More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5676 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5676  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  563  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72050  hypothetical protein  80.41 
 
 		 278 aa  431  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.892313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6253  methyltransferase domain-containing protein  51.81 
 
 		 276 aa  295  4e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6255  methyltransferase domain-containing protein  52.59 
 
 		 257 aa  275  8e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.88528  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5678  hypothetical protein  46.79 
 
 		 294 aa  238  8e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.622302  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72030  hypothetical protein  42.55 
 
 		 287 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  27.54 
 
 		 237 aa  87  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  28.15 
 
 		 243 aa  86.7  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  26.38 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  25.96 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  26.05 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  28.26 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  28.88 
 
 		 289 aa  79  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  29.83 
 
 		 239 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  25 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  26.38 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  25.33 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  27.12 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  26.36 
 
 		 238 aa  68.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  26.47 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  27.42 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  28.37 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  24.79 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  27.33 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3711  Methyltransferase type 11  30.27 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  25.33 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  24.47 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  27.89 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  24.47 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  24.47 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  27.66 
 
 		 1106 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 		 711 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  27.18 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 710 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  26.06 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  30.41 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  31.79 
 
 		 222 aa  57  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3993  hypothetical protein  29.13 
 
 		 292 aa  57  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1869  methyltransferase type 11  27.61 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235933  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1068  methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 417 aa  57  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1915  methyltransferase type 11  27.61 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.107391  normal  0.797863 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  24.5 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13046  hypothetical protein  24.84 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0765338  hitchhiker  0.00655804 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2133  methyltransferase type 11  38.3 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.917807  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  27.06 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25.87 
 
 		 345 aa  55.8  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1324  methyltransferase type 11  23.84 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386033  hitchhiker  0.000000000822833 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 634 aa  55.8  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2175  Methyltransferase type 11  27.46 
 
 		 221 aa  55.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.300294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1955  methyltransferase type 11  26.62 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2589  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.17 
 
 		 262 aa  55.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  26.06 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  34.68 
 
 		 260 aa  54.7  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  26.19 
 
 		 2490 aa  53.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4556  methyltransferase type 11  28.47 
 
 		 253 aa  53.1  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  31.45 
 
 		 252 aa  53.1  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.73 
 
 		 282 aa  53.1  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  25.77 
 
 		 248 aa  52.8  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 194 aa  52.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  29.05 
 
 		 259 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  27.41 
 
 		 312 aa  52.4  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2267  Methyltransferase type 11  26.8 
 
 		 208 aa  52.4  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  21.62 
 
 		 213 aa  52.4  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0732  methyltransferase type 11  30.18 
 
 		 237 aa  52  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  24.72 
 
 		 286 aa  52  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  21.94 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 		 284 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  21.94 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  29.22 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  22.76 
 
 		 226 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  22.97 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  34 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  22.01 
 
 		 283 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  29 
 
 		 305 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3206  Methyltransferase type 11  27.44 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.457665  normal  0.153588 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  25.47 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3989  Methyltransferase type 11  35 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169635  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  26.76 
 
 		 330 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  26.56 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0603  methyltransferase type 11  27.83 
 
 		 288 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000027512  unclonable  0.00000842033 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.23 
 
 		 236 aa  50.8  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3067  methyltransferase type 11  27.4 
 
 		 369 aa  50.8  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 239 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4065  methyltransferase type 11  22.86 
 
 		 295 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.991618  normal  0.0815821 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1216  methyltransferase type 11  37.14 
 
 		 510 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.218616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1601  Methyltransferase type 11  31.68 
 
 		 212 aa  50.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.624379  normal  0.990626 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  30.48 
 
 		 261 aa  50.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.1 
 
 		 236 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  23.32 
 
 		 266 aa  50.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  29.06 
 
 		 265 aa  50.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0673  methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 253 aa  50.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  29.73 
 
 		 312 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>