More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2493 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  100 
 
 		 238 aa  493  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  53.56 
 
 		 239 aa  270  1e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  50.85 
 
 		 240 aa  237  1e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  49.17 
 
 		 255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  48.52 
 
 		 238 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  45.42 
 
 		 241 aa  228  7e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  48.74 
 
 		 251 aa  227  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  47.48 
 
 		 237 aa  226  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  44.12 
 
 		 241 aa  225  6e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  45.15 
 
 		 241 aa  219  3.9999999999999997e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  45.57 
 
 		 240 aa  214  9e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  44.35 
 
 		 237 aa  213  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  47.08 
 
 		 243 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  47.08 
 
 		 243 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  47.08 
 
 		 243 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  44.54 
 
 		 237 aa  212  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  43.78 
 
 		 249 aa  209  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  44.77 
 
 		 289 aa  209  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  42.37 
 
 		 243 aa  208  5e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  43.22 
 
 		 243 aa  199  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  41.53 
 
 		 239 aa  195  6e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  41.03 
 
 		 222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  40.34 
 
 		 293 aa  85.9  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  42.02 
 
 		 710 aa  78.6  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  34.86 
 
 		 711 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72050  hypothetical protein  26.87 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.892313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0962  methyltransferase type 11  30.91 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  30.51 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  37.61 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.7 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  26.25 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  36.13 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  34.4 
 
 		 392 aa  68.6  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12118  Glycosyltransferase  40.21 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0860161  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01614  S-adenosyl-methionine-sterol-C-methyltransferas (AFU_orthologue; AFUA_4G09190)  36.29 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.787149  normal  0.132042 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  36.21 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  32.11 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  27.4 
 
 		 377 aa  66.2  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.04 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.61 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3215  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  31.15 
 
 		 320 aa  65.5  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.409549  normal  0.479491 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.92 
 
 		 272 aa  65.5  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 282 aa  65.1  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6255  methyltransferase domain-containing protein  28.29 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.88528  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6253  methyltransferase domain-containing protein  27.88 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  34.58 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  32.56 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  33.11 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0147  Methyltransferase type 11  38.32 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  31.19 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  35.71 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  35.04 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5676  hypothetical protein  26.67 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  32.56 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 382 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  33.33 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  33.91 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.96 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  35.4 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  29.23 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  32.46 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  27.81 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  31.01 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  29.23 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  31.3 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  34.58 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72030  hypothetical protein  30.52 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  29.87 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0058  Methyltransferase type 11  39.67 
 
 		 354 aa  62.4  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.57 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0008  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.65 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.257422  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  27.12 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  36.84 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 271 aa  62  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  31.65 
 
 		 270 aa  62  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 270 aa  62  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  32.09 
 
 		 261 aa  62  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  34.21 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.58 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  29.36 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5678  hypothetical protein  29.22 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.622302  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1107  Methyltransferase type 11  33.57 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000024233 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3751  Methyltransferase type 11  35.07 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1103  methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292057  hitchhiker  0.000229506 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1272  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.11 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19461  SAM-binding motif-containing protein  34.51 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0603  methyltransferase type 11  29.07 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000027512  unclonable  0.00000842033 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  27.06 
 
 		 634 aa  60.8  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  30.08 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  38.4 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  25.97 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  33.07 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  33.62 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>