97 
 
 
255 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  31.95 
 
 
222 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  39.64 
 
 
283 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  40.2 
 
 
282 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  35.09 
 
 
261 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  33.13 
 
 
250 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  35.34 
 
 
261 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20390  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  36.57 
 
 
245 aa  61.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.21 
 
 
256 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  27.5 
 
 
225 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.07 
 
 
258 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  43.27 
 
 
251 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  43.27 
 
 
251 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>